MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER52892	chr1	25205311	25207004	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53960	chr1	25637038	25637181	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53962	chr1	25637493	25637761	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53963	chr1	25637759	25637858	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53965	chr1	25638045	25638959	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53967	chr1	25639252	25639264	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER53969	chr1	25639431	25639511	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER54140	chr1	25705878	25705942	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER54143	chr1	25706160	25706183	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER54145	chr1	25706463	25707382	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER54147	chr1	25707563	25707936	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER54149	chr1	25708249	25708391	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER76935	chr1	34868302	34870157	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER111512	chr1	50378720	50380378	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER120096	chr1	53887139	53887318	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER125277	chr1	56095356	56095664	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER131774	chr1	59097447	59099094	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER145636	chr1	65658186	65659265	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER145641	chr1	65659856	65660151	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER145643	chr1	65660447	65660666	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER153654	chr1	69919586	69921343	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER159194	chr1	73224473	73225046	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER159196	chr1	73226150	73227090	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER164180	chr1	76310872	76312582	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER164489	chr1	76466211	76467145	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER164491	chr1	76467499	76468310	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER165553	chr1	77110135	77111712	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER165847	chr1	77271885	77272329	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER165849	chr1	77272619	77273854	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER168540	chr1	78659505	78660042	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER172422	chr1	81071706	81073369	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER198886	chr1	96192192	96192500	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER198888	chr1	96192981	96193419	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER210757	chr1	103010727	103012340	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER211011	chr1	103151159	103152146	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER214973	chr1	105701902	105701969	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER249309	chr1	147288279	147289482	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER249311	chr1	147289790	147290384	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER283859	chr1	165952826	165953677	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER304019	chr1	177524322	177525153	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER304020	chr1	177525154	177525541	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER307135	chr1	179212162	179212607	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER309814	chr1	180589470	180590215	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER332002	chr1	193410398	193412085	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER332629	chr1	193809543	193809604	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER332630	chr1	193809596	193810670	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER339636	chr1	198075675	198076116	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER339638	chr1	198076855	198077266	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER339639	chr1	198077261	198077888	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER349163	chr1	203126166	203127793	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER371688	chr1	215547597	215549246	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER374505	chr1	217479808	217480101	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER374508	chr1	217480815	217481112	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER374510	chr1	217481411	217482425	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER374515	chr1	217483018	217483084	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER377193	chr1	219027660	219028134	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER377195	chr1	219028472	219029758	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER469066	chr10	20618591	20620249	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER492525	chr10	32696399	32696863	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER492529	chr10	32697544	32698068	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER492531	chr10	32698366	32699054	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER502203	chr10	38152704	38153124	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER502205	chr10	38153368	38153404	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER507421	chr10	44333373	44335097	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER522810	chr10	53880064	53881752	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER524449	chr10	54928628	54928796	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER524450	chr10	54928794	54929046	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER524452	chr10	54929332	54929622	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER544217	chr10	66501834	66502008	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER544218	chr10	66502014	66502431	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER579677	chr10	84542286	84542467	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER579680	chr10	84545156	84545698	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER579681	chr10	84545696	84546466	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER588688	chr10	89646734	89647992	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER588689	chr10	89647981	89648051	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER591840	chr10	91395326	91396073	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER591849	chr10	91398048	91398822	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER597787	chr10	94431847	94432117	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER597791	chr10	94432880	94433134	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER605545	chr10	98397766	98397878	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER625543	chr10	108286564	108288308	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER630566	chr10	111318636	111320259	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER640605	chr10	116866889	116868033	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER640607	chr10	116868615	116869029	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER651851	chr10	122987558	122989255	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER654991	chr10	124729911	124731562	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER665964	chr10	132121704	132122107	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER679580	chr11	5932592	5932734	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER715875	chr11	25850483	25852124	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER721052	chr11	28787049	28787213	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER721056	chr11	28791139	28792760	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER721879	