MamRep1527|LTR|LTR-HOMER50 chr1 42370 42504 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER6697 chr1 4756275 4756378 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER7049 chr1 4987925 4988423 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER22259 chr1 12113060 12113310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER22261 chr1 12113479 12113834 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER22263 chr1 12113973 12114022 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER26996 chr1 14611409 14611542 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER26998 chr1 14611788 14612113 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER35793 chr1 18364862 18365170 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER76183 chr1 34491575 34491628 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER76185 chr1 34491906 34492100 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER76186 chr1 34492137 34492255 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER76456 chr1 34622038 34622330 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER76808 chr1 34796372 34796532 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER76809 chr1 34796563 34796859 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER77536 chr1 35155909 35156025 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER82544 chr1 37191176 37191389 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER82552 chr1 37192743 37193217 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER88183 chr1 39705383 39705541 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER94514 chr1 42409395 42409529 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER94516 chr1 42409974 42410116 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER94522 chr1 42416491 42416630 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER97150 chr1 43609857 43610044 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER109655 chr1 49406427 49406540 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER109658 chr1 49407730 49407858 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112707 chr1 50961838 50961970 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112733 chr1 50970737 50970954 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER114200 chr1 51635578 51635741 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER126396 chr1 56663537 56663729 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER126398 chr1 56663888 56664139 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER128056 chr1 57404707 57405482 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER128255 chr1 57508469 57508500 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER128257 chr1 57508551 57508904 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER128261 chr1 57510035 57510532 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER135026 chr1 60617427 60617490 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER135556 chr1 60887952 60888155 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER142373 chr1 64142484 64142603 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER142467 chr1 64178530 64179428 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER146638 chr1 66170607 66170801 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER146837 chr1 66285889 66285997 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER154297 chr1 70290102 70290204 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER156712 chr1 71669389 71669647 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER158223 chr1 72605606 72605890 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER160711 chr1 74201991 74202106 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER163093 chr1 75697574 75697668 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER163094 chr1 75697947 75698093 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER165026 chr1 76783240 76783379 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER165905 chr1 77300445 77300705 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER166646 chr1 77753934 77754157 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER169918 chr1 79551163 79551307 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER172472 chr1 81108311 81108479 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER172821 chr1 81348227 81348529 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER175165 chr1 82837213 82837529 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER175660 chr1 83133815 83133866 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER175663 chr1 83134845 83135287 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER176965 chr1 83957701 83957838 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER178276 chr1 84744390 84744515 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER179160 chr1 85229491 85229688 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER181735 chr1 86664620 86665018 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER185249 chr1 88800049 88800344 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER186260 chr1 89374951 89375044 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER186435 chr1 89467173 89467380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER199660 chr1 96683029 96683417 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER203173 chr1 98855908 98856004 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER204609 chr1 99659666 99659782 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER207269 chr1 100988765 100988875 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER207270 chr1 100988891 100989346 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER216758 chr1 106777732 106777789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER218399 chr1 107790125 107790653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER218400 chr1 107790959 107791109 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER220406 chr1 109074134 109074735 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER220407 chr1 109074805 109074970 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER229462 chr1 113771023 113771491 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER229480 chr1 113780221 113780562 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER229482 chr1 113780624 113780923 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER229626 chr1 113863949 113864237 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER240426 chr1 119840125 119840296 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER240428 chr1 119840618 119840964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER240430 chr1 119841123 119841489 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER241114 chr1 120321311 120321361 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER241116 chr1 120321659 120321700 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER241990 chr1 120886443 120886493 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER241992 chr1 120886806 120887002 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER241994 chr1 120887283 120887544 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245044 chr1 144554548 144554692 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245049 chr1 144555349 144555575 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245050 chr1 144555600 144555724 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER246852 chr1 145676020 145676098 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER246853 chr1 145676253 145676495 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER246868 chr1 145680923 145681064 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER246870 chr1 145681353 145681562 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER248315 chr1 146711298 146711368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250935 chr1 148514162 148514306 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250939 chr1 148514963 148515189 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250940 chr1 148515214 148515338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252353 chr1 149418288 149419026 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252355 chr1 149419338 149419388 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER253731 chr1 150152768 150152969 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER273683 chr1 160399867 160400722 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER277796 chr1 162506354 162506775 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER277798 chr1 162507069 162507165 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER279254 chr1 163288752 163288938 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER279255 chr1 163288987 163289094 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER281556 chr1 164717344 164717479 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER281557 chr1 164717762 164717896 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER281842 chr1 164905889 164906038 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER283009 chr1 165556057 165556334 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER283874 chr1 165959830 165959935 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER284068 chr1 166079765 166079899 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER284727 chr1 166480841 166480984 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER284729 chr1 166481195 166481347 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER284731 chr1 166481558 166481939 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER285731 chr1 167100495 167100531 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER285733 chr1 167100936 167101060 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER285735 chr1 167101355 167101442 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287568 chr1 168046291 168046398 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287569 chr1 168046472 168046957 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER292363 chr1 170851426 170852004 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER295274 chr1 172512443 172512793 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER295275 chr1 172513093 172513274 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER295333 chr1 172552373 172552499 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER295941 chr1 172923033 172923633 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER299239 chr1 174703925 174704092 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER299241 chr1 174704414 174704498 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER300491 chr1 175397997 175398105 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER300938 chr1 175695586 175695790 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER300939 chr1 175695926 175696420 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER303806 chr1 177391202 177391266 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER310929 chr1 181185503 181185641 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER315656 chr1 183784490 183784585 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER315658 chr1 183785358 183785491 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER317086 chr1 184612946 184613177 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER319377 chr1 185866924 185867030 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER319378 chr1 185867548 185868105 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER319383 chr1 185868725 185868902 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER319601 chr1 186010962 186011767 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER321538 chr1 187171679 187171847 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER322002 chr1 187457051 187457286 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER322003 chr1 187457355 187457485 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER328560 chr1 191428108 191428235 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER342056 chr1 199625841 199625923 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER344179 chr1 200605014 200605220 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER345264 chr1 201151459 201151625 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER355108 chr1 206185615 206185668 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER355110 chr1 206185978 206186716 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER368605 chr1 213646383 213646727 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER368606 chr1 213646906 213646987 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER373687 chr1 216951090 216951148 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER373689 chr1 216951843 216952112 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER380058 chr1 220674148 220674362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER380074 chr1 220682802 220682870 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER382943 chr1 222397349 222397466 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER384347 chr1 223188736 223188881 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER385104 chr1 223627891 223628167 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER386216 chr1 224230600 224230719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER386226 chr1 224233929 224234037 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER393253 chr1 227659891 227660051 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER396670 chr1 229641232 229641316 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER400791 chr1 231802621 231802746 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER401240 chr1 232062599 232062767 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER402593 chr1 232949730 232949781 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER403699 chr1 233577735 233577870 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER411342 chr1 237398317 237398511 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER411343 chr1 237398580 237399212 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER412462 chr1 238059717 238060158 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER413070 chr1 238413937 238414224 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER421634 chr1 243041666 243041803 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER421635 chr1 243041938 243042224 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER423081 chr1 243819450 243819567 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER435280 chr10 1886935 1886996 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER436870 chr10 2916440 2916640 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER447548 chr10 9093990 9094107 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER459145 chr10 15222756 15222841 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER459168 chr10 15230851 15230965 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER459334 chr10 15318986 15319091 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER460697 chr10 16073690 16074060 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER465023 chr10 18391285 18391436 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER465025 chr10 18391969 18392271 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER465776 chr10 18768263 18768420 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER466458 chr10 19123793 19124270 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER466464 chr10 19125547 19125591 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER466466 chr10 19125895 19126111 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER466955 chr10 19399661 19400102 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER468435 chr10 20241395 20241505 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER470896 chr10 21665833 21665986 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER470898 chr10 21666295 21666455 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER472307 chr10 22284328 22284681 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER475591 chr10 24042525 24042702 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER479249 chr10 26015007 26015274 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER479257 chr10 26017856 26017894 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER479259 chr10 26018122 26018185 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER485851 chr10 29341198 29341285 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER486538 chr10 29686331 29686544 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER489042 chr10 30867889 30868019 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER489044 chr10 30868184 30868687 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER491944 chr10 32455629 32455745 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER492486 chr10 32682839 32682984 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER492487 chr10 32682979 32683188 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER494024 chr10 33650250 33650401 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER498088 chr10 35831564 35831881 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER498093 chr10 35833814 35833958 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER511670 chr10 46994812 46995252 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER514087 chr10 48637730 48637839 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER514088 chr10 48637968 48638038 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER516213 chr10 49957894 49958131 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER517017 chr10 50483940 50484340 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER517018 chr10 50484438 50484545 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER517487 chr10 50801895 50802044 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER520024 chr10 52231434 52231513 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER524758 chr10 55124814 55124988 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER529486 chr10 58065752 58066117 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER529489 chr10 58066547 58066835 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER531128 chr10 59071674 59071867 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER531360 chr10 59222458 59222683 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER531362 chr10 59223345 59223568 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER536163 chr10 62072989 62073079 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER537361 chr10 62776149 62776318 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER537577 chr10 62906869 62907693 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER543472 chr10 66096270 66097013 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER546716 chr10 67982591 67982781 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER547721 chr10 68593585 68593933 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER548633 chr10 69190902 69191138 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER548635 chr10 69191338 69191549 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER549160 chr10 69535341 69535452 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER554569 chr10 71756309 71756474 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER569346 chr10 78967797 78967999 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER573608 chr10 81082705 81082914 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER576169 chr10 82413820 82414009 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER578193 chr10 83643996 83644153 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER578196 chr10 83644835 83645403 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER578930 chr10 84096198 84096251 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER580593 chr10 85106049 85106434 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER580631 chr10 85124557 85124834 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER581725 chr10 85770180 85770466 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER581821 chr10 85816846 85816901 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER581823 chr10 85817438 85817599 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER582024 chr10 85924834 85924972 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER582025 chr10 85925418 85925623 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER583608 chr10 86866567 86867462 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER583908 chr10 87064921 87065391 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER584629 chr10 87536904 87536960 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER588623 chr10 89608640 89608860 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER588624 chr10 89609083 89609198 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER588887 chr10 89764339 89764446 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER590601 chr10 90731270 90731383 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER590602 chr10 90731533 90731669 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER590604 chr10 90731964 90732153 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591272 chr10 91102046 91102260 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591273 chr10 91102322 91102627 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591370 chr10 91151758 91151915 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER592105 chr10 91521562 91521658 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER595338 chr10 93386472 93386851 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER596996 chr10 94149722 94149898 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER600814 chr10 95813542 95813646 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER600965 chr10 95889902 95890043 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER600968 chr10 95890979 95891067 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER603957 chr10 97558357 97558497 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER604350 chr10 97762966 97763174 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER605739 chr10 98482383 98482471 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER605740 chr10 98482651 98482941 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER608278 chr10 99544069 99544266 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER608822 chr10 99802708 99802938 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER616784 chr10 103794055 103794111 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER616786 chr10 103794419 103794500 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER619409 chr10 104964458 104964582 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER619411 chr10 104964790 104965197 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER619420 chr10 104973422 104973658 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER619422 chr10 104974137 104974156 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER624426 chr10 107617864 107618192 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER624470 chr10 107641566 107641708 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER624898 chr10 107918969 107919326 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER624900 chr10 107919434 107919652 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER626285 chr10 108697998 108698691 