MamRep1527|LTR|LTR-HOMER52 chr1 42370 42504 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4194 chr1 2795743 2795910 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4196 chr1 2796253 2796387 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER6838 chr1 4696215 4696318 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER7198 chr1 4927865 4928363 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER25418 chr1 13447608 13447775 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER25422 chr1 13448370 13448620 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER27235 chr1 14284914 14285047 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER27237 chr1 14285293 14285618 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER36327 chr1 18038368 18038676 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER41652 chr1 20243676 20244057 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER62615 chr1 28101738 28101824 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER62617 chr1 28102122 28102625 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER77792 chr1 34025974 34026027 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER77794 chr1 34026305 34026499 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER77795 chr1 34026536 34026654 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER78455 chr1 34330771 34330931 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER78456 chr1 34330962 34331258 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER79214 chr1 34690307 34690424 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER80932 chr1 35334733 35334801 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER84334 chr1 36725575 36725788 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER84342 chr1 36727142 36727616 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER87608 chr1 38194762 38195260 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER90187 chr1 39239711 39239869 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER93463 chr1 40542669 40542875 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER96659 chr1 41943724 41943858 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER96661 chr1 41944303 41944445 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER98977 chr1 42999633 42999787 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER98986 chr1 43001141 43001272 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER99136 chr1 43049866 43050104 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER99137 chr1 43050118 43050230 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER99373 chr1 43144186 43144373 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER100129 chr1 43511906 43512622 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER107617 chr1 46661751 46661889 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER107619 chr1 46662194 46662463 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER107621 chr1 46662726 46662767 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER107623 chr1 46663707 46663823 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112205 chr1 48940755 48940868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112208 chr1 48942058 48942186 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER115290 chr1 50496166 50496298 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER115317 chr1 50505065 50505282 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER116794 chr1 51169906 51170069 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER121020 chr1 52718659 52718738 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER122774 chr1 53398313 53398406 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER128852 chr1 56065360 56065753 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER129142 chr1 56197865 56198057 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER129144 chr1 56198216 56198467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER130838 chr1 56939034 56939809 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131044 chr1 57042796 57042827 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131046 chr1 57042878 57043231 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131050 chr1 57044362 57044859 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER138496 chr1 60422280 60422483 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER145303 chr1 63611350 63611553 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER145538 chr1 63712859 63713757 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER146779 chr1 64303941 64304155 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER149781 chr1 65704924 65705118 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER149981 chr1 65820206 65820314 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER157122 chr1 69610734 69611176 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER157482 chr1 69824419 69824521 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER159890 chr1 71203706 71203964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER161384 chr1 72139923 72140207 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER162053 chr1 72582078 72582178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER163798 chr1 73736308 73736423 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER166167 chr1 75232262 75232408 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER168100 chr1 76317555 76317694 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER169011 chr1 76834890 76835020 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER169766 chr1 77288249 77288472 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER173072 chr1 79085478 79085622 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER174144 chr1 79730269 79730797 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER174275 chr1 79799954 79800344 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER175929 chr1 80882542 80882844 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER178261 chr1 82371530 82371846 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER178769 chr1 82669162 82669604 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER180093 chr1 83492018 83492155 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER181411 chr1 84277842 84278014 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER181413 chr1 84278707 84278832 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER182269 chr1 84749699 84749782 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER184938 chr1 86198937 86199335 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER188561 chr1 88334366 88334661 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189610 chr1 88909268 88909361 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189612 chr1 88909789 88909838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189791 chr1 89001490 89001697 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER201556 chr1 95209503 95209646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER203206 chr1 96217473 96217861 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER204138 chr1 96749350 96749574 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER206738 chr1 98390352 98390456 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER208129 chr1 99194110 99194226 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER209265 chr1 99825906 99825951 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER209266 chr1 99826170 99826319 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER210809 chr1 100523209 100523319 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER210810 chr1 100523335 100523790 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER212232 chr1 101320210 101320273 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER212234 chr1 101320572 101320970 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER212549 chr1 101498856 101498963 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER212600 chr1 101533526 101534039 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER212670 chr1 101569397 101569969 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER215798 chr1 103582484 103582975 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER219194 chr1 105824986 105825073 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER219832 chr1 106235110 106235167 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER221484 chr1 107247503 107248031 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER221487 chr1 107248337 107248487 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER223517 chr1 108531512 108532113 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER223518 chr1 108532183 108532348 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER230678 chr1 112331738 112332383 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER232885 chr1 113228401 113228869 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER232903 chr1 113237599 113237940 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER232905 chr1 113238002 113238301 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER233053 chr1 113321327 113321615 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER240470 chr1 117216751 117216853 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244077 