chr11	29262868	29263393	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER721881	chr11	29263824	29264886	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER727143	chr11	32283205	32284886	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER728477	chr11	32895176	32896273	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER728478	chr11	32896271	32896415	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER728480	chr11	32896719	32896794	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER741414	chr11	40101176	40101964	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER741416	chr11	40102594	40103578	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER746491	chr11	42982986	42984643	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER763379	chr11	56284741	56284841	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER763382	chr11	56285425	56286035	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER770290	chr11	60001067	60001821	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER770376	chr11	60055037	60055780	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER770980	chr11	60418248	60418618	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER786602	chr11	67464026	67464120	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER813008	chr11	79606252	79607608	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER825047	chr11	85972143	85973088	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER825049	chr11	85973224	85973509	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER825052	chr11	85974148	85974485	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER833024	chr11	90547688	90547811	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER833026	chr11	90548221	90548686	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER833027	chr11	90548685	90549047	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER840893	chr11	95124694	95125187	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER840894	chr11	95125184	95125377	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER842577	chr11	96131365	96131698	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER842579	chr11	96132488	96133714	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER854838	chr11	103699521	103701244	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER889059	chr11	122300116	122300766	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER889061	chr11	122301066	122302223	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER895393	chr11	125631921	125632447	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER896520	chr11	126267893	126269188	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER896522	chr11	126269502	126269862	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER901463	chr11	129424008	129425751	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER908129	chr11	133613351	133613746	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER908131	chr11	133614018	133614588	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER931363	chr12	11343671	11344185	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER931364	chr12	11344191	11344918	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER937219	chr12	14503326	14503651	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER937227	chr12	14506523	14506970	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER937229	chr12	14508475	14509316	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER937238	chr12	14511595	14511705	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER941197	chr12	16849320	16850909	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER951953	chr12	23397076	23398775	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER954701	chr12	25135615	25137285	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER955266	chr12	25417693	25418707	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER963227	chr12	30048080	30049761	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER970907	chr12	33974405	33975986	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER977747	chr12	41989354	41989863	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984452	chr12	45901926	45902130	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984454	chr12	45902674	45902689	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984456	chr12	45902714	45903833	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984458	chr12	45903940	45904270	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984462	chr12	45906673	45906767	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER987256	chr12	47537683	47538339	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER987259	chr12	47540655	47540781	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER987263	chr12	47541100	47541286	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER987265	chr12	47541476	47541727	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER998081	chr12	52553244	52553588	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER998083	chr12	52553886	52554585	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER998085	chr12	52554894	52555517	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1002940	chr12	55215778	55215829	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1014219	chr12	61651867	61652018	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1019618	chr12	64689880	64690097	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1019619	chr12	64690107	64690463	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1030674	chr12	70459157	70460789	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1043307	chr12	77706247	77707895	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1052590	chr12	83313196	83313847	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1061462	chr12	88768792	88769016	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1061464	chr12	88769316	88770216	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1061466	chr12	88770372	88770903	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1095204	chr12	105827599	105828783	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1095206	chr12	105829089	105829638	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1163832	chr13	20809068	20809390	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1163836	chr13	20810109	20810864	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1163838	chr13	20811153	20811708	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1167632	chr13	22674590	22676316	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1196927	chr13	39475487	39475699	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1197869	chr13	40017547	40017847	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1197871	chr13	40018179	40019126	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1207120	chr13	45203896	45205593	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1225821	chr13	55591832	55593475	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1229196	chr13	57667639	57668746	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1241514	chr13	65223522	65225194	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1244173	chr13	66856554	66856677	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1244175	chr13	66857065	66858464	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1252330	chr13	71937378	71937758	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1252332	chr13	71938262	71939613	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1268277	chr13	81550131	81550283	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1272270	chr13	83942674	83943106	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1274991	chr13	85586437	85588162	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1278465	chr13	87819784	87820248	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1287043	chr13	92917316	