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER630677 chr10 111399953 111400062 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER633821 chr10 113122903 113123048 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER641697 chr10 117536322 117536385 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER646673 chr10 120363050 120363184 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER651920 chr10 123026767 123026893 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER651922 chr10 123027280 123027362 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER652201 chr10 123179466 123179636 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER652394 chr10 123307429 123307593 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER654284 chr10 124238542 124238693 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER655809 chr10 125202415 125202811 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER660695 chr10 128096041 128096127 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER662170 chr10 129236450 129236554 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER664076 chr10 130577082 130577449 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER664696 chr10 131073757 131073936 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER665746 chr10 131979803 131979948 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER677582 chr11 4600250 4600400 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER679003 chr11 5578864 5579129 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER683612 chr11 8438182 8438796 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER683613 chr11 8438810 8438945 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER689906 chr11 11517741 11517862 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER691617 chr11 12482880 12483712 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER694145 chr11 13913317 13913450 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER697062 chr11 15462452 15462602 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER697737 chr11 15805937 15806822 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER697739 chr11 15806852 15806887 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER697766 chr11 15821361 15821543 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER697767 chr11 15821613 15822107 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698062 chr11 15965777 15965898 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698064 chr11 15966095 15966369 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698066 chr11 15966997 15967259 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER705751 chr11 20038021 20038116 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER705753 chr11 20038586 20038666 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER707883 chr11 21170718 21170828 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER707886 chr11 21171767 21172008 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER707890 chr11 21172772 21172959 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER709379 chr11 22011561 22011756 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER709381 chr11 22012172 22012484 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER709384 chr11 22014013 22014075 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER709732 chr11 22209204 22209612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER709734 chr11 22210258 22210408 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER710230 chr11 22482475 22482905 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER710468 chr11 22606599 22606800 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER710914 chr11 22899522 22899601 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER716149 chr11 26007295 26007408 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER720315 chr11 28372464 28372661 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER720538 chr11 28520803 28521698 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER722129 chr11 29417813 29418294 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER722641 chr11 29709805 29710342 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER722643 chr11 29710412 29710479 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER722645 chr11 29710759 29710909 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER723245 chr11 30097590 30097866 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER725157 chr11 31176160 31176282 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER725158 chr11 31176621 31176790 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER735751 chr11 36736222 36736710 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER735753 chr11 36737015 36737115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER735755 chr11 36737306 36737387 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER735899 chr11 36804653 36804707 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER742663 chr11 40851867 40852097 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER742664 chr11 40852775 40852905 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER744524 chr11 41900381 41900576 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER745871 chr11 42654580 42654722 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER747078 chr11 43307176 43307349 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER759560 chr11 49532419 49532785 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER763822 chr11 56581324 56581483 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER767938 chr11 58670031 58670216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER767939 chr11 58670490 58670810 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768038 chr11 58732757 58732893 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768039 chr11 58733158 58733481 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768164 chr11 58827612 58827772 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768165 chr11 58828072 58828392 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768226 chr11 58871400 58871559 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768227 chr11 58871846 58872174 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768281 chr11 58901667 58901748 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768283 chr11 58902621 58903029 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768557 chr11 59076035 59076295 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER768558 chr11 59076337 59076468 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER789219 chr11 68718196 68718287 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER792691 chr11 70542549 70542632 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER793530 chr11 70998282 70998711 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER793881 chr11 71168176 71168454 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER800198 chr11 73983187 73983255 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER800200 chr11 73983288 73984014 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER807057 chr11 77016152 77016283 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER807059 chr11 77016646 77016927 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER807061 chr11 77017292 77017494 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER807968 chr11 77369524 77369579 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER812881 chr11 79540041 79540232 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER813065 chr11 79631745 79631847 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER818138 chr11 82350370 82350666 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER818141 chr11 82351523 82351869 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER819444 chr11 82964356 82964515 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER821527 chr11 84070520 84070698 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER823705 chr11 85294552 85294622 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER828081 chr11 87602007 87602372 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER829573 chr11 88491313 88491357 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER830190 chr11 88846779 88847175 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER834899 chr11 91665957 91666098 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER835274 chr11 91900756 91900948 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER835275 chr11 91900968 91901263 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER840478 chr11 94874451 94874621 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER842933 chr11 96535544 96535646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER842934 chr11 96535737 96535795 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER843989 chr11 97273391 97273569 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER848711 chr11 100214888 100214998 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER848715 chr11 100216515 100216591 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER849089 chr11 100459284 100459496 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER852469 chr11 102365578 102366276 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER852867 chr11 102571428 102571508 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER852869 chr11 102572274 102573003 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER853162 chr11 102756120 102756611 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER854030 chr11 103236837 103237006 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER855325 chr11 104014534 104014742 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER855626 chr11 104184632 104184787 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER855627 chr11 104184826 104185093 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER858183 chr11 105714180 105714412 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER859838 chr11 106719654 106719755 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER859841 chr11 106720250 106720362 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER860550 chr11 107157110 107157329 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER865182 chr11 109470977 109471179 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER865605 chr11 109733947 109734185 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER866338 chr11 110130125 110130206 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER866503 chr11 110196662 110196793 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER867458 chr11 110708581 110708800 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER867460 chr11 110709027 110709075 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER871788 chr11 113121868 113122042 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER897269 chr11 126752336 126753008 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER898278 chr11 127393416 127394169 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER898340 chr11 127434049 127434375 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER898341 chr11 127434413 127434566 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER899140 chr11 127927928 127928112 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER900251 chr11 128690164 128690468 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER905572 chr11 131822543 131823303 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER905720 chr11 131913113 131913854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER905722 chr11 131914035 131914060 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER907042 chr11 132871132 132872067 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER907067 chr11 132886753 132886803 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER907071 chr11 132887648 132888149 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER907829 chr11 133427427 133427638 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER907831 chr11 133428005 133428239 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER907969 chr11 133521941 133522179 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER907970 chr11 133522348 133522446 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER917197 chr12 3761436 3761547 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER917212 chr12 3770058 3770770 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER918303 chr12 4307400 4307579 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER924859 chr12 7879845 7879915 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER924861 chr12 7880233 7880362 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927559 chr12 9056558 9056667 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927561 chr12 9057083 9057243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927584 chr12 9062820 9063022 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER930387 chr12 10729250 10729354 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER934401 chr12 12944911 12945372 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER935253 chr12 13344052 13344117 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER940030 chr12 16154858 16154915 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER943649 chr12 18459214 18459383 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER943650 chr12 18459402 18459592 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER950798 chr12 22745133 22745245 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER965386 chr12 31366163 31366302 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER965388 chr12 31366604 31366845 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER966275 chr12 31754349 31754401 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER966277 chr12 31754730 31754761 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER966285 chr12 31756677 31756922 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER974174 chr12 39680797 39680900 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER977214 chr12 41613532 41613666 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER986577 chr12 47095033 47095796 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER989177 chr12 48611912 48612265 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1010329 chr12 59166658 59166772 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1010331 chr12 59167152 59167235 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1014488 chr12 61819652 61819793 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1014490 chr12 61819973 61820154 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1014510 chr12 61833039 61833712 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1014796 chr12 61990184 61990304 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1015626 chr12 62510973 62511087 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1015627 chr12 62511196 62511297 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1016555 chr12 63012757 63013022 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1018175 chr12 63950731 63950967 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1018512 chr12 64145361 64145597 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1020205 chr12 64947176 64947295 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1024084 chr12 67045759 67045861 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1024688 chr12 67380669 67380749 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1025337 chr12 67724579 67724654 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1026319 chr12 68304309 68304415 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1030472 chr12 70342397 70342549 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1033722 chr12 72189348 72189430 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1035904 chr12 73532766 73532912 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1037336 chr12 74420656 74420849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1037542 chr12 74554121 74554344 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039272 chr12 75653805 75654354 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1039958 chr12 76051684 76051732 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1040338 chr12 76256945 76257255 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1042886 chr12 77464178 77464565 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1049156 chr12 81267732 81267823 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1049523 chr12 81449184 81449328 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1050805 chr12 82266430 82266611 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1050806 chr12 82266692 82267017 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1052945 chr12 83550609 83550912 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1056293 chr12 85619972 85620224 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1056298 chr12 85622088 85622201 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1056299 chr12 85622312 85622509 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1064453 chr12 90444407 90444568 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1065524 chr12 91035941 91036615 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1066581 chr12 91670318 91670417 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1069485 chr12 93263153 93263237 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1069487 chr12 93263559 93263661 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1072720 chr12 94688172 94688234 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1086272 chr12 101418441 101418511 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1088466 chr12 102415634 102415755 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1088784 chr12 102605400 102605470 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1088785 chr12 102605744 102605808 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1088790 chr12 102606913 102607230 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1090860 chr12 103751168 103751622 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1091856 chr12 104273897 104274107 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1094489 chr12 105453851 105453985 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1095506 chr12 105969715 105969780 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1095839 chr12 106131079 106131376 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1098600 chr12 107452661 107452738 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1128297 chr12 119180704 119181087 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1134050 chr12 121429723 121429797 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1145204 chr12 125808664 125808733 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1145207 chr12 125810066 125810136 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1150947 chr12 128787678 128787886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1150948 chr12 128787905 128788198 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1153207 chr12 129855063 129855136 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1153219 chr12 129857581 129857717 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1159365 chr12 133429657 133429781 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1166427 chr13 21988213 21988344 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1166568 chr13 22048828 22048994 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1166570 chr13 22049291 22049687 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1168506 chr13 23263819 23263870 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1169843 chr13 24010099 24010243 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1169845 chr13 24010821 24010943 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1171920 chr13 25270063 25270170 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1182163 chr13 30899104 30899206 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1182167 chr13 30901274 30901819 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1189918 chr13 35199588 35199858 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1193613 chr13 37411148 37411233 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1194251 chr13 37761807 37761910 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1203984 chr13 43359211 43359348 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1204106 chr13 43427560 43427633 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1204763 chr13 43767618 43767687 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1204766 chr13 43768705 43768900 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1204849 chr13 43827719 43827852 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1204850 chr13 43828085 43828425 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1205556 chr13 44328989 44329129 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1209360 chr13 46187844 46187961 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1211444 chr13 47374883 47375213 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1214007 chr13 48849019 48849106 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1214009 chr13 48849772 48849928 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1218109 chr13 50942438 50942655 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1218116 chr13 50945048 50945148 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1218429 chr13 51136592 51136912 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1220037 chr13 52092550 52092635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1224460 chr13 54732654 54732973 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1224738 chr13 54935770 54936020 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1225091 chr13 55141712 55141848 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1230239 chr13 58338412 58338600 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1231440 chr13 59115649 59115992 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1233744 chr13 60540874 60540964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1233745 chr13 60541055 60541188 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1233747 chr13 60541509 60541565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1235183 chr13 61363094 61363689 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1235185 chr13 61363825 61363994 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1239880 chr13 64194070 64194223 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1243647 chr13 66521136 66521221 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1244309 chr13 66948828 66948960 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1258240 chr13 75434177 75434329 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1259974 chr13 76452828 76452887 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1259975 chr13 76452955 76453084 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1259977 chr13 76453389 76453450 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1260616 chr13 76860365 76860692 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1260895 chr13 77020534 77020828 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1263602 chr13 78626744 78626838 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1265073 chr13 79557773 79557884 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1266539 chr13 80446762 80446997 