chr1 119297502 119297673 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244079 chr1 119297995 119298341 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244081 chr1 119298500 119298866 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER244785 chr1 119778688 119778738 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER244787 chr1 119779036 119779077 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER245660 chr1 120272966 120273152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245865 chr1 120375506 120375650 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245871 chr1 120376307 120376533 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245872 chr1 120376558 120376682 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER246303 chr1 120625236 120625422 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247240 chr1 121135777 121136038 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247242 chr1 121136319 121136515 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247244 chr1 121136828 121136878 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER249527 chr1 143923718 143924456 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER249529 chr1 143924768 143924818 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250648 chr1 144502316 144502418 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250649 chr1 144502465 144502691 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250655 chr1 144503348 144503492 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252951 chr1 145753510 145753719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252953 chr1 145754008 145754149 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252968 chr1 145758568 145758810 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252969 chr1 145758965 145759043 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254323 chr1 146430708 146430845 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254328 chr1 146431520 146431746 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254329 chr1 146431771 146431898 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER255429 chr1 147028501 147028553 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER255764 chr1 147239649 147239719 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER258808 chr1 148884825 148885011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259224 chr1 149141245 149141372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259225 chr1 149141397 149141619 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259231 chr1 149142288 149142432 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER259435 chr1 149245256 149245442 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER261251 chr1 150180533 150180643 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER275462 chr1 156590980 156591186 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER281920 chr1 160430077 160430872 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER285999 chr1 162456527 162456695 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER286209 chr1 162536564 162536985 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER286211 chr1 162537279 162537362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287687 chr1 163318962 163319148 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287688 chr1 163319197 163319304 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER290086 chr1 164748107 164748242 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER290087 chr1 164748525 164748659 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER291591 chr1 165586820 165587097 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER292488 chr1 165990593 165990698 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER292679 chr1 166110528 166110662 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER293101 chr1 166361610 166361802 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER293105 chr1 166364450 166364526 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER293360 chr1 166509201 166509520 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293369 chr1 166511604 166511747 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293371 chr1 166511958 166512110 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293373 chr1 166512321 166512702 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER294392 chr1 167131258 167131294 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER294394 chr1 167131699 167131823 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER294396 chr1 167132118 167132205 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER296260 chr1 168077053 168077160 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER296261 chr1 168077231 168077719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER301158 chr1 170882285 170882863 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER304142 chr1 172543303 172543653 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER304143 chr1 172543953 172544134 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER304206 chr1 172583233 172583359 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER304512 chr1 172758954 172759204 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER304837 chr1 172953893 172954493 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER309764 chr1 175612919 175612980 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER309959 chr1 175726450 175726654 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER309961 chr1 175726790 175727284 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER311485 chr1 176540966 176541147 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER312937 chr1 177422066 177422130 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER320264 chr1 181216367 181216505 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER325083 chr1 183815356 183815451 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER325085 chr1 183816224 183816357 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER326589 chr1 184643812 184644043 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER326889 chr1 184785774 184786072 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER326891 chr1 184786098 184786434 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328919 chr1 185897792 185897898 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328920 chr1 185898416 185898973 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328925 chr1 185899593 185899770 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER329125 chr1 186041830 186042635 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331024 chr1 187202547 187202715 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331505 chr1 187487919 187488154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331506 chr1 187488223 187488353 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER336416 chr1 190575649 190575881 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER337728 chr1 191458978 191459105 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER344539 chr1 195658475 195658800 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER349718 chr1 199015373 199015581 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER350765 chr1 199656713 199656795 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER352932 chr1 200635978 200636092 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER354035 chr1 201182315 201182522 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364574 chr1 206154614 206154875 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364576 chr1 206155156 206155352 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364578 chr1 206155662 206155715 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER367256 chr1 207624303 207624885 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER367443 chr1 207725882 207726002 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER367445 chr1 207726303 207726705 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER367447 chr1 207727002 207727077 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER372807 chr1 210729995 210730099 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER377274 chr1 212834051 212834128 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER378544 chr1 213473040 213473384 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER378545 chr1 213473563 213473644 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER383827 chr1 216777748 216777806 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER383829 chr1 216778501 216778770 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER388644 chr1 219616355 219616768 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER390002 chr1 220326866 220326965 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER390004 chr1 220327279 220327317 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER390333 chr1 220500806 220501020 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER390350 chr1 220509460 220509528 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER393320 chr1 222224007 222224124 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER394780 chr1 223015394 223015539 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER395579 