MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER104602	chr1	46837705	46837806	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER104604	chr1	46838115	46838380	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER104606	chr1	46838693	46839039	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER148722	chr1	67362558	67364060	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER170915	chr1	80158293	80159948	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER184007	chr1	88004051	88005567	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER184009	chr1	88005869	88006010	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER216853	chr1	106845751	106847248	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER322454	chr1	187716919	187717038	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER322455	chr1	187717043	187717342	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER323027	chr1	188071932	188073461	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER323973	chr1	188673581	188674232	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER433983	chr10	921800	922043	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER433985	chr10	922349	923129	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER489788	chr10	31281153	31281342	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER489790	chr10	31281642	31283195	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER603749	chr10	97457603	97458429	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER666500	chr10	132503065	132504747	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER669161	chr10	134654595	134656131	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER677443	chr11	4486021	4486607	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER677445	chr11	4487266	4488295	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER828823	chr11	88074533	88076054	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER836625	chr11	92750709	92752272	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER836627	chr11	92752586	92752725	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER946139	chr12	19817501	19817828	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER946141	chr12	19818118	19819527	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER951447	chr12	23090666	23092412	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1002633	chr12	55021582	55023024	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1004017	chr12	55940151	55941545	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1037021	chr12	74247771	74248094	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1083394	chr12	100025090	100026496	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1083398	chr12	100027656	100027858	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1159852	chr12	133611813	133611953	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1241105	chr13	64984838	64985626	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1276677	chr13	86636407	86637847	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1280801	chr13	89191738	89193365	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1387295	chr14	57388238	57388845	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1387297	chr14	57389133	57390290	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1441944	chr14	86504026	86504408	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1441945	chr14	86504429	86505443	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1456522	chr14	93840283	93840870	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1456524	chr14	93841193	93841364	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1470229	chr14	100654607	100655308	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1488752	chr15	24228189	24228309	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1488775	chr15	24239191	24239246	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1488777	chr15	24239846	24240104	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1488925	chr15	24326559	24327778	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489159	chr15	24456495	24456697	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489331	chr15	24548779	24548898	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489343	chr15	24556250	24556452	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489732	chr15	24756487	24756607	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489742	chr15	24763307	24763509	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489876	chr15	24838945	24839330	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489878	chr15	24839641	24840684	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1749740	chr16	63190675	63191960	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1749741	chr16	63191946	63192053	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1792675	chr16	84053188	84053743	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1792677	chr16	84054053	84054686	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1792679	chr16	84054970	84055326	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1820033	chr17	6934292	6934581	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1820035	chr17	6934877	6935477	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1820037	chr17	6935519	6936157	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1820039	chr17	6936460	6936686	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1828805	chr17	10962918	10964498	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1842046	chr17	17539620	17540290	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1842048	chr17	17540608	17541240	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1842050	chr17	17541503	17541852	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1867081	chr17	32085954	32086973	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1960640	chr17	76668640	76669191	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2036984	chr18	40799473	40801145	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2122604	chr19	9499847	9499999	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2161243	chr19	29412452	29413156	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2161246	chr19	29413476	29413551	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2330323	chr2	53924690	53925330	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2330324	chr2	53925343	53926115	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2451691	chr2	126848935	126849386	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2451693	chr2	126849692	126850408	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2477846	chr2	142069431	142069633	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2518751	chr2	168271993	168273617	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2547959	chr2	185853720	185855039	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2549752	chr2	186906704	186908401	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2553922	chr2	189475094	189476400	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2556730	chr2	191144064	191144259	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2556732	chr2	191144850	191145056	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2560873	chr2	193589090	193589304	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2666534	chr20	8630506	8630642	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2823407	chr21	42172218	42172629	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2823410	chr21	42173134	42174418	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864619	chr22	31415037	31415092	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864621	chr22	31415357	31415996	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864623	chr22	31416300	31416845	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864626	chr22	31417019	31417212	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864628	chr22	31417515	31417527	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864630	chr22	31417839	31418091	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2895416	chr22	44119500	44120236	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2895418	chr22	44120550	44120805	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2974033	chr3	35604239	35604664	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2974034	chr3	35604667	35605025	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2983150	chr3	40741588	40742877	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2990484	chr3	44787886	44788144	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2990486	chr3	44788444	44788976	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3035693	chr3	68486946	68487228	