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1266875 chr13 80694362 80694525 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1266877 chr13 80694909 80694975 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1269365 chr13 82208009 82208099 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1269367 chr13 82208543 82208712 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1269368 chr13 82208801 82208982 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1269828 chr13 82495537 82495684 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1280077 chr13 88769694 88770118 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1280079 chr13 88770432 88770593 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1283205 chr13 90567957 90568193 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1284022 chr13 91069198 91069329 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1284721 chr13 91511158 91511760 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1285233 chr13 91822544 91822695 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1285235 chr13 91822806 91823206 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1287474 chr13 93206030 93206110 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1288069 chr13 93603268 93603347 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1289202 chr13 94319503 94319555 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1290623 chr13 95217070 95217260 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1293271 chr13 96545212 96545307 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1294982 chr13 97602512 97602585 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1295565 chr13 97941731 97941867 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1296014 chr13 98211586 98211759 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1303445 chr13 102158047 102158374 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1304508 chr13 102871852 102871975 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1306175 chr13 103897473 103897836 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1306702 chr13 104232392 104232549 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1309154 chr13 105830582 105830791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1310378 chr13 106614647 106614760 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1310404 chr13 106635339 106635417 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1310406 chr13 106635550 106635621 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1310927 chr13 106968723 106969022 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311013 chr13 107026028 107026135 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311015 chr13 107026614 107026736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1328475 chr14 22911466 22911694 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1328476 chr14 22911722 22912069 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1333749 chr14 26031511 26031537 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1333751 chr14 26031565 26031806 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1333753 chr14 26032251 26032593 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1334269 chr14 26373517 26373726 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1334589 chr14 26600652 26600773 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1342022 chr14 31321351 31321423 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1342024 chr14 31321721 31321959 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1344021 chr14 32203968 32204170 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1344023 chr14 32204467 32204606 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1344156 chr14 32275497 32275661 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1344263 chr14 32352786 32353571 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1345744 chr14 33253468 33253565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347194 chr14 34380939 34381646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347198 chr14 34382841 34382929 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347338 chr14 34456692 34456779 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347339 chr14 34456803 34456828 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347341 chr14 34457037 34457248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1347343 chr14 34457408 34457607 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1348982 chr14 35157645 35157767 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1350804 chr14 35902110 35902230 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1356178 chr14 39135082 39135767 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1358028 chr14 40152040 40152397 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1358029 chr14 40152438 40152873 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1359910 chr14 41382850 41382953 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1363523 chr14 43648606 43648788 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1367623 chr14 46166862 46167095 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1367624 chr14 46167292 46167388 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1368724 chr14 46880995 46881315 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1369942 chr14 47637291 47637392 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1370173 chr14 47772040 47772078 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1376179 chr14 51135855 51135952 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1376197 chr14 51144634 51144741 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1379342 chr14 52992488 52992498 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1379344 chr14 52992814 52992954 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1383109 chr14 55104534 55104670 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1395265 chr14 62049234 62049595 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1397554 chr14 63454693 63454881 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1404371 chr14 66789723 66789762 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1405251 chr14 67332489 67332596 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1411715 chr14 70680512 70680659 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1411867 chr14 70754994 70755091 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1412615 chr14 71153988 71154446 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1412616 chr14 71154499 71154599 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1412622 chr14 71155834 71155971 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1430310 chr14 79497905 79498156 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1430885 chr14 79872101 79872184 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1433969 chr14 81758247 81758509 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1433970 chr14 81758523 81758708 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1433972 chr14 81759100 81759227 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1441744 chr14 86366957 86367430 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1445379 chr14 88532765 88532913 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1445380 chr14 88533106 88533349 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1445491 chr14 88595448 88595543 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1454932 chr14 93129046 93129178 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1455980 chr14 93609008 93609116 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1458579 chr14 94866686 94866893 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1458580 chr14 94866913 94867102 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1458583 chr14 94867930 94868032 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1464207 chr14 97515371 97515620 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1464208 chr14 97515747 97515864 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1466025 chr14 98501336 98501474 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1483247 chr15 20577423 20577588 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1495053 chr15 28088130 28088739 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1507625 chr15 35320069 35320157 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1508837 chr15 36105440 36105564 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1513858 chr15 39383018 39383070 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1513860 chr15 39383366 39383552 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1514007 chr15 39485473 39485627 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1514106 chr15 39552078 39552260 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1536854 chr15 51375364 51375416 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1540697 chr15 53447773 53447887 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1541920 chr15 54160460 54160907 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1542883 chr15 54800193 54800297 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1544910 chr15 55937743 55937935 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1545164 chr15 56060852 56060939 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1549718 chr15 58599897 58600154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1556641 chr15 62230115 62230796 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1575824 chr15 71288169 71288279 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1575825 chr15 71288330 71288455 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1577212 chr15 72034118 72034237 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1577213 chr15 72034893 72035111 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1577215 chr15 72035410 72035773 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1577835 chr15 72326871 72326950 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1592340 chr15 79415512 79415680 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1592892 chr15 79669180 79669597 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1593363 chr15 79933134 79933191 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1594870 chr15 80651884 80652185 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1595539 chr15 81020944 81021095 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1596164 chr15 81342334 81342493 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1597025 chr15 81765434 81765879 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1597996 chr15 82278871 82278927 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1598067 chr15 82322908 82323236 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1600455 chr15 83651189 83651285 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1606239 chr15 86673164 86673225 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1613562 chr15 90552119 90552291 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1617158 chr15 92142272 92142380 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1617427 chr15 92275714 92276355 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1617429 chr15 92276402 92276446 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1617599 chr15 92358969 92359128 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1618388 chr15 92832254 92832906 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1621522 chr15 94457945 94458624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1621613 chr15 94508688 94509135 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623482 chr15 95649988 95650115 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1624273 chr15 96113902 96113977 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1625667 chr15 97035801 97035909 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1627421 chr15 98191723 98191846 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1628051 chr15 98567482 98567875 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1628052 chr15 98567897 98568016 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1631077 chr15 100311152 100311242 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1634527 chr15 102488662 102488796 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1645029 chr16 5464257 5464457 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1645030 chr16 5464612 5464738 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1645035 chr16 5465822 5465949 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1645397 chr16 5614941 5615234 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1650470 chr16 8046831 8047600 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1650739 chr16 8172869 8173472 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1650769 chr16 8185857 8186228 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1656886 chr16 10651269 10651549 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1662604 chr16 12920199 12920298 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1662609 chr16 12921501 12921735 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1663954 chr16 13442808 13442972 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1663955 chr16 13443174 13443446 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1663957 chr16 13443639 13443799 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664658 chr16 13723636 13723858 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664660 chr16 13724131 13724325 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664661 chr16 13724545 13724770 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1672793 chr16 16852253 16852496 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1677063 chr16 18611919 18612162 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1685446 chr16 21805885 21806415 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1687431 chr16 22622321 22622852 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1688835 chr16 23212618 23212813 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1690014 chr16 23610301 23610486 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1690880 chr16 23910408 23910892 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1691513 chr16 24159806 24159877 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1695217 chr16 25487188 25487388 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1695238 chr16 25493286 25493468 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1696471 chr16 26023169 26023895 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1696508 chr16 26036284 26036554 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1696510 chr16 26036635 26037054 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1696513 chr16 26037537 26037621 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1696515 chr16 26038183 26038279 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1716517 chr16 46672211 46672342 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1718208 chr16 47442326 47442495 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1718497 chr16 47633166 47633256 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1718498 chr16 47633762 47633856 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1719204 chr16 48040232 48040366 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1719206 chr16 48040794 48041212 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1719208 chr16 48041286 48041586 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1719331 chr16 48104314 48104506 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1720300 chr16 48520354 48520462 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1721331 chr16 48997197 48997991 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726523 chr16 51467598 51467768 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1729935 chr16 53188047 53188143 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1731770 chr16 54154623 54154891 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1735299 chr16 55870189 55870414 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1742742 chr16 59230986 59231792 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1742976 chr16 59358393 59358469 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1743047 chr16 59390630 59390754 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1743508 chr16 59663601 59663822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1743509 chr16 59663915 59664122 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1746503 chr16 61354919 61355099 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1746513 chr16 61359193 61359300 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1748140 chr16 62278065 62278159 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1751818 chr16 64354851 64355395 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1751948 chr16 64428477 64428523 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1751954 chr16 64431545 64431660 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1754202 chr16 65681275 65681450 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1767324 chr16 71507842 71508193 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1768769 chr16 72172717 72172971 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1773068 chr16 74541731 74541854 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1773069 chr16 74542025 74542215 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1778192 chr16 76978313 76978578 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1778194 chr16 76978916 76978985 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1778196 chr16 76979259 76979428 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1784366 chr16 80156752 80156875 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1790735 chr16 83103646 83103771 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1791736 chr16 83591231 83591839 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1792353 chr16 83911333 83911585 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1794717 chr16 84951308 84951664 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1794718 chr16 84951930 84952062 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1814669 chr17 4557938 4558150 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1814686 chr17 4563741 4563860 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1814687 chr17 4563902 4564118 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1817713 chr17 5848011 5848883 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1818171 chr17 6066452 6066709 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1818209 chr17 6082032 6082480 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1819733 chr17 6806995 6807201 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1823281 chr17 8430558 8430630 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1826115 chr17 9695041 9695257 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1827135 chr17 10135194 10135330 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1827904 chr17 10528857 10528931 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1830207 chr17 11661493 11661983 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1830209 chr17 11662286 11662413 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1831853 chr17 12518889 12519018 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1836038 chr17 14649328 14649574 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1837267 chr17 15312879 15313021 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1837911 chr17 15623907 15624083 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1838765 chr17 16033025 16033324 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1838766 chr17 16033567 16033673 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1842911 chr17 17950538 17950725 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1844103 chr17 18561760 18561936 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1862292 chr17 30007091 30007382 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1864659 chr17 30941347 30941587 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1865357 chr17 31289241 31289989 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1867206 chr17 32146876 32147019 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1868255 chr17 32726497 32726721 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1868288 chr17 32743722 32743963 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1871665 chr17 34351594 34351659 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1871667 chr17 34352108 34352216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1871669 chr17 34352509 34352576 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1871683 chr17 34358182 34358381 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1871920 chr17 34488190 34488269 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1872082 chr17 34576223 34576302 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1872304 chr17 34741257 34741336 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1872421 chr17 34792309 34792388 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1875656 chr17 36298157 36298245 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1875657 chr17 36298288 36298437 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1875752 chr17 36332849 36332928 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1879653 chr17 37959303 37959371 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1905921 chr17 49790167 49790261 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1905922 chr17 49790837 49790966 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1906086 chr17 49867053 49867809 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1907662 chr17 50783815 50783964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908291 chr17 51147654 51147741 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908293 chr17 51147800 51148183 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1909762 chr17 52018380 52018562 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1910136 chr17 52257899 52258645 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1913620 chr17 54148776 54148975 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1913622 chr17 54149005 54149046 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1913623 chr17 54149107 54149416 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1915056 chr17 54888214 54888423 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1920560 chr17 57337539 57337620 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1920562 chr17 57337911 57338101 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1922381 chr17 58081960 58082109 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1922382 chr17 58082152 58082231 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1922528 chr17 58173325 58173803 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1922529 chr17 58173849 58173928 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1927372 chr17 60337205 60337284 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1936409 chr17 64821584 64821669 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1936559 chr17 64889355 64889636 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1942108 chr17 67408938 67409129 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1950970 chr17 72176205 72176326 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1961470 