chr1 223454609 223454825 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER396708 chr1 224042898 224043017 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER396715 chr1 224046227 224046335 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER403107 chr1 227095264 227095401 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER403950 chr1 227472190 227472350 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER407410 chr1 229505485 229505569 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER411621 chr1 231666875 231667000 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER412079 chr1 231926853 231927021 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER413485 chr1 232813984 232814035 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER414845 chr1 233567269 233567534 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER418857 chr1 235534949 235535039 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER418859 chr1 235535293 235535642 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER420535 chr1 236311606 236312064 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER421648 chr1 236814041 236814207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER422469 chr1 237235017 237235211 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER422470 chr1 237235280 237235912 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER423575 chr1 237896417 237896858 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER423752 chr1 238005710 238005776 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER423756 chr1 238006970 238007143 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER424191 chr1 238250637 238250924 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER427369 chr1 240048683 240049038 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER432840 chr1 242878364 242878501 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER432841 chr1 242878636 242878922 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER434310 chr1 243656148 243656265 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER442004 chr1 247467880 247468023 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER442005 chr1 247468091 247468303 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER446543 chr10 1844741 1844802 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER448088 chr10 2874248 2874448 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER448979 chr10 3437382 3437462 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER448980 chr10 3437477 3437716 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER451012 chr10 4754640 4754866 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER458984 chr10 9052027 9052144 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER470781 chr10 15180757 15180842 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER470805 chr10 15188852 15188966 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER470986 chr10 15276987 15277092 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER472366 chr10 16031691 16032061 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER476386 chr10 18102356 18102507 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER476388 chr10 18103040 18103345 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER477142 chr10 18479334 18479491 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477770 chr10 18834864 18835217 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477771 chr10 18835243 18835341 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477777 chr10 18836618 18836662 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477779 chr10 18836966 18837182 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER478257 chr10 19110732 19111173 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER479722 chr10 19952466 19952576 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER482254 chr10 21376904 21377057 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER482256 chr10 21377366 21377526 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER483687 chr10 21995399 21995752 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER487031 chr10 23753659 23753773 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490801 chr10 25726078 25726345 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490809 chr10 25728924 25728965 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490811 chr10 25729193 25729256 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER497532 chr10 29052269 29052356 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER498227 chr10 29397402 29397615 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER500827 chr10 30578960 30579090 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER500829 chr10 30579255 30579758 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER503005 chr10 31821126 31821606 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER503782 chr10 32166701 32166817 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER504338 chr10 32393911 32394056 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER504339 chr10 32394051 32394260 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER505874 chr10 33361322 33361473 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER510060 chr10 35542636 35542953 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER510065 chr10 35544886 35545030 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER523725 chr10 46554369 46554805 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER524763 chr10 47101324 47101394 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER524764 chr10 47101523 47101632 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER527520 chr10 48749849 48750086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER528327 chr10 49275895 49276295 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER530398 chr10 50471674 50471753 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER534761 chr10 53136834 53136936 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER539666 chr10 56305991 56306356 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER539668 chr10 56306786 56307074 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541280 chr10 57311914 57312107 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541490 chr10 57462698 57462923 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541492 chr10 57463721 57463808 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER544611 chr10 59317509 59317639 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER546373 chr10 60313231 60313321 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER547581 chr10 61016391 61016560 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER547804 chr10 61147111 61147935 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER553827 chr10 64336510 64337253 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER557004 chr10 66222833 66223023 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER558012 chr10 66833827 66834175 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER558922 chr10 67431580 67431791 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER559438 chr10 67775585 67775694 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER564972 chr10 69996553 69996718 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER570209 chr10 72358193 72358330 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER570211 chr10 72358699 72358861 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER580207 chr10 77208039 77208241 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER584628 chr10 79322948 79323157 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER586965 chr10 80526128 80526223 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER586966 chr10 80526448 80526612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER587233 chr10 80654064 80654253 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER589256 chr10 81884240 81884397 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER589259 chr10 81885079 81885647 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER589946 chr10 82302831 82303005 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER590011 chr10 82336442 82336495 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591704 chr10 83346293 83346678 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591741 chr10 83364801 83365078 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER592862 chr10 84010493 84010710 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER592963 chr10 84057090 84057145 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER592965 chr10 84057682 84057843 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER593175 chr10 84165078 84165216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER593176 chr10 84165662 84165867 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER594783 chr10 85106811 85107706 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER595087 chr10 85305165 85305635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER595837 chr10 85777147 85777203 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER599885 chr10 87848883 87849103 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER599886 chr10 87849326 