92918025	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1319072	chr13	112642558	112642912	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1319074	chr13	112643222	112643460	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1320365	chr13	113601585	113602861	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1353884	chr14	37691074	37691423	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1353886	chr14	37691655	37692116	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1356104	chr14	39077174	39078825	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1366292	chr14	45407237	45407577	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1366294	chr14	45407873	45409143	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1367987	chr14	46386843	46388433	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1388913	chr14	58381401	58382716	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1396377	chr14	62673212	62674889	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1408186	chr14	68892404	68892653	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1408189	chr14	68893093	68894552	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1415384	chr14	72613050	72613447	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1415385	chr14	72613416	72614026	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422268	chr14	75657858	75658105	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422275	chr14	75659375	75659386	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422277	chr14	75659699	75660161	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422279	chr14	75660484	75660830	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422753	chr14	75844863	75845591	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422754	chr14	75845619	75845680	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1422756	chr14	75845857	75846305	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1423204	chr14	76060072	76060798	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1435435	chr14	82557138	82557796	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1436688	chr14	83341411	83342761	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1474824	chr14	103041886	103042277	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1474826	chr14	103042583	103042697	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1474829	chr14	103043298	103043440	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1474831	chr14	103043692	103043961	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1474833	chr14	103044273	103044585	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1480882	chr14	106442322	106442745	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1480883	chr14	106442815	106443614	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1482481	chr15	20259001	20259841	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1482482	chr15	20259838	20260269	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1484276	chr15	21265784	21266595	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1484277	chr15	21266621	21267052	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1485352	chr15	22437333	22437763	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1485353	chr15	22437825	22438274	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1485355	chr15	22438887	22439235	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1487817	chr15	23757476	23757965	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1487832	chr15	23765364	23765534	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1487835	chr15	23766269	23766499	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1487837	chr15	23766808	23766998	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1507970	chr15	35513036	35513736	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1507971	chr15	35513785	35514513	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1507973	chr15	35515224	35515267	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1529636	chr15	47270834	47272589	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1536692	chr15	51272081	51273831	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1565348	chr15	66324650	66325178	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1565350	chr15	66325447	66326117	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1565352	chr15	66326428	66326719	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1567482	chr15	67240555	67241474	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1573622	chr15	70180401	70181834	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1683226	chr16	20937218	20937552	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1683228	chr16	20937857	20938367	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1683230	chr16	20938391	20938681	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1683232	chr16	20938949	20939509	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1694132	chr16	25094697	25094950	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1694294	chr16	25164443	25164570	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1697718	chr16	26582885	26583868	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1752201	chr16	64572680	64573334	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1752203	chr16	64573635	64574693	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1805717	chr17	568714	568963	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1832402	chr17	12792919	12794604	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1840716	chr17	16888818	16889227	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1840718	chr17	16889531	16890202	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1864052	chr17	30669849	30669938	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1865825	chr17	31495274	31496298	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1866765	chr17	31927472	31927616	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1866767	chr17	31927743	31929253	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1882273	chr17	39236717	39237165	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1882275	chr17	39237381	39238421	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1882310	chr17	39258432	39259598	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1895461	chr17	44994445	44995103	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1896568	chr17	45487821	45488190	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1929118	chr17	61099014	61099419	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1929120	chr17	61099719	61100711	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1929123	chr17	61100867	61101053	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1937116	chr17	65165748	65166389	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1945403	chr17	69341667	69343094	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1945405	chr17	69343405	69343659	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1950783	chr17	72087996	72088481	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1950785	chr17	72088776	72089322	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1950787	chr17	72089701	72090385	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1981558	chr18	5187733	5188394	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1981560	chr18	5188928	5189932	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2026714	chr18	34186506	34188118	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2085101	chr18	68687171	68687333	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2161057	chr19	29305533	29307110	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2176681	chr19	36876318	36877557	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2176683	chr19	36877845	36878169	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2243658	chr2	6691160	6692450	