chr17 77095509 77095580 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1974331 chr18 1090091 1090167 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1974333 chr18 1090663 1090849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1974695 chr18 1324447 1324510 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1975916 chr18 2048790 2048902 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1976508 chr18 2418949 2419277 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1981319 chr18 5042200 5042236 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1981321 chr18 5042529 5042601 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1981322 chr18 5042780 5042924 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1989523 chr18 9828690 9828794 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1989534 chr18 9834755 9834931 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1990878 chr18 10768599 10768737 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1991443 chr18 11136266 11136387 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1993728 chr18 12396285 12396489 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1993729 chr18 12396573 12396781 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1996004 chr18 13604620 13604721 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1996005 chr18 13605069 13605229 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2006787 chr18 22305432 22305607 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2006788 chr18 22305979 22306116 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2008532 chr18 23451345 23451453 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2010119 chr18 24227114 24227189 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2015922 chr18 27784523 27784839 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2017143 chr18 28555859 28556027 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2017146 chr18 28557006 28557161 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2021078 chr18 30766078 30766186 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2021079 chr18 30766316 30766596 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2021090 chr18 30770333 30770415 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2023672 chr18 32435462 32435532 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2030627 chr18 36782307 36782581 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2031638 chr18 37453066 37453281 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2031827 chr18 37577459 37577608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2033183 chr18 38450148 38450299 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2033190 chr18 38451774 38451981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2033916 chr18 38906308 38906463 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2033917 chr18 38906490 38906784 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2034967 chr18 39564589 39564735 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2034969 chr18 39565292 39565355 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2035521 chr18 39886301 39886487 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2035733 chr18 40026294 40026534 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2037239 chr18 40968235 40968909 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2052331 chr18 49248298 49249162 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2052335 chr18 49250807 49250848 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2053063 chr18 49693155 49693597 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2053065 chr18 49693985 49694214 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2053229 chr18 49777971 49778093 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2060308 chr18 54313077 54313214 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2065040 chr18 56907772 56908244 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2067563 chr18 58357183 58357295 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2068067 chr18 58654328 58655103 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2069704 chr18 59596545 59596705 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2072890 chr18 61312605 61312684 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2072915 chr18 61329607 61329736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2072917 chr18 61330242 61330321 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2073661 chr18 61811138 61811367 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2077891 chr18 64401289 64401639 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2077893 chr18 64401666 64401853 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2084240 chr18 68135394 68135476 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2084242 chr18 68135653 68135781 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2085105 chr18 68688553 68688800 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2085470 chr18 68928554 68928629 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2085472 chr18 68928805 68929196 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2088449 chr18 70725628 70725873 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2088450 chr18 70726520 70726705 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2088451 chr18 70726726 70726907 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2088836 chr18 70953758 70954163 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2091558 chr18 72759464 72759605 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2092567 chr18 73558570 73558795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2092571 chr18 73565474 73565603 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2098667 chr19 83981 84115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2101643 chr19 1542669 1542795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2159617 chr19 28462359 28462543 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2160147 chr19 28796057 28796648 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2160150 chr19 28797565 28797646 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2160963 chr19 29236359 29236525 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2166532 chr19 32401228 32401298 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2170443 chr19 34260679 34260774 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2170444 chr19 34261248 34261337 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2215705 chr19 51964210 51964309 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2233975 chr1_gl000192_random 523115 523242 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2233976 chr1_gl000192_random 523267 523493 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2233983 chr1_gl000192_random 524168 524305 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2234621 chr2 449493 449624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2242144 chr2 5784988 5785134 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2242148 chr2 5785787 5786012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2242149 chr2 5786040 5786161 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2243377 chr2 6512791 6513022 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2245831 chr2 8029813 8030037 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2253350 chr2 11892902 11893090 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2256424 chr2 13584118 13584283 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2257000 chr2 13927977 13928202 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2257001 chr2 13928277 13928404 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2258618 chr2 14832535 14832649 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2258624 chr2 14835047 14835125 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2262935 chr2 17125952 17126519 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2263237 chr2 17288199 17288365 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2263238 chr2 17288448 17288547 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2263327 chr2 17339038 17339426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264741 chr2 18149986 18150268 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264743 chr2 18150512 18150694 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264744 chr2 18151034 18151263 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2265038 chr2 18335326 18335426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2265042 chr2 18336603 18336897 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2265068 chr2 18352972 18353461 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2265106 chr2 18375060 18375627 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2266843 chr2 19451156 19451289 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2266845 chr2 19452307 19452652 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2267539 chr2 19907531 19908157 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2268849 chr2 20620159 20620214 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2268851 chr2 20620674 20620712 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2268853 chr2 20621124 20621348 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2270351 chr2 21577699 21578380 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2270703 chr2 21779043 21779121 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2271340 chr2 22217034 22217207 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2273164 chr2 23328683 23328819 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2273299 chr2 23414629 23414686 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2275780 chr2 24658657 24658777 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2275936 chr2 24720636 24720706 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2275937 chr2 24720757 24721102 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2277122 chr2 25286607 25286761 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2277123 chr2 25286936 25287405 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2278926 chr2 26104081 26104227 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2287380 chr2 30213770 30213931 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2293724 chr2 33383549 33383843 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2294211 chr2 33672371 33672466 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2295331 chr2 34230813 34230918 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2295864 chr2 34524498 34524873 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2296533 chr2 34938438 34938996 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2301175 chr2 37701161 37701367 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2301721 chr2 38030185 38030295 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2304480 chr2 39380569 39380783 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2304481 chr2 39380815 39381093 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2304483 chr2 39381406 39381516 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2304486 chr2 39382409 39382478 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2304549 chr2 39409732 39409840 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2306136 chr2 40290603 40290951 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2306138 chr2 40290992 40291008 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2306907 chr2 40841101 40841183 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2306912 chr2 40843255 40843457 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2307411 chr2 41149524 41149594 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2307507 chr2 41200175 41200487 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2308640 chr2 41905258 41905353 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2308835 chr2 42011762 42012033 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2316225 chr2 45780999 45781071 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2322958 chr2 49162096 49162291 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2322960 chr2 49162598 49162608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2322962 chr2 49162907 49163387 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2324484 chr2 50134234 50134337 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2324485 chr2 50134431 50134590 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2326259 chr2 51358646 51359119 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2328545 chr2 52840888 52841034 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2328547 chr2 52841440 52841918 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2329752 chr2 53608291 53608769 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2330428 chr2 53982453 53982640 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2331216 chr2 54311766 54311956 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2331220 chr2 54313033 54313080 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2331222 chr2 54313381 54313880 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2331882 chr2 54626610 54626784 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2331883 chr2 54626891 54627151 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2331887 chr2 54628159 54628285 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2332411 chr2 54977055 54977211 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2332413 chr2 54978198 54978383 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2334413 chr2 55972031 55972087 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2334951 chr2 56341926 56342046 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2334956 chr2 56343952 56344085 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2335398 chr2 56654732 56655026 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2339930 chr2 59687579 59687658 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2340579 chr2 60124603 60124709 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2345712 chr2 62480818 62481111 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2348371 chr2 63968142 63968432 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2352980 chr2 66279248 66279514 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2353000 chr2 66286645 66286825 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2354783 chr2 67592154 67592213 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2356190 chr2 68434587 68435006 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2356192 chr2 68435293 68435367 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2358733 chr2 69855823 69855901 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2362805 chr2 71830671 71830958 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2368925 chr2 75048735 75049334 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2368929 chr2 75050174 75050331 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2372592 chr2 77212713 77212809 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2372593 chr2 77213252 77213373 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2376437 chr2 79504084 79504324 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2377224 chr2 80006117 80006214 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2378609 chr2 80890251 80890313 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378906 chr2 81085868 81086570 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2379227 chr2 81311410 81311590 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2379878 chr2 81730994 81731050 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2379880 chr2 81731537 81731751 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2380338 chr2 82051052 82051252 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2380339 chr2 82051409 82051583 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2380340 chr2 82051665 82051836 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2382676 chr2 83463130 83463209 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2384435 chr2 84527777 84528294 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2384437 chr2 84528681 84528836 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2388164 chr2 86277415 86277529 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2390656 chr2 87549155 87549257 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2401202 chr2 97628330 97628415 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2413699 chr2 105008657 105008733 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2418957 chr2 108122534 108122632 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2424768 chr2 111601856 111602008 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2425776 chr2 112297062 112297164 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2430263 chr2 114579571 114579831 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2431300 chr2 115141864 115142088 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2431302 chr2 115142462 115142976 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2436319 chr2 118253116 118253282 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2436690 chr2 118504319 118504633 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2439342 chr2 120043265 120043355 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2442049 chr2 121415021 121415120 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2446318 chr2 123626154 123626791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2446778 chr2 123903489 123903672 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2446779 chr2 123903722 123903898 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2448348 chr2 124872994 124873073 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2448354 chr2 124874173 124874323 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2448429 chr2 124928585 124928729 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2448430 chr2 124929227 124929295 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2450731 chr2 126251928 126252035 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2450862 chr2 126333891 126333972 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2452105 chr2 127103753 127103955 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2452106 chr2 127104105 127104192 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2457969 chr2 130238243 130238447 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2462995 chr2 133239744 133239816 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2463630 chr2 133669273 133669505 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2469086 chr2 136708118 136708238 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2471670 chr2 138261993 138262377 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2473404 chr2 139317399 139317514 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2473666 chr2 139456081 139456142 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2473668 chr2 139456445 139456498 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2473774 chr2 139519164 139519376 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2473775 chr2 139519755 139519953 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2475161 chr2 140414748 140415118 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2475163 chr2 140415545 140415651 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2475164 chr2 140415842 140416078 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2476092 chr2 140941368 140941666 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2477492 chr2 141853628 141853831 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2478291 chr2 142370116 142370236 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2489552 chr2 149921733 149921932 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2489562 chr2 149924347 149924489 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2491121 chr2 150979359 150979740 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2492068 chr2 151569644 151570561 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2494233 chr2 152835800 152836031 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2495882 chr2 153727918 153728135 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2496344 chr2 154019158 154019253 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2498470 chr2 155412395 155412572 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2498626 chr2 155493906 155494126 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2498984 chr2 155749238 155749368 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2500859 chr2 156980971 156981275 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2502083 chr2 157760662 157761122 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2502085 chr2 157761171 157761642 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2502480 chr2 158035972 158036341 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2502482 chr2 158036658 158036914 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2502487 chr2 158037936 158038127 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2504349 chr2 159149034 159149250 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2508050 chr2 161364500 161364631 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2508203 chr2 161442629 161442710 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2508400 chr2 161573630 161573671 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2509877 chr2 162501745 162501842 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2513474 chr2 164861889 164862172 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2513733 chr2 165011218 165011383 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2520760 chr2 169586522 169586695 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2528020 chr2 173243302 173243743 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2536576 chr2 178273761 178273882 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2536584 chr2 178277985 178278527 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2537465 chr2 178856601 178856679 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2540327 chr2 180847439 180847534 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2545545 chr2 184237348 184237882 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2546262 chr2 184740770 184740850 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2550408 chr2 187308469 187308934 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2552490 chr2 188577780 188577920 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2552491 chr2 188577954 188578374 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2557882 chr2 191747856 191747928 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2559102 chr2 192474928 192475123 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2560072 chr2 193092054 193092148 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2562378 chr2 194558389 194558859 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2562380 chr2 194559237 194559432 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2566406 chr2 197001202 197001570 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2566961 chr2 197354319 197354523 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2569562 chr2 198766777 198767438 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2569583 chr2 198779961 198780063 