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3035695	chr3	68487517	68488509	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3035703	chr3	68491194	68491294	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3062334	chr3	83984183	83985444	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3063984	chr3	84985013	84986680	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072180	chr3	93572866	93574176	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3098193	chr3	109574115	109575767	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3117338	chr3	121442912	121444489	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3125458	chr3	125738254	125739357	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3171813	chr3	151334759	151334936	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3171816	chr3	151335209	151335489	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3200678	chr3	168685918	168686244	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3221802	chr3	180728992	180729099	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3234614	chr3	186924381	186925936	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3275707	chr4	10546725	10548362	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3433648	chr4	103375860	103377416	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3454699	chr4	116388346	116389980	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3535549	chr4	165368494	165369974	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3544800	chr4	170801455	170801679	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3544803	chr4	170802614	170803776	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3544808	chr4	170804285	170804494	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3590333	chr5	8004552	8004981	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3590335	chr5	8005161	8006476	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3645468	chr5	40458888	40460360	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3645470	chr5	40460524	40460664	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3645473	chr5	40463358	40463434	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3693445	chr5	72071150	72071377	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3693448	chr5	72077949	72079462	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3708332	chr5	80124294	80124892	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3717264	chr5	85625989	85627506	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3717267	chr5	85627864	85628044	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3759434	chr5	112826183	112827535	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3759436	chr5	112827844	112828142	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3821108	chr5	148302934	148303122	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3942340	chr6	30286582	30286890	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3947037	chr6	32745264	32745844	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3947039	chr6	32746813	32747887	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3984221	chr6	52083629	52085293	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3989426	chr6	55081066	55082694	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4009693	chr6	71301911	71303387	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4009695	chr6	71303697	71303971	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4016021	chr6	74983319	74984395	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4134152	chr6	146465768	146467245	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4134154	chr6	146467523	146467691	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4157134	chr6	159379658	159380711	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4157136	chr6	159381003	159381562	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4177849	chr6_apd_hap1	4033556	4034136	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4177851	chr6_apd_hap1	4035085	4036159	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4181577	chr6_cox_hap2	1798586	1798894	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4186217	chr6_cox_hap2	4191172	4191752	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4186219	chr6_cox_hap2	4192720	4193794	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4189868	chr6_dbb_hap3	1580227	1580535	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4193936	chr6_dbb_hap3	3932471	3932945	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4194123	chr6_dbb_hap3	4027833	4028412	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4194125	chr6_dbb_hap3	4029378	4030452	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4197808	chr6_mann_hap4	1634650	1634958	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4201877	chr6_mann_hap4	4202453	4203033	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4201879	chr6_mann_hap4	4204002	4205076	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4208442	chr6_mcf_hap5	3987111	3987580	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4208630	chr6_mcf_hap5	4082460	4083040	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4208632	chr6_mcf_hap5	4084008	4085082	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4212260	chr6_qbl_hap6	1579474	1579782	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4216651	chr6_qbl_hap6	3977378	3977958	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4216653	chr6_qbl_hap6	3978927	3980001	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4220524	chr6_ssto_hap7	1616557	1616865	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4224379	chr6_ssto_hap7	4176934	4177514	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4224381	chr6_ssto_hap7	4178483	4179557	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4419618	chr7	109169421	109169631	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4419621	chr7	109169906	109170793	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4434947	chr7	118680685	118682367	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4435484	chr7	119031144	119031697	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4441678	chr7	122894981	122896506	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4512781	chr8	5035869	5037484	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4572466	chr8	37916061	37916280	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4600988	chr8	57920612	57920907	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4641321	chr8	81708744	81708948	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4641325	chr8	81709252	81710493	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4641327	chr8	81710790	81711013	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4642626	chr8	82524369	82524446	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4642717	chr8	82579722	82580057	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4642719	chr8	82580358	82580537	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4642721	chr8	82580852	82581997	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4650209	chr8	87265556	87266378	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4650211	chr8	87266894	87266996	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4654104	chr8	89611217	89611363	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4756247	chr8	144739755	144740903	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4756249	chr8	144741212	144741623	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4942073	chr9	121408503	121410292	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4986801	chrUn_gl000223	70712	70852	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5066017	chrX	40719970	40721213	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5066021	chrX	40722954	40723422	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5093598	chrX	54127139	54128459	1	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5093613	chrX	54136081	54136135	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5099524	chrX	58064371	58065451	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5100767	chrX	62794901	62794945	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5100769	chrX	62795329	62795504	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5100771	chrX	62796126	62797309	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5126156	chrX	78302962	78303040	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5148451	chrX	93526493	93526794	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5148453	chrX	93527171	93528396	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5223837	chrX	137231159	137232725	0	LTR
MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5277230	chrY	15609566	15611216	1	LTR