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2243660	chr2	6692813	6693117	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2267457	chr2	19855820	19856163	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2267459	chr2	19856455	19857803	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2313746	chr2	44376752	44377262	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2313748	chr2	44377553	44378575	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2313750	chr2	44378885	44379022	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2327257	chr2	52015635	52016863	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2346835	chr2	63039442	63041218	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2355680	chr2	68159726	68161317	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2355682	chr2	68161442	68161557	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2376164	chr2	79326866	79328668	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2376175	chr2	79332061	79332803	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2376177	chr2	79338960	79339239	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2376179	chr2	79339383	79339893	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2394472	chr2	89515667	89515890	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2394475	chr2	89516109	89516530	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2394921	chr2	90004526	90004947	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2394924	chr2	90005166	90005389	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2398100	chr2	95891372	95891966	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2398320	chr2	96024840	96026320	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2411682	chr2	103662444	103663608	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2411684	chr2	103663980	103664549	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2413904	chr2	105165983	105166477	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2413905	chr2	105166471	105167010	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2416549	chr2	106766149	106767739	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2418847	chr2	108054655	108056278	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2421429	chr2	109489268	109489390	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2431230	chr2	115105707	115105958	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2431232	chr2	115106265	115107683	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2457601	chr2	129994147	129995872	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2487352	chr2	148500470	148500993	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2487355	chr2	148503597	148503639	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2487357	chr2	148503667	148504743	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2490878	chr2	150808269	150809329	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2490879	chr2	150809344	150809599	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2502257	chr2	157873855	157874050	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2505564	chr2	159883185	159883539	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2505566	chr2	159883655	159884248	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2557848	chr2	191733035	191734247	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2557852	chr2	191735445	191735775	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2557854	chr2	191736156	191736346	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2561397	chr2	193925048	193925322	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2561399	chr2	193925506	193926886	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2563567	chr2	195292460	195294082	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2571475	chr2	199956555	199957584	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2571476	chr2	199957584	199958085	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2664538	chr20	7436850	7438451	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2691116	chr20	22645949	22647491	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2691118	chr20	22647754	22647936	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2693571	chr20	24331356	24331395	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2705196	chr20	32801179	32801298	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2723055	chr20	40357096	40357210	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2759418	chr20	55330029	55330654	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2759420	chr20	55330942	55331018	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2783562	chr21	20034993	20036016	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2783747	chr21	20134886	20136582	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2791767	chr21	24803471	24805300	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2792005	chr21	24926828	24928511	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2812586	chr21	36199109	36200871	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2819107	chr21	39702639	39704280	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2823271	chr21	42085871	42086739	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2909277	chr3	669229	670888	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2910746	chr3	1564818	1565752	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2919160	chr3	6278833	6280517	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2921360	chr3	7546495	7548207	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2922422	chr3	8164623	8165868	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2922426	chr3	8166917	8167177	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2922428	chr3	8167479	8167723	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2931216	chr3	12076346	12076881	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2931218	chr3	12077659	12078880	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2941086	chr3	16830070	16830220	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2941088	chr3	16830577	16832086	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2947019	chr3	20366138	20367025	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2952296	chr3	23667006	23668772	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2964277	chr3	30615688	30615912	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2964278	chr3	30615906	30616118	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2982288	chr3	40340865	40341399	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2982722	chr3	40531780	40532000	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3015829	chr3	57768781	57770443	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3027158	chr3	63830566	63830621	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3036073	chr3	68688918	68688970	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3036074	chr3	68688972	68689456	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3036475	chr3	68936077	68937705	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3066727	chr3	86827484	86829108	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072031	chr3	90293432	90293499	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072035	chr3	90294243	90295166	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072037	chr3	90295489	90295708	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072039	chr3	90296019	90296468	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072285	chr3	93631769	93631836	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072289	chr3	93632578	93633518	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072291	chr3	93633807	93634028	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3072293	chr3	93634339	93634795	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3075177	chr3	95391573	95393288	