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2571117 chr2 199725733 199725808 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2580821 chr2 204526843 204526917 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2580823 chr2 204527236 204527340 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2582095 chr2 205228652 205228854 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2585716 chr2 207370755 207370900 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2587874 chr2 208607640 208607876 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2588481 chr2 208897129 208897203 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588733 chr2 208998380 208998513 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588736 chr2 208999099 208999320 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2591779 chr2 210948173 210948296 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2595110 chr2 213085712 213085935 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2595990 chr2 213675715 213675824 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2596667 chr2 214138585 214138754 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2609576 chr2 221139744 221139831 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2609577 chr2 221139851 221139981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2609579 chr2 221140088 221140201 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2609580 chr2 221140258 221140457 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2609762 chr2 221238882 221239394 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612173 chr2 222650709 222651486 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612420 chr2 222787240 222787721 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612421 chr2 222787784 222787915 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2615396 chr2 224428054 224428194 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2623165 chr2 228692806 228692928 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2623371 chr2 228794435 228794605 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2623457 chr2 228837892 228838196 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2634900 chr2 234697752 234697854 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2635251 chr2 234912511 234912719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2635423 chr2 235019287 235019760 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2635898 chr2 235256194 235256315 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2639286 chr2 237174923 237175216 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2653979 chr20 2420253 2420434 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2653981 chr20 2420972 2421121 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2653983 chr20 2421298 2421345 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2656581 chr20 3522646 3522826 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2657756 chr20 4071758 4072041 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2661667 chr20 5813257 5813376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2662424 chr20 6169664 6169827 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2662426 chr20 6173789 6173948 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2665421 chr20 7974765 7974959 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2672515 chr20 11949171 11949268 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2672520 chr20 11950318 11950777 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2673983 chr20 12852588 12852702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2673986 chr20 12853664 12853988 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2676472 chr20 14203490 14203557 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2676476 chr20 14205194 14205302 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2677293 chr20 14725763 14725892 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2679144 chr20 15831147 15831738 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2680747 chr20 16739148 16739713 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2689921 chr20 21816827 21816919 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2693227 chr20 24103584 24103814 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2693228 chr20 24103908 24104196 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2693698 chr20 24410978 24411074 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2693761 chr20 24459607 24459711 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2694194 chr20 24775939 24776060 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2694580 chr20 25068710 25068898 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2694982 chr20 25334659 25334872 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2698636 chr20 30338597 30338688 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2701639 chr20 31442909 31442982 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2718129 chr20 37821715 37821947 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2718135 chr20 37823619 37823694 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2718136 chr20 37823918 37824085 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2718870 chr20 38192852 38193192 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2720469 chr20 39054797 39055248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2721668 chr20 39614524 39614980 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2721671 chr20 39615509 39615730 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2721673 chr20 39616026 39616316 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2723988 chr20 40801472 40801619 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2723990 chr20 40801739 40801919 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2724015 chr20 40813999 40814134 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2724203 chr20 40908391 40908640 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2730318 chr20 43392239 43392508 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2749765 chr20 50967778 50967932 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2749779 chr20 50973317 50973789 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2750766 chr20 51395164 51395333 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2750768 chr20 51395895 51396009 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2754137 chr20 52801858 52802309 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2758784 chr20 55116728 55116838 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2763668 chr20 57421798 57421929 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2767965 chr20 59939701 59939852 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2777574 chr21 16245541 16245712 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2777575 chr21 16246043 16246251 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778856 chr21 17080559 17080641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778861 chr21 17082323 17082431 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2782300 chr21 19237716 19237835 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2784941 chr21 20854223 20854421 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2787015 chr21 22041104 22041158 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2787018 chr21 22041680 22041780 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2788198 chr21 22744993 22745145 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2788245 chr21 22771928 22772054 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2792679 chr21 25296188 25296343 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2796438 chr21 27444040 27444199 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2796721 chr21 27596881 27596982 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2800723 chr21 29959363 29959455 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2801002 chr21 30120876 30121012 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2804879 chr21 32329943 32330400 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2804881 chr21 32330633 32330745 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2806816 chr21 33230903 33231015 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2812518 chr21 36151200 36151310 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2814210 chr21 37190140 37190946 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2816028 chr21 38011898 38012016 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2821351 chr21 40925237 40925540 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2846584 chr22 23698892 23699041 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2846585 chr22 23699232 23699469 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2847867 chr22 24287799 24287970 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2852976 chr22 26501415 26501507 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2852978 chr22 26501533 26501552 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2859773 chr22 29325089 29325280 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2861497 chr22 30053663 30053732 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2869367 chr22 33315619 33315703 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870262 chr22 33686178 33686279 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2872374 chr22 34562153 34562361 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2872380 chr22 34564352 34564879 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2872441 chr22 34585575 34585827 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2873946 chr22 35316945 35317011 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2881944 chr22 38580040 38580317 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2881946 chr22 38580625 38580710 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2883644 chr22 39282943 39283043 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2906296 chr22 50103325 50103380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2908857 chr3 416072 416459 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2910091 chr3 1183585 1184155 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2910909 chr3 1670670 1670822 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2912740 chr3 2773352 2773503 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2912742 chr3 2774096 2774255 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2920419 chr3 7018381 7018996 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2922441 chr3 8174731 8174834 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2922442 chr3 8174969 8175129 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2928022 chr3 10648728 10648828 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2939958 chr3 16208109 16208204 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2945881 chr3 19825183 19825362 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2946906 chr3 20301627 20301760 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2947826 chr3 20898336 20898503 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2948317 chr3 21204134 21204369 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2953699 chr3 24341163 24341248 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2954434 chr3 24762927 24763008 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2954435 chr3 24763258 24763452 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956232 chr3 25861126 25861367 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956234 chr3 25861694 25861997 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2961058 chr3 28604070 28604202 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2966169 chr3 31662952 31663124 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2971899 chr3 34289368 34289635 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2977540 chr3 37643042 37643128 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2981627 chr3 39939777 39939856 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2984294 chr3 41433870 41434043 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2985914 chr3 42272846 42273245 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2990335 chr3 44720443 44720921 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2990339 chr3 44724305 44724562 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2991254 chr3 45175429 45175531 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2993467 chr3 46336405 46336617 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2994008 chr3 46616149 46616337 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3010191 chr3 54875618 54875801 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3011503 chr3 55697046 55697246 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3018367 chr3 58951875 58951987 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3018852 chr3 59231568 59232211 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3018856 chr3 59232915 59232998 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3025176 chr3 62853060 62853217 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3025178 chr3 62853720 62853878 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3025638 chr3 63087086 63087216 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3025810 chr3 63165107 63165249 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3025812 chr3 63165832 63166249 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3033793 chr3 67460505 67460994 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3035538 chr3 68397589 68397767 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3046829 chr3 74239862 74240231 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3047357 chr3 74562415 74563068 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3047823 chr3 74816275 74816608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3048088 chr3 74993792 74993813 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3048090 chr3 74994165 74994278 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3048091 chr3 74994482 74994856 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3048681 chr3 75350531 75350609 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3050759 chr3 76635849 76636237 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3051575 chr3 77155832 77155925 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3053154 chr3 78269283 78269385 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3053426 chr3 78421382 78421576 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3053427 chr3 78421683 78421834 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3053630 chr3 78547978 78548143 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3066865 chr3 86904567 86904649 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3066866 chr3 86904790 86905005 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3068369 chr3 87881953 87882243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3071076 chr3 89645230 89645707 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3076800 chr3 96445331 96445427 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3076801 chr3 96445458 96445818 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3076933 chr3 96547369 96547840 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3080940 chr3 99222052 99222177 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3080942 chr3 99222656 99222713 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3081315 chr3 99480580 99480823 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3082081 chr3 99937511 99937575 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3082083 chr3 99937856 99938151 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3083890 chr3 101053626 101053760 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3087321 chr3 103033113 103033547 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3087459 chr3 103122302 103122404 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3090279 chr3 104865639 104866164 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3092847 chr3 106500427 106500571 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3092849 chr3 106501168 106501190 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3092851 chr3 106501267 106501373 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3092854 chr3 106501713 106501858 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3096048 chr3 108459105 108459754 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3102811 chr3 112537172 112537734 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3107884 chr3 115634923 115634996 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3109173 chr3 116493151 116493306 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3110675 chr3 117479538 117479865 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3110677 chr3 117480217 117480393 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3111330 chr3 117926906 117927014 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3113449 chr3 119216569 119216724 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3114555 chr3 119816867 119816985 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3121656 chr3 123742698 123742852 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3122351 chr3 124182595 124182742 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3127026 chr3 126680122 126680198 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3128915 chr3 127694270 127694525 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3128916 chr3 127694581 127694729 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3128920 chr3 127697025 127697104 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3140859 chr3 133935966 133936119 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3141213 chr3 134115745 134115878 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3145555 chr3 136474591 136474696 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3145557 chr3 136474969 136475037 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3146736 chr3 137040140 137040358 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3146747 chr3 137045276 137045497 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3146750 chr3 137046034 137046174 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3146752 chr3 137046616 137046732 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3147551 chr3 137611469 137611641 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3150567 chr3 139067520 139067681 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3152279 chr3 140069008 140069158 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3152284 chr3 140071202 140071305 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3154426 chr3 141335761 141335990 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3154929 chr3 141561756 141561907 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3157357 chr3 142689963 142690140 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3159133 chr3 143783636 143783925 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3159774 chr3 144184089 144184266 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3162222 chr3 145678795 145678959 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3164862 chr3 147400189 147400291 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3170744 chr3 150656223 150656283 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3170745 chr3 150656776 150656853 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3174022 chr3 152656941 152657268 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3174026 chr3 152658143 152658258 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3174028 chr3 152658717 152658920 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3177157 chr3 154425542 154425616 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3177164 chr3 154429920 154429985 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3178485 chr3 155287786 155287892 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3178487 chr3 155288700 155288794 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3185383 chr3 159458245 159458372 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3185386 chr3 159459106 159459152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3186670 chr3 160174060 160174370 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3186684 chr3 160180582 160180677 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3186688 chr3 160182194 160182336 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3188473 chr3 161159113 161159272 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3188474 chr3 161159522 161159691 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3188948 chr3 161424292 161424359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3189766 chr3 161961051 161961098 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3189772 chr3 161966393 161966424 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3189774 chr3 161966715 161967033 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3197470 chr3 166689121 166689201 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3207855 chr3 172767469 172768029 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3211917 chr3 175232821 175233216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3211920 chr3 175233830 175234231 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3213840 chr3 176412092 176412232 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3213844 chr3 176414017 176414100 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3216606 chr3 177934312 177934816 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3217824 chr3 178674544 178674610 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3217826 chr3 178675039 178675161 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3230232 chr3 184918178 184918247 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3232489 chr3 185931841 185931907 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3240285 chr3 189994345 189994691 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3240293 chr3 189997517 189997770 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3243334 chr3 191704083 191704220 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3243335 chr3 191704426 191704475 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3243336 chr3 191704530 191704900 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3245783 chr3 193104297 193104457 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3245785 chr3 193104934 193105149 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3249729 chr3 195125884 195126092 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3249733 chr3 195126800 195126915 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3250537 chr3 195425820 195425941 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3257259 chr4 502965 503143 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3265480 chr4 5028473 5028581 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3265481 chr4 5028824 5029054 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3265660 chr4 5099135 5099512 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3265662 chr4 5100091 5100243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3266661 chr4 5607411 5607485 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3266662 chr4 5607725 5607822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3268922 