87849441 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER600149 chr10 88004616 88004689 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601870 chr10 88971513 88971626 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601871 chr10 88971776 88971912 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601873 chr10 88972207 88972396 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER602546 chr10 89342289 89342503 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER602547 chr10 89342565 89342870 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER603393 chr10 89761805 89761901 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER606092 chr10 91310481 91310892 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER606094 chr10 91311196 91311261 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER606655 chr10 91626853 91627094 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER612274 chr10 94053785 94053889 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER612445 chr10 94130145 94130286 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER612448 chr10 94131222 94131310 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER614256 chr10 95193566 95193995 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER615491 chr10 95798600 95798740 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER615885 chr10 96003209 96003417 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER617346 chr10 96722626 96722714 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER617347 chr10 96722894 96723184 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER619939 chr10 97784312 97784509 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER620524 chr10 98042951 98043181 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER628722 chr10 102034298 102034354 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER628724 chr10 102034662 102034743 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631425 chr10 103204701 103204825 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631427 chr10 103205033 103205440 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631436 chr10 103213665 103213901 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631438 chr10 103214380 103214399 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER636148 chr10 105586970 105587169 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER636149 chr10 105587270 105587547 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER636618 chr10 105858106 105858434 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER636667 chr10 105881808 105881950 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER637084 chr10 106143463 106143834 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER637113 chr10 106159211 106159568 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER637115 chr10 106159676 106159894 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER638527 chr10 106938240 106938933 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER642985 chr10 109640195 109640304 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER646189 chr10 111363145 111363290 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER654256 chr10 115776811 115776874 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER659379 chr10 118603538 118603672 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER664775 chr10 121267253 121267379 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER664777 chr10 121267766 121267848 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER665060 chr10 121419952 121420122 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER665249 chr10 121547915 121548032 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER666607 chr10 122178895 122179024 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER666608 chr10 122179235 122179445 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER667170 chr10 122479026 122479177 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER668737 chr10 123442899 123443295 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER673990 chr10 126407472 126407558 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER675567 chr10 127438186 127438290 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER677481 chr10 128779022 128779185 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER678088 chr10 129275493 129275680 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER679157 chr10 130181539 130181684 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER691922 chr11 4207029 4207090 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER691924 chr11 4207422 4207532 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER692463 chr11 4578781 4578832 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER692464 chr11 4579020 4579170 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER693886 chr11 5557634 5557891 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER694447 chr11 5895059 5895298 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER696270 chr11 6971734 6972166 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER696272 chr11 6972384 6972612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698621 chr11 8416635 8417249 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698622 chr11 8417341 8417398 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER704212 chr11 11035031 11035152 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER704215 chr11 11035619 11035930 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER704217 chr11 11035979 11036159 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER704375 chr11 11115988 11116322 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER705007 chr11 11467997 11468468 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER706848 chr11 12461333 12462165 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER709458 chr11 13891770 13891903 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713147 chr11 15784391 15785265 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713468 chr11 15944278 15944352 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713470 chr11 15944585 15944823 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713472 chr11 15945451 15945713 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER721390 chr11 20016475 20016570 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER721392 chr11 20017040 20017120 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER723610 chr11 21150221 21150462 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER723613 chr11 21151226 21151413 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725108 chr11 21990015 21990210 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725110 chr11 21990626 21990938 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725113 chr11 21992467 21992529 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725450 chr11 22187658 22188066 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725452 chr11 22188712 22188804 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725936 chr11 22460929 22461359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER726174 chr11 22585053 22585254 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER726632 chr11 22877976 22878055 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER735902 chr11 28350917 28351114 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER736123 chr11 28499256 28500000 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER736124 chr11 28500048 28500108 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER737211 chr11 29099437 29099694 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER737743 chr11 29396266 29396747 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738269 chr11 29688258 29688795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738271 chr11 29688865 29688932 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738273 chr11 29689212 29689362 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER740826 chr11 31154613 31154735 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER740828 chr11 31155074 31155243 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER751386 chr11 36519984 36520263 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER751388 chr11 36520576 36520826 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751697 chr11 36714672 36715160 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751699 chr11 36715465 36715565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751701 chr11 36715756 36715820 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751850 chr11 36783103 36783157 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER754751 chr11 38544687 38545167 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER758549 chr11 40830317 40830547 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER758550 chr11 40831225 40831355 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER760449 chr11 41878831 41879026 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER761810 chr11 42633030 42633172 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER763036 chr11 43285626 43285799 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER770081 chr11 46598195 46598307 