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3079392	chr3	98261423	98262092	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3086212	chr3	102330296	102330537	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3087163	chr3	102906066	102906223	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3087165	chr3	102906535	102907972	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3092044	chr3	106001688	106003294	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3102180	chr3	112146425	112148067	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3102273	chr3	112199638	112200904	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3162970	chr3	146122335	146122789	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3162977	chr3	146129950	146130323	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3162979	chr3	146130958	146131678	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3178155	chr3	155065225	155066160	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3184308	chr3	158783701	158783963	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3190909	chr3	162660184	162660488	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3190913	chr3	162661755	162663064	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3211582	chr3	175043618	175044337	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3215464	chr3	177224834	177226458	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3217733	chr3	178619227	178619520	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3217735	chr3	178619816	178621409	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3218873	chr3	179193739	179195379	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3218875	chr3	179195496	179195726	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3277367	chr4	11387292	11389032	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3280634	chr4	13108134	13109780	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3283936	chr4	14842981	14844544	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3292219	chr4	18995809	18997508	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3298490	chr4	22557595	22559331	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3300111	chr4	23435491	23437275	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3300496	chr4	23664312	23664999	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3300499	chr4	23665628	23666632	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3309079	chr4	27894918	27896594	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3321335	chr4	35173441	35173716	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3321337	chr4	35174141	35175509	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3336972	chr4	43053623	43053663	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3336976	chr4	43054353	43055976	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3341079	chr4	45551041	45551628	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3354930	chr4	56423787	56423990	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3366736	chr4	63313187	63313421	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3368867	chr4	64630090	64630139	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3375146	chr4	68551146	68551293	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3382339	chr4	72912314	72913090	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3408046	chr4	87840329	87840468	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3408048	chr4	87840778	87840905	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3408050	chr4	87841202	87841631	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3417221	chr4	93253629	93254879	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3417223	chr4	93255181	93255582	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3418672	chr4	94147273	94148415	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3418674	chr4	94148678	94149283	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3424651	chr4	97924902	97925015	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3424652	chr4	97925038	97925652	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3428824	chr4	100393990	100394569	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3429955	chr4	101065512	101065725	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3429957	chr4	101066031	101067516	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3433162	chr4	103085598	103085748	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3433165	chr4	103086303	103087873	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3445264	chr4	110597166	110597412	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3445266	chr4	110597553	110597652	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3445267	chr4	110597646	110597815	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3445269	chr4	110597876	110598085	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3445270	chr4	110598089	110598632	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3453985	chr4	115941146	115941628	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3453997	chr4	115944732	115945933	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3456823	chr4	117709725	117710189	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3456825	chr4	117710256	117710586	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3463581	chr4	121847947	121849534	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3469597	chr4	125543713	125545401	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3471062	chr4	126476747	126477913	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3471064	chr4	126478290	126478619	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3471067	chr4	126479008	126479259	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3471287	chr4	126607470	126608164	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3471289	chr4	126608581	126608944	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3483416	chr4	133919438	133920161	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3485658	chr4	135407506	135407679	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3485660	chr4	135408107	135408134	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3495444	chr4	141243322	141244104	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3497799	chr4	142637409	142638380	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3504036	chr4	146532452	146532950	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3504039	chr4	146533011	146533108	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3504041	chr4	146533757	146534788	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3504513	chr4	146836779	146838389	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3508853	chr4	149525794	149527466	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3518029	chr4	154667109	154668973	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3527520	chr4	160411888	160412270	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3527524	chr4	160413385	160414731	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3529450	chr4	161703758	161704242	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3529453	chr4	161705009	161706124	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3538712	chr4	167145489	167147123	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3593462	chr5	10156560	10158278	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3598891	chr5	13500001	13501531	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3598893	chr5	13501839	13501955	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3601461	chr5	15076891	15078610	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3613016	chr5	21864739	21865946	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3613024	chr5	21868437	21869016	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3620723	chr5	26372512	26373011	