chr4 6646373 6646549 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3274622 chr4 9819354 9819774 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3274634 chr4 9824766 9824934 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3275670 chr4 10532033 10532312 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3275671 chr4 10532612 10532824 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3278023 chr4 11722963 11723121 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3279985 chr4 12789707 12790161 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3282834 chr4 14263661 14264115 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3288000 chr4 16928012 16928155 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3288004 chr4 16928664 16929093 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3292524 chr4 19163454 19163563 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3293919 chr4 19955789 19956591 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3294802 chr4 20448734 20448871 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3294960 chr4 20562091 20562313 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298067 chr4 22318881 22318999 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298069 chr4 22319487 22319548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298707 chr4 22670242 22670855 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298710 chr4 22671102 22671381 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3306496 chr4 26467004 26467051 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3306499 chr4 26467549 26467920 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3306502 chr4 26468492 26468643 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3307759 chr4 27146582 27146839 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3308511 chr4 27569220 27569360 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3311100 chr4 29091274 29091393 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3311101 chr4 29091376 29091455 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3312446 chr4 29904548 29904836 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3318165 chr4 33303758 33304361 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3329488 chr4 39582637 39582826 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3335940 chr4 42386592 42386719 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3335941 chr4 42386787 42387151 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3335945 chr4 42387840 42388004 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3337420 chr4 43323913 43323998 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3339146 chr4 44348291 44348625 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3339147 chr4 44348653 44348938 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3339750 chr4 44721136 44721277 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3340329 chr4 45098642 45098967 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3340330 chr4 45099188 45099391 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3340511 chr4 45214969 45215739 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3342025 chr4 46130433 46130534 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3345521 chr4 48160446 48160614 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3345552 chr4 48176093 48176292 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3359747 chr4 58858157 58858228 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3363802 chr4 61454521 61454676 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3365658 chr4 62652928 62653055 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3370061 chr4 65384006 65384157 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3370063 chr4 65384290 65384579 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3370064 chr4 65384606 65384707 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3370486 chr4 65651473 65651713 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3370488 chr4 65652086 65652382 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3372151 chr4 66734831 66735041 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3372289 chr4 66814484 66814685 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3372829 chr4 67162612 67162795 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3374383 chr4 68174620 68174869 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3374384 chr4 68174913 68175100 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3382613 chr4 73087430 73087656 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3383195 chr4 73474226 73474438 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3383292 chr4 73535422 73535593 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3383563 chr4 73726775 73726849 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3383564 chr4 73726900 73727074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3383565 chr4 73727136 73727302 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3384746 chr4 74391204 74391354 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3384748 chr4 74391737 74392349 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3385250 chr4 74712828 74713066 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3385258 chr4 74718406 74718513 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3385295 chr4 74740766 74741209 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3385404 chr4 74807192 74807306 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3385461 chr4 74854347 74854578 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3385561 chr4 74927958 74928189 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3385562 chr4 74928246 74928395 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3385583 chr4 74945514 74945953 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3393127 chr4 79222175 79222465 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3395186 chr4 80444514 80444646 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3395928 chr4 80965858 80965990 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3395929 chr4 80966455 80966579 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3399698 chr4 83297114 83297245 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3407518 chr4 87545480 87545823 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3412853 chr4 90352434 90352650 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3412991 chr4 90427669 90427771 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3412994 chr4 90428076 90428185 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3413836 chr4 90957780 90957914 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3416376 chr4 92700133 92700241 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3416377 chr4 92700289 92700397 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3418623 chr4 94111497 94111701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3424949 chr4 98108952 98109399 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3424951 chr4 98109697 98109804 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3425820 chr4 98682900 98683027 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3437166 chr4 105579848 105579974 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3437844 chr4 106028289 106029112 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3438805 chr4 106603543 106603682 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3448242 chr4 112402424 112403310 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3449253 chr4 113060971 113061109 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3449259 chr4 113062711 113062798 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3450325 chr4 113617899 113618059 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3452471 chr4 114927095 114927199 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3461935 chr4 120764039 120764296 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3462714 chr4 121277508 121277762 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3470240 chr4 125945664 125945918 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3470258 chr4 125953680 125954132 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3470996 chr4 126438235 126438512 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3473151 chr4 127802501 127803133 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3473152 chr4 127803156 127803402 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3476038 chr4 129417315 129417478 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3476039 chr4 129417702 129418066 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3478132 chr4 130669520 130670110 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3478664 chr4 131036080 131036184 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3478665 chr4 131036281 131036820 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3484983 chr4 134964031 134964233 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3488238 chr4 137070305 137070389 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3490759 chr4 138731143 138731365 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3495929 chr4 141534451 141534537 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3495932 chr4 141534997 141535220 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3495933 chr4 141535236 141535366 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3497520 chr4 142476739 142476817 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3498110 chr4 142829524 142829637 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3500695 chr4 144482079 144482504 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3500697 chr4 144483156 144483303 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3501694 chr4 145066524 145066654 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3501730 chr4 145091307 145091422 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3502778 chr4 145803952 145804121 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3503526 chr4 146246819 146247011 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3503528 chr4 146247036 146247139 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3505107 chr4 147198432 147198530 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3508586 chr4 149377695 149377867 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3511060 chr4 150944996 150945118 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3515815 chr4 153485806 153485980 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3515817 chr4 153486289 153486417 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3515830 chr4 153490175 153490268 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3518478 chr4 154970828 154971082 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3519998 chr4 155922643 155922905 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3524812 chr4 158850971 158851042 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3524869 chr4 158886589 158886879 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3524870 chr4 158887062 158887160 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3524931 chr4 158933279 158933451 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3525114 chr4 159065616 159066182 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3525115 chr4 159066198 159066441 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3530052 chr4 162074170 162074373 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3530054 chr4 162075251 162075333 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3530689 chr4 162470694 162471205 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3531869 chr4 163162652 163162780 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3535273 chr4 165201749 165201806 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3535625 chr4 165425542 165425678 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3540629 chr4 168373877 168374404 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3549664 chr4 173901282 173901390 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3549671 chr4 173903400 173903712 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3555712 chr4 177665463 177665576 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3556724 chr4 178241568 178241620 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3556726 chr4 178241921 178242086 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3559086 chr4 179674624 179674713 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3562026 chr4 181476407 181476495 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3566847 chr4 184508984 184509050 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3568910 chr4 185623642 185623704 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3568912 chr4 185624205 185624542 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3575208 chr4 189219949 189220099 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3575209 chr4 189220446 189220736 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3576242 chr4 189844351 189844548 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3583938 chr5 3521098 3521169 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3587691 chr5 6261798 6261938 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3592369 chr5 9461967 9462057 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3593518 chr5 10192283 10192561 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3596635 chr5 12092634 12092797 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3598793 chr5 13445682 13445861 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600204 chr5 14295708 14295794 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600205 chr5 14295966 14296066 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3603855 chr5 16559425 16559530 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3603856 chr5 16559578 16559642 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3607036 chr5 18324214 18324401 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3607392 chr5 18527202 18527349 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3608570 chr5 19227833 19228011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3610696 chr5 20518322 20518614 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3619225 chr5 25516866 25517403 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3624892 chr5 28865145 28865225 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3625124 chr5 29018350 29018581 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3627231 chr5 30276856 30277041 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3633784 chr5 33900251 33900485 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3633801 chr5 33908413 33908633 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3633805 chr5 33909867 33910071 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3636540 chr5 35428957 35429154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3636543 chr5 35429569 35429891 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3641850 chr5 38295763 38295932 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3641854 chr5 38297454 38297601 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3644511 chr5 39854981 39855134 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3644751 chr5 40011369 40011561 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3648004 chr5 42008170 42008378 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3651046 chr5 43819754 43819921 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3651047 chr5 43820248 43820334 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3651050 chr5 43820818 43820978 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3651389 chr5 44073329 44074104 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3661651 chr5 54286943 54287156 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3661658 chr5 54289052 54289306 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3666969 chr5 56991066 56991219 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3666970 chr5 56991261 56991828 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3668702 chr5 58097454 58097653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3668980 chr5 58260372 58260487 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3668982 chr5 58260847 58260908 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3672993 chr5 60712079 60712246 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3674192 chr5 61490919 61491404 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3674204 chr5 61494445 61494616 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3676386 chr5 62720053 62720288 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3683815 chr5 67196920 67197115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3684193 chr5 67394383 67394496 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3684194 chr5 67394514 67394838 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3691262 chr5 70803430 70803576 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3694625 chr5 72758854 72759038 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3699110 chr5 75314350 75314524 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3699825 chr5 75718367 75718492 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3706740 chr5 79451937 79452045 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3710749 chr5 81532397 81532500 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3711831 chr5 82186074 82186152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3711896 chr5 82225717 82225803 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3711899 chr5 82226380 82226622 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3711900 chr5 82226714 82226908 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3713780 chr5 83474297 83474378 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3714278 chr5 83777307 83777424 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3714280 chr5 83777462 83777613 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3714284 chr5 83779046 83779300 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3715371 chr5 84444602 84445366 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3717845 chr5 85959754 85959883 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3719211 chr5 86794501 86794587 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3723130 chr5 89518702 89518787 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3725347 chr5 90791421 90791595 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3727232 chr5 92096296 92096465 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731763 chr5 95186157 95186686 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731765 chr5 95188354 95188466 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3732207 chr5 95449449 95449580 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3732251 chr5 95479876 95479958 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3732253 chr5 95480732 95481039 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3738613 chr5 99558199 99558370 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3744652 chr5 103380665 103380767 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3745024 chr5 103637879 103638027 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3745027 chr5 103640270 103640447 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3749347 chr5 106394173 106394498 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3749626 chr5 106579675 106580317 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3750685 chr5 107344146 107344218 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3752791 chr5 108637776 108638036 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3753591 chr5 109112221 109112276 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3762633 chr5 114905696 114905802 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3762637 chr5 114907013 114907712 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3762778 chr5 114974327 114975150 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3763946 chr5 115704476 115704603 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3763947 chr5 115704600 115704987 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3767281 chr5 117771218 117771296 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3772376 chr5 120934118 120934261 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3773762 chr5 121897802 121897960 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3773764 chr5 121898964 121899070 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3774460 chr5 122252267 122252596 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3778975 chr5 125198010 125198193 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3779313 chr5 125445659 125445716 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3792039 chr5 133048987 133049056 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3798052 chr5 136469410 136469635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3798337 chr5 136663504 136663933 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3798338 chr5 136664082 136664179 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3806148 chr5 140427717 140427780 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3812206 chr5 143611750 143611896 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3813412 chr5 144352190 144352243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3813414 chr5 144352813 144352876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3813418 chr5 144356414 144356612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3813899 chr5 144607802 144608247 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3813908 chr5 144614471 144615288 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3819104 chr5 147229359 147229529 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3819105 chr5 147229718 147230141 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3819917 chr5 147667082 147667195 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3825628 chr5 150211150 150211350 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3825648 chr5 150223828 150224074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3825656 chr5 150230544 150230720 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3828449 chr5 151506616 151506662 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3829982 chr5 152345837 152345984 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3835632 chr5 154978536 154979276 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3836587 chr5 155544826 155545173 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3836588 chr5 155545349 155545457 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3837132 chr5 155846184 155846911 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3837507 chr5 156053819 156053963 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3840696 chr5 157473031 157473192 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3843507 chr5 159060498 159060584 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3846071 chr5 160177230 160177373 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3848050 chr5 161341549 161341782 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3848268 chr5 161467102 161467543 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3849516 chr5 162218532 162218710 