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3620725	chr5	26373319	26374510	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3624096	chr5	28374515	28375684	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3624854	chr5	28834824	28836498	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3644877	chr5	40070675	40072349	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3645326	chr5	40367918	40368645	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3645327	chr5	40368624	40369393	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3651325	chr5	44021949	44023625	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3673663	chr5	61140753	61142550	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3695049	chr5	72961679	72962443	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3695051	chr5	72963126	72964073	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3708862	chr5	80413409	80415047	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3712188	chr5	82422340	82423024	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3741052	chr5	101126833	101128438	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3747023	chr5	104954697	104954968	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3751928	chr5	108094888	108095210	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3754318	chr5	109629276	109630698	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3759700	chr5	112977203	112978905	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3770679	chr5	119849955	119850688	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3776506	chr5	123579044	123579184	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3776515	chr5	123586116	123586319	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3776666	chr5	123673740	123674063	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3778792	chr5	125064689	125065089	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3778801	chr5	125079021	125080277	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3783572	chr5	128038051	128039511	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3786827	chr5	130181324	130181837	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3812551	chr5	143804479	143806133	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3817925	chr5	146583232	146583922	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3817927	chr5	146584233	146584587	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3830061	chr5	152385460	152386435	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3830062	chr5	152386444	152386876	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3830064	chr5	152386919	152387014	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3843055	chr5	158845962	158847645	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3866567	chr5	171464938	171465651	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3929874	chr6	23684293	23685938	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3936936	chr6	27413529	27414641	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3936938	chr6	27414836	27415113	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3939203	chr6	28517403	28518302	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3962801	chr6	40239925	40240219	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3962802	chr6	40240255	40240787	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3962804	chr6	40241090	40241679	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3972948	chr6	45102140	45102477	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3972949	chr6	45102478	45103357	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4011400	chr6	72355539	72356614	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4011848	chr6	72647522	72649175	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4029310	chr6	83489959	83490067	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4029311	chr6	83490182	83490305	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4029314	chr6	83490801	83492236	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4029316	chr6	83492542	83492599	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4045853	chr6	93478886	93480555	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4063140	chr6	104698887	104700497	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4063573	chr6	104987978	104988473	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4063574	chr6	104988471	104989060	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4065501	chr6	106105064	106106412	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4079514	chr6	113475274	113475590	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4079516	chr6	113475900	113477154	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4079518	chr6	113477527	113477652	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4091002	chr6	120593671	120594317	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4093747	chr6	122282615	122282744	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4095282	chr6	123191712	123192263	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4095284	chr6	123192709	123193838	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4097989	chr6	124971922	124973680	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4111725	chr6	133553983	133554941	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4111727	chr6	133555247	133555842	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4113927	chr6	134731263	134732277	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4113932	chr6	134734509	134734622	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4120860	chr6	138635567	138635910	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4146444	chr6	153277781	153278570	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4146446	chr6	153278860	153278955	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4146455	chr6	153280945	153281210	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4151580	chr6	156136543	156138016	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4158759	chr6	160365403	160366713	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4166484	chr6	165354509	165356155	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4167262	chr6	165866222	165867868	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4168158	chr6	166474586	166476111	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4178468	chr6_cox_hap2	39605	40506	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4252991	chr7	15218751	15220392	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4292690	chr7	38554436	38554837	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4292694	chr7	38557200	38558461	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4298773	chr7	41903708	41904492	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4298776	chr7	41905554	41906383	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4303345	chr7	44537041	44537408	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4303346	chr7	44537410	44537840	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4303348	chr7	44537970	44538225	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4304583	chr7	44991475	44991829	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4304587	chr7	44992420	44993554	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4312725	chr7	49996947	49997947	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4322015	chr7	55850786	55851057	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4322017	chr7	55851256	55851571	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4322019	chr7	55851878	55852146	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4331353	chr7	64485760	64485888	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4331355	chr7	64486192	64486260	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4331359	chr7	64487041	64487292	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4333269	