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3849519 chr5 162219624 162219801 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3850533 chr5 162813238 162813765 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3850840 chr5 162975420 162975561 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3850842 chr5 162975717 162975830 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3851207 chr5 163164891 163165061 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3851208 chr5 163165108 163165272 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3851209 chr5 163165452 163165504 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3853500 chr5 164600652 164601451 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3853502 chr5 164601481 164601510 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3855290 chr5 165673024 165673641 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3858358 chr5 167454261 167454440 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3861649 chr5 169100917 169100972 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3861650 chr5 169100982 169101189 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3874771 chr5 175006905 175007044 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3875694 chr5 175384844 175385037 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3875695 chr5 175385116 175385361 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3880043 chr5 177312441 177312686 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3880044 chr5 177312766 177312959 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3891326 chr6 2549191 2549541 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3896072 chr6 5137817 5138132 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3897654 chr6 6089043 6089114 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3897660 chr6 6090168 6090475 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3897661 chr6 6090541 6090715 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3901444 chr6 8178933 8178974 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3901446 chr6 8179272 8179372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3903333 chr6 9331324 9331918 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3905261 chr6 10504837 10504920 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3910688 chr6 13496083 13496161 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3910720 chr6 13505056 13505137 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3910795 chr6 13535538 13535605 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3919638 chr6 17940927 17941044 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3919640 chr6 17941356 17941551 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3925758 chr6 21241577 21241873 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3926746 chr6 21724902 21724998 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3927991 chr6 22452551 22452850 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3933831 chr6 25870416 25870544 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3933832 chr6 25870808 25871227 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3944021 chr6 31082050 31082127 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3948559 chr6 33513415 33513592 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3949119 chr6 33808593 33808738 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3949155 chr6 33827062 33827243 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3951229 chr6 34697448 34697654 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3955387 chr6 36488462 36488593 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3955388 chr6 36488834 36489163 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3978709 chr6 48541969 48542073 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3983573 chr6 51668100 51668241 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3990524 chr6 55808535 55808976 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3991014 chr6 56122913 56123018 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3992207 chr6 56863021 56863236 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3993678 chr6 57748137 57748400 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3994543 chr6 58355269 58355533 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3996233 chr6 62850023 62850084 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3999067 chr6 64576286 64576468 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3999068 chr6 64576675 64576753 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4000622 chr6 65596013 65596103 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4003118 chr6 67131451 67131612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4003119 chr6 67131679 67131760 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4003120 chr6 67131805 67131981 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4007367 chr6 69774056 69774149 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4008905 chr6 70793563 70793857 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4012591 chr6 73158584 73158735 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4013258 chr6 73570932 73571024 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4015171 chr6 74423466 74423572 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4015608 chr6 74697649 74697780 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4019781 chr6 77363427 77363474 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4020845 chr6 78079616 78080160 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4022489 chr6 79171810 79171931 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4022830 chr6 79400518 79400905 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4022860 chr6 79426426 79426592 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4024725 chr6 80573894 80574142 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4024728 chr6 80575268 80575514 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4024729 chr6 80575554 80575784 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4024753 chr6 80587277 80587498 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4024771 chr6 80598001 80598238 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4025217 chr6 80854820 80854918 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4025218 chr6 80854926 80855084 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4025220 chr6 80855287 80855524 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4025221 chr6 80855563 80855744 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4025772 chr6 81236412 81237051 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4025805 chr6 81255322 81255484 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4027035 chr6 82077127 82077211 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4027038 chr6 82077851 82078041 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4027039 chr6 82078263 82078435 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4028096 chr6 82764375 82764975 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4029173 chr6 83406897 83407176 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4029174 chr6 83407457 83407646 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4034208 chr6 86510940 86511385 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4035616 chr6 87542759 87542890 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4037591 chr6 88596998 88597090 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4038288 chr6 89031413 89031664 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4038486 chr6 89166634 89167110 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4045593 chr6 93295734 93295833 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4046308 chr6 93779646 93780499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4048148 chr6 94995697 94995752 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4048151 chr6 94997233 94997435 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4052489 chr6 97920340 97920534 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4061088 chr6 103375012 103375453 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4066989 chr6 106949630 106949744 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4069063 chr6 107889193 107889329 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4070929 chr6 108784754 108785512 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4071780 chr6 109267049 109267095 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4076883 chr6 111820450 111820638 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4079856 chr6 113687827 113687950 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4079964 chr6 113747068 113747350 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4081537 chr6 114573683 114573809 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4081609 chr6 114624057 114624253 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4101606 chr6 127334957 127335116 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4105403 chr6 129811792 129811841 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4105711 chr6 129996759 129997254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4105712 chr6 129997378 129997513 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4106301 chr6 130314462 130314628 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4106309 chr6 130317453 130317566 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4106824 chr6 130603356 130603452 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4115043 chr6 135333965 135334003 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4116042 chr6 135878809 135879585 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4116506 chr6 136155008 136155123 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4116513 chr6 136161379 136161786 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4117077 chr6 136526934 136527168 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4117080 chr6 136528046 136528479 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4117365 chr6 136669173 136669973 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4118832 chr6 137448541 137448685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124736 chr6 140781090 140781142 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124737 chr6 140781284 140781400 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124738 chr6 140781989 140782177 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4132272 chr6 145286640 145286737 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4132274 chr6 145287130 145287372 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4132680 chr6 145530308 145530537 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4134887 chr6 146924653 146924803 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4136059 chr6 147628390 147628635 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4136721 chr6 148024659 148024794 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4138174 chr6 148877954 148878428 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4139323 chr6 149546992 149547167 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4140850 chr6 150204091 150204163 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4141206 chr6 150418314 150418460 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4141208 chr6 150418857 150418982 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4141522 chr6 150582457 150582539 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4149341 chr6 154910104 154910201 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4149344 chr6 154911121 154911492 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4151392 chr6 156017658 156017698 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4154343 chr6 157953700 157953862 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4154346 chr6 157955475 157955560 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4154349 chr6 157955903 157955981 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4158072 chr6 160014957 160015233 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4160262 chr6 161435240 161435576 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4164698 chr6 164229294 164229417 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4164699 chr6 164229717 164229824 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4164700 chr6 164231012 164231107 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4165503 chr6 164753209 164753344 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4166835 chr6 165578899 165579100 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4169863 chr6 167664435 167664649 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4206136 chr6_mcf_hap5 2463975 2464052 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4234568 chr7 4864322 4864534 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4241162 chr7 7634408 7634579 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4242433 chr7 8364039 8364081 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4242715 chr7 8566884 8567276 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4245462 chr7 10343886 10343992 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4245491 chr7 10361133 10361363 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4245492 chr7 10361524 10361692 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4247910 chr7 11972958 11973012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4247913 chr7 11974037 11974205 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4247914 chr7 11974341 11974538 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4251690 chr7 14381688 14381797 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4256435 chr7 17442784 17442973 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4256438 chr7 17443745 17443994 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4256443 chr7 17445369 17445510 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4256523 chr7 17499764 17499869 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4258213 chr7 18555068 18555273 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4258540 chr7 18784853 18785005 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4261762 chr7 20933615 20933722 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4261764 chr7 20934215 20934344 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4267117 chr7 23771372 23771614 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4267120 chr7 23772304 23772437 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4269504 chr7 25145327 25145516 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4274156 chr7 27888370 27888530 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4277631 chr7 29921290 29921433 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4277632 chr7 29921762 29922008 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4280074 chr7 31293459 31293614 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4281672 chr7 32229310 32229408 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4281695 chr7 32240885 32240970 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4282350 chr7 32551654 32551810 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4286061 chr7 34683196 34683890 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4293381 chr7 38960564 38960726 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4293383 chr7 38961043 38961560 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4296669 chr7 40577995 40578279 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4301350 chr7 43473093 43473721 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4301351 chr7 43473755 43473798 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4306384 chr7 46067324 46067506 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4310370 chr7 48514968 48515035 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4312393 chr7 49792518 49792643 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4312394 chr7 49792861 49793028 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4313327 chr7 50425999 50426094 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4318573 chr7 53692427 53692537 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4324263 chr7 56816557 56816680 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4329127 chr7 63287131 63287254 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4332275 chr7 64906064 64906375 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4332277 chr7 64906856 64907213 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4334107 chr7 65600156 65600353 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4334393 chr7 65689048 65689628 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4338297 chr7 67160623 67160739 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4338300 chr7 67161219 67161345 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4338301 chr7 67161379 67161501 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4339006 chr7 67420092 67420286 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4364726 chr7 77966486 77966784 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4364727 chr7 77967030 77967176 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4365603 chr7 78534961 78535165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4367826 chr7 79899687 79899866 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4367882 chr7 79935785 79935893 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4376724 chr7 85609733 85609865 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4376727 chr7 85610555 85610725 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4376728 chr7 85610916 85611001 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4376772 chr7 85639528 85639616 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4376773 chr7 85639889 85640114 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4381720 chr7 88763579 88763683 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4387884 chr7 92570375 92570474 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4389587 chr7 93664268 93664384 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4390486 chr7 94208887 94208977 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4407943 chr7 102606020 102606652 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4407945 chr7 102606840 102607012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4408855 chr7 103106500 103106686 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4414355 chr7 106065642 106065739 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4421526 chr7 110410844 110410941 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4421804 chr7 110599582 110599708 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4421805 chr7 110600104 110600237 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4421807 chr7 110600565 110600722 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4422227 chr7 110901009 110901263 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4424435 chr7 112193818 112194035 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4425517 chr7 112853752 112853931 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4425884 chr7 113105272 113105497 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4425886 chr7 113106057 113106306 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4426055 chr7 113226156 113226390 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4446688 chr7 125922197 125922277 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4448423 chr7 127083664 127083881 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4459827 chr7 132942876 132942973 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4460175 chr7 133160415 133160518 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4461270 chr7 133794072 133794324 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4461272 chr7 133794643 133795113 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4462290 chr7 134376391 134376606 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4462293 chr7 134378435 134378568 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4465565 chr7 136191628 136191776 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4466524 chr7 136769969 136770111 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4470079 chr7 138520385 138520453 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4471505 chr7 139143833 139143947 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4476832 chr7 141808248 141809169 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4477029 chr7 141926321 141926466 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4478579 chr7 143076038 143076417 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4480208 chr7 144147899 144148201 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4480210 chr7 144148848 144148943 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4484554 chr7 146778340 146778506 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4484558 chr7 146778845 146779493 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4484975 chr7 147035408 147035666 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4485260 chr7 147222010 147222386 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4489588 chr7 149364304 149364459 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4490046 chr7 149639734 149640167 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4490048 chr7 149640369 149640533 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4490050 chr7 149640815 149640938 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4493112 chr7 151425318 151425497 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4496485 chr7 152998186 152998365 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4497569 chr7 153619937 153620192 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4497570 chr7 153620298 153620476 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4497899 chr7 153850150 153850273 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4497901 chr7 153850572 153850665 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4497903 chr7 153850946 153851374 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4498785 chr7 154530420 154530545 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4505542 chr7 159052856 159052994 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4507185 chr8 881442 881541 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4509837 chr8 2984104 2984225 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4509838 chr8 2984489 2984635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4512684 chr8 4990538 4990615 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4512688 chr8 4991464 4991541 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4512896 chr8 5107452 5107554 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4513517 chr8 5463570 5463765 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4515658 chr8 6702126 6702206 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4523014 chr8 10987396 10987520 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4524608 chr8 11849093 11849151 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4529612 chr8 14846014 14846115 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4532390 chr8 16543131 16543328 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4532392 chr8 16543943 16544419 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4534973 chr8 18036134 18036323 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4535231 chr8 18185653 18185759 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4535868 chr8 18557115 18557181 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4538887 chr8 20176439 20176946 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4540309 chr8 20951608 20951789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4546489 chr8 24186989 24187051 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4546624 chr8 24267367 24267498 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4547504 chr8 24753081 24753312 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4547890 chr8 24943229 24943364 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4552064 chr8 27084355 27084454 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4563782 chr8 33098489 33098659 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4563785 chr8 33099214 33099349 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4566451 chr8 34487948 34488032 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4589194 chr8 50954243 50954388 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4591678 chr8 52564311 52564518 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4597112 chr8 55623917 55624081 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4597114 chr8 55625119 55625479 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4603855 chr8 59670569 59670845 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4608876 chr8 62873057 62873264 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4608878 chr8 62873678 62873897 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609757 chr8 63459803 63459935 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609758 chr8 63460060 63460369 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4611143 chr8 64286704 64286844 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4611911 chr8 64818716 64818922 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4611992 chr8 64864793 64865314 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4613846 chr8 66095556 66095802 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4613847 chr8 66095876 66095936 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4613897 chr8 66120988 66121082 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4625127 chr8 72180248 72180399 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4625128 chr8 72180825 72180918 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4632905 chr8 76686354 76686558 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4632907 chr8 76686897 76687068 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4638678 chr8 80438120 80438420 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4638679 chr8 80438679 80438905 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4638762 chr8 80492895 80493299 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4640354 chr8 81244656 81244842 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4644271 chr8 83485236 83485467 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4647187 chr8 85337921 85338018 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4647189 chr8 85338060 85338286 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4655333 chr8 90428013 90428062 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4656287 chr8 90979889 90980163 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4656291 chr8 90981208 90981285 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4657056 chr8 91469292 91469453 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4657638 chr8 91849300 91849486 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4657641 chr8 91850076 91850284 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4661713 chr8 94441856 94442522 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4661818 chr8 94503681 94503835 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4665150 chr8 96087110 96087294 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4665151 chr8 96088261 96088460 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4666099 chr8 96595765 96596307 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4667186 chr8 97240246 97240539 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4668487 chr8 97971968 97972081 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4668489 chr8 97972168 97972331 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4668576 chr8 98037598 98037740 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4677872 chr8 102743782 102743907 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4677873 chr8 102743967 102744613 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4681201 chr8 104352508 104352909 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4681203 chr8 104353190 104353214 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4681205 chr8 104353301 104353663 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4682827 chr8 105316009 105316128 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4684808 chr8 106498635 106498842 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4688230 chr8 108574952 108575445 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4688231 chr8 108575539 108575758 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4692457 chr8 111106060 111106302 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4692613 chr8 111204782 111205097 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4692618 chr8 111206492 111206663 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693903 chr8 111954812 111954979 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4696645 chr8 113618119 113618188 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4696650 chr8 113622582 113623039 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4697200 chr8 113936680 113936794 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700551 chr8 115974636 115974782 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700553 chr8 115974997 115975227 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700554 chr8 115975290 115975334 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4702774 chr8 117380599 117381018 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4705596 chr8 118961070 118961218 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4708229 chr8 120398652 120399090 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4708468 chr8 120526109 120526770 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4709534 chr8 121017444 121018087 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4711324 chr8 121952754 121952854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4711325 chr8 121953120 121953505 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4717214 chr8 124837863 124838424 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721232 chr8 126666822 126667164 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721357 chr8 126716513 126716573 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721359 chr8 126716988 126717172 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721366 chr8 126718969 126719386 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721521 chr8 126787475 126787856 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4721522 chr8 126788006 126788500 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4728159 chr8 129955236 129955815 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4732138 chr8 131779706 131780414 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4732480 chr8 131938345 131938398 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4732482 chr8 131938470 131938631 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4732494 chr8 131945102 131945302 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4733521 chr8 132475974 132476197 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4733789 chr8 132618207 132618447 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4733978 chr8 132711689 132712344 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4734256 chr8 132852719 132852937 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4734257 chr8 132852956 132853204 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4734261 chr8 132855632 132855755 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4734263 chr8 132856305 132856425 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4734776 chr8 133146240 133146352 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4735830 chr8 133609209 133609415 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4735831 chr8 133609713 133609869 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4742754 chr8 137083470 137083594 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4744577 chr8 138040763 138040967 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4744578 chr8 138041001 138041166 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4744580 chr8 138041581 138041626 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4750332 chr8 141260932 141261053 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4753619 chr8 143102366 143102537 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4773244 chr9 8211374 8211596 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4776634 chr9 10405038 10405174 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4776635 chr9 10405291 10405468 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4776865 chr9 10555437 10555623 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4778449 chr9 11560440 11560878 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4778965 chr9 11883008 11883178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4787670 chr9 17129787 17130070 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4787671 chr9 17130086 17130219 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4788327 chr9 17538182 17538347 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4788329 chr9 17538682 17538766 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4788333 chr9 17539460 17539502 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4788335 chr9 17545585 17545820 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4788659 chr9 17749603 17749722 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4796467 chr9 22378617 22378708 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4797354 chr9 22948373 22948640 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4797355 chr9 22948706 22948854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4797615 chr9 23127127 23127330 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4799230 chr9 24182569 24183046 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4803231 chr9 26767403 26767532 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4808174 chr9 29758796 29758904 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4809383 chr9 30512017 30512174 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4810430 chr9 31210568 31210980 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4813357 chr9 32969304 32969396 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4813358 chr9 32969544 32969785 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4826043 chr9 38876339 38876511 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4826044 chr9 38876606 38876965 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4826046 chr9 38877273 38877432 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4828201 chr9 40225640 40225799 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4828203 chr9 40226111 40226470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4828204 chr9 40226565 40226737 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4836110 chr9 45236924 45237096 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4836111 chr9 45237191 45237329 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4836112 chr9 45237346 45237550 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4836114 chr9 45237862 45238021 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4839789 chr9 65855017 65855176 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4839791 chr9 65855488 65855847 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4839792 chr9 65855942 65856114 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4841733 chr9 67554287 67554446 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4841735 chr9 67554758 67555117 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4841736 chr9 67555212 67555384 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4847904 chr9 71817873 71818006 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4849725 chr9 72868275 72868369 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4849726 chr9 72868449 72868486 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4849728 chr9 72868845 72869017 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4850056 chr9 73019568 73019637 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4850058 chr9 73020235 73020377 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4851619 chr9 73920968 73921190 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4854520 chr9 75290396 75291342 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4856302 chr9 76385848 76386069 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4856303 chr9 76386275 76386330 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4856393 chr9 76445021 76445243 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4856409 chr9 76458032 76458184 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4867984 chr9 83053130 83053484 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4868338 chr9 83297861 83298124 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4868455 chr9 83369421 83369507 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4869114 chr9 83790010 83790240 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4871233 chr9 84965886 84965958 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4872629 chr9 85857556 85857828 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4872630 chr9 85858433 85858609 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4873001 chr9 86066867 86067062 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4876673 chr9 87980553 87980706 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4876674 chr9 87980741 87980854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4879786 chr9 89568890 89569023 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4886478 chr9 93593212 93593274 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4888395 chr9 94678573 94678646 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4888627 chr9 94782417 94782517 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4895689 chr9 98618674 98619021 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4903845 chr9 102392743 102393593 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4905528 chr9 103219824 103219966 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4906627 chr9 103827723 103827772 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4907809 chr9 104513329 104513713 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4907811 chr9 104513988 104514160 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4914255 chr9 108116703 108116848 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4917616 chr9 109993232 109993990 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4924986 chr9 113518940 113519139 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4925185 chr9 113633735 113633850 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4931666 chr9 116561115 116561253 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4935387 chr9 118224119 118224245 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4945597 chr9 123024440 123024655 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4945602 chr9 123025426 123025748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4950504 chr9 125166014 125166114 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4960577 chr9 129818377 129818641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4961282 chr9 130181754 130182212 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4975615 chr9 136426707 136426877 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4983222 chr9_gl000201_random 9793 9963 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5005211 chrX 6938572 6939077 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5005212 chrX 6939091 6939427 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5014605 chrX 12434022 12434146 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5014825 chrX 12567560 12567649 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5016029 chrX 13227399 13227506 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5016032 chrX 13228810 13229192 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5032327 chrX 21824965 21825092 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5033312 chrX 22312285 22312369 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5033330 chrX 22325352 22325463 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5033331 chrX 22325739 22325862 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5033365 chrX 22341379 22341440 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5033723 chrX 22542081 22542187 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5035821 chrX 23772390 23772758 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5035824 chrX 23772971 23773372 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5038931 chrX 25156220 25156414 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5038932 chrX 25156586 25156670 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5041045 chrX 26452713 26452817 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5042915 chrX 27454030 27454085 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5043501 chrX 27753767 27753929 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5046789 chrX 29628586 29628720 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5047772 chrX 30222802 30222973 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5047774 chrX 30223376 30223563 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5052693 chrX 33090623 33090776 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5053293 chrX 33465884 33466055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5057538 chrX 36102626 36102770 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5059949 chrX 37687061 37687265 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5060325 chrX 37879843 37879941 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5069233 chrX 42183969 42184152 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5071032 chrX 43245383 43245570 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5071034 chrX 43246144 43246447 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5071128 chrX 43297950 43298577 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5072696 chrX 44184421 44184829 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5072705 chrX 44186398 44186597 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5074804 chrX 44986860 44987304 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5075584 chrX 45427467 45427654 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5098035 chrX 56760672 56760993 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5122962 chrX 76190432 76190524 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5122992 chrX 76227918 76228068 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5125029 chrX 77422402 77422565 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5126599 chrX 78642254 78642682 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5142929 chrX 89834656 89834954 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5144184 chrX 90697505 90698244 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5151664 chrX 95632914 95633207 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5169612 chrX 106470657 106470868 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5170946 chrX 107127067 107127437 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5174026 chrX 109093334 109093649 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5176217 chrX 110363536 110363727 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5176218 chrX 110363863 110364010 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5176351 chrX 110453231 110453530 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5180900 chrX 113109968 113110328 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5180903 chrX 113110842 113111017 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5182238 chrX 113849321 113849371 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5186947 chrX 116855355 116855654 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5186950 chrX 116856342 116856687 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5187633 chrX 117301733 117301865 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5193817 chrX 120231264 120231408 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5194334 chrX 120522750 120522871 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5204112 chrX 126458371 126458451 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5206790 chrX 128234565 128234773 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5206839 chrX 128263959 128264083 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5210955 chrX 130398593 130398781 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5210956 chrX 130399059 130399226 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5212383 chrX 131299706 131299781 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5212396 chrX 131303702 131303827 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5214462 chrX 132525469 132525603 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5215670 chrX 133143676 133144033 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5215672 chrX 133144509 133144830 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5221533 chrX 136028172 136028317 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5221535 chrX 136028620 136028843 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5221537 chrX 136029304 136029371 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5223481 chrX 136997056 136997277 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5224561 chrX 137652641 137652809 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5233193 chrX 142530946 142531062 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5240530 chrX 146796912 146796993 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5242402 chrX 147948958 147949111 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5242436 chrX 147976004 147976049 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5243103 chrX 148423194 148423412 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5244191 chrX 149205910 149206025 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5246658 chrX 150447712 150447867 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5246660 chrX 150448283 150448486 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5263862 chrY 4025440 4025738 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5280102 chrY 17434607 17435004 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5280103 chrY 17435113 17435325 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5289145 chrY 23502555 23502627 0 LTR