chr7	65326811	65326941	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4333271	chr7	65327255	65327323	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4333275	chr7	65328084	65328334	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4334163	chr7	65623135	65623267	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4367001	chr7	79428367	79429538	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4367005	chr7	79430098	79430510	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4371580	chr7	82248808	82248850	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4371582	chr7	82249142	82250756	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4427057	chr7	113826223	113827779	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4428686	chr7	114885922	114886471	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4437188	chr7	120120888	120122527	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477221	chr7	142112747	142113107	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477255	chr7	142150295	142150636	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477275	chr7	142169582	142169940	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477949	chr7	142718805	142719169	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477951	chr7	142719593	142720757	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4477953	chr7	142721068	142721180	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4481368	chr7	144806991	144807170	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4486102	chr7	147731721	147733375	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4535784	chr8	18500876	18501299	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4535785	chr8	18501304	18502306	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4538022	chr8	19719457	19720667	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4538595	chr8	20018577	20018794	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4538597	chr8	20019118	20019461	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4538598	chr8	20019465	20020493	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4541319	chr8	21491893	21492900	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4575140	chr8	39197460	39198571	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4575142	chr8	39198872	39199561	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4587225	chr8	49661295	49661912	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4587229	chr8	49662289	49663256	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4591514	chr8	52458427	52458538	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4591520	chr8	52465431	52466036	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4591522	chr8	52466704	52467598	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4591582	chr8	52501827	52503500	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4615740	chr8	67139104	67139539	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4615743	chr8	67139721	67140465	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4615749	chr8	67149023	67149220	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4615752	chr8	67151120	67151443	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4629930	chr8	74912339	74912436	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4629931	chr8	74912429	74912929	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4631935	chr8	76122223	76122244	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4631937	chr8	76122540	76124062	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643652	chr8	83109472	83109688	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643654	chr8	83109923	83110157	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643655	chr8	83110200	83110800	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643740	chr8	83155371	83156311	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643741	chr8	83156326	83156962	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4654645	chr8	89978872	89980502	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4660862	chr8	93907564	93909033	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4660864	chr8	93909345	93909584	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4667357	chr8	97334889	97336641	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4668189	chr8	97793835	97795471	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4672504	chr8	99989862	99990944	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4672506	chr8	99991251	99991855	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4686356	chr8	107469699	107471342	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4695520	chr8	112928615	112929043	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4695522	chr8	112929516	112930811	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4700077	chr8	115694105	115695734	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4710736	chr8	121636836	121637270	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4734916	chr8	133213526	133215168	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4744652	chr8	138088203	138088494	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4748433	chr8	140189440	140189490	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4754429	chr8	143687152	143687258	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4754979	chr8	144030392	144030957	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4761882	chr9	1671588	1673213	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4789737	chr9	18452398	18453745	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4795502	chr9	21767076	21767956	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4796823	chr9	22620745	22621490	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4796824	chr9	22621565	22622085	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4807966	chr9	29637977	29638167	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808533	chr9	29997053	29997296	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808535	chr9	29998966	29999138	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808537	chr9	29999482	29999510	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808538	chr9	30000002	30000039	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808540	chr9	30000481	30000576	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808542	chr9	30000615	30001023	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4808544	chr9	30002111	30002846	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4810531	chr9	31271518	31272113	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4810533	chr9	31272356	31272874	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4810535	chr9	31273406	31273969	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4819949	chr9	36146382	36146961	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4823238	chr9	37550823	37552325	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4853406	chr9	74802486	74804083	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4853408	chr9	74804394	74804474	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4853410	chr9	74804780	74804827	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4855190	chr9	75710017	75711123	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4855192	chr9	75711449	75711770	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4855194	chr9	75712107	75712316	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4864990	chr9	81209799	81210783	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4868071	chr9	83108680	83110408	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4876255	chr9	87734604	87735242	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4878129	chr9	88716699	88716783	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4878131	chr9	88717094	88718391	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4909854	chr9	105736852	105737192	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4909856	chr9	105737507	105738504	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4909858	chr9	105738725	105739223	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4977435	chr9	137628439	137629382	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4980582	chr9	139827449	139829002	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5005099	chrX	6875656	6875899	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5005103	chrX	6876815	6878243	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5025808	chrX	18389390	18389569	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5025810	chrX	18389834	18390805	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5031456	chrX	21214532	21215233	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5031458	chrX	21215697	21215977	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5037569	chrX	24432726	24432827	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5040169	chrX	25884010	25884074	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049300	chrX	31021074	31021843	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049301	chrX	31021865	31022027	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049303	chrX	31022334	31022882	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5050419	chrX	31673443	31673643	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5053505	chrX	33619444	33619509	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5060213	chrX	37817818	37818465	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5060215	chrX	37819034	37820019	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5060217	chrX	37820337	37820439	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5077143	chrX	46297107	46298532	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5077146	chrX	46300265	46300487	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5083078	chrX	48709151	48709552	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5083080	chrX	48709844	48710059	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5090992	chrX	53091410	53091738	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5090994	chrX	53092011	53093400	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5117796	chrX	72233752	72233996	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5122565	chrX	75866653	75868407	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5129705	chrX	80904860	80905639	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5131529	chrX	82115756	82116160	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5136558	chrX	85791960	85792783	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5136560	chrX	85793151	85793471	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5137065	chrX	86161776	86161999	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5137067	chrX	86162823	86164289	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5138226	chrX	86933786	86934336	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5138228	chrX	86934886	86935719	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5138230	chrX	86936414	86936541	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5138718	chrX	87259140	87259259	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5138721	chrX	87261117	87262693	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5139388	chrX	87682740	87683201	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5139390	chrX	87683501	87683751	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5140617	chrX	88392658	88392908	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5141682	chrX	89052427	89053091	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5141684	chrX	89053402	89054456	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5141851	chrX	89154286	89155440	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5156303	chrX	98473594	98475170	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5161302	chrX	101494571	101495908	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5161622	chrX	101701115	101702454	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5162154	chrX	102077899	102079031	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5162156	chrX	102079337	102079885	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163330	chrX	102695081	102695291	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163334	chrX	102695854	102696176	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163336	chrX	102696474	102697755	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163381	chrX	102727285	102727600	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163383	chrX	102727899	102728948	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5163385	chrX	102729252	102729575	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5167233	chrX	104955542	104956382	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5167235	chrX	104956678	104958427	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5189211	chrX	118009017	118009858	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5189215	chrX	118010605	118010840	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5195103	chrX	121017493	121017572	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5195461	chrX	121280831	121282349	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5195463	chrX	121282579	121282787	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5201101	chrX	124419899	124420812	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5201103	chrX	124422581	124423395	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5202759	chrX	125563732	125565405	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5205611	chrX	127486625	127488321	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5205838	chrX	127641301	127642973	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5205840	chrX	127644157	127644205	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5207089	chrX	128431460	128432075	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5207091	chrX	128432357	128433348	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5207092	chrX	128433943	128434048	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5224967	chrX	137912254	137912844	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5224969	chrX	137912893	137913807	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5224971	chrX	137920822	137921115	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5225556	chrX	138239865	138239957	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5225565	chrX	138247077	138248002	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5225566	chrX	138248017	138248288	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5225568	chrX	138248652	138248746	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5226653	chrX	138932262	138932791	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5226655	chrX	138933095	138934190	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5226665	chrX	138939960	138940040	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5231367	chrX	141467616	141467843	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5231371	chrX	141468270	141469726	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5236308	chrX	144378326	144379129	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5249787	chrX	152360249	152360375	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5249795	chrX	152367303	152368268	1	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5262739	chrY	3320198	3320862	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5262741	chrY	3321184	3322234	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5262905	chrY	3424453	3425607	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5286958	chrY	21637760	21638759	0	LTR
MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5286960	chrY	21639064	21639388	0	LTR