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER770082 chr11 46598303 46598418 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER770084 chr11 46598715 46598740 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER770086 chr11 46599037 46599056 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER770089 chr11 46599672 46599836 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER773385 chr11 47912366 47912460 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER773388 chr11 47913109 47913167 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER774232 chr11 48240649 48240718 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER774234 chr11 48241018 48241563 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER775847 chr11 49510867 49511019 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER780087 chr11 56813848 56814007 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784316 chr11 58902615 58902743 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784317 chr11 58903095 58903263 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784430 chr11 58965284 58965420 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784431 chr11 58965685 58966008 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784563 chr11 59060139 59060299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784564 chr11 59060599 59060919 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784632 chr11 59103927 59104086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784633 chr11 59104373 59104701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784682 chr11 59134194 59134275 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784684 chr11 59135189 59135556 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784954 chr11 59308562 59308820 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER789164 chr11 61425669 61425745 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER797513 chr11 65245215 65245347 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER797515 chr11 65245660 65245738 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER806262 chr11 68950727 68950818 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER809759 chr11 70696444 70696527 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER810685 chr11 71287236 71287446 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER811019 chr11 71457130 71457408 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER812037 chr11 71989382 71989867 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER817511 chr11 74272142 74272210 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER817513 chr11 74272243 74272969 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824533 chr11 77305107 77305238 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824535 chr11 77305601 77305882 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824537 chr11 77306247 77306449 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER825462 chr11 77658479 77658534 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER830522 chr11 79828997 79829188 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER830704 chr11 79920702 79920804 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER835783 chr11 82639328 82639624 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER835786 chr11 82640481 82640827 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER837106 chr11 83253314 83253473 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER839224 chr11 84359477 84359655 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER845870 chr11 87891115 87891480 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER847376 chr11 88758145 88758189 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER847984 chr11 89113611 89114007 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER852662 chr11 91932791 91932932 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER853049 chr11 92167590 92167782 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER853050 chr11 92167802 92168097 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER854485 chr11 93036322 93036412 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER854509 chr11 93048981 93049088 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER858297 chr11 95141287 95141457 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER860500 chr11 96422768 96423023 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER860848 chr11 96664544 96664646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER860849 chr11 96664737 96664795 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER861875 chr11 97402391 97402569 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER863177 chr11 98193463 98193588 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER866522 chr11 100344156 100344266 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER866526 chr11 100345783 100345859 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER866886 chr11 100588553 100588765 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870286 chr11 102494847 102495401 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870287 chr11 102495447 102495545 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870691 chr11 102700697 102700777 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870693 chr11 102701543 102702010 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870694 chr11 102702126 102702272 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870988 chr11 102885390 102885881 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER871870 chr11 103366235 103366278 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER873139 chr11 104143806 104144014 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER873438 chr11 104313904 104314059 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER873439 chr11 104314098 104314365 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER875949 chr11 105843454 105843686 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER878306 chr11 107286384 107286603 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER878604 chr11 107458850 107458956 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER883057 chr11 109600251 109600453 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER884222 chr11 110259400 110259481 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER884380 chr11 110325937 110326068 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER885330 chr11 110837858 110838077 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER885332 chr11 110838304 110838352 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER889002 chr11 112711392 112712000 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER890434 chr11 113565807 113565948 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER916369 chr11 126882440 126883112 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER917421 chr11 127523521 127524274 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER918319 chr11 128058033 128058217 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER919495 chr11 128820269 128820573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925023 chr11 131952649 131953342 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925169 chr11 132043219 132043359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925170 chr11 132043530 132043978 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER925598 chr11 132365592 132365689 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER926542 chr11 133001237 133002172 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER926571 chr11 133017753 133018254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927369 chr11 133557532 133557743 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927371 chr11 133558110 133558344 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER927510 chr11 133652046 133652284 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER927511 chr11 133652453 133652551 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER928740 chr11 134446902 134447260 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER930490 chr11_JH159137v1_alt 131690 131849 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER940657 chr12 3652270 3652381 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER940675 chr12 3660892 3661604 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER941814 chr12 4198234 4198413 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER942915 chr12 4777036 4777679 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER948600 chr12 7727249 7727319 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER948602 chr12 7727637 7727766 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951336 chr12 8903962 8904071 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951338 chr12 8904487 8904647 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951362 chr12 8910224 8910426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER954161 chr12 10576651 10576755 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955213 chr12 11233002 11233391 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955246 chr12 11249282 11249649 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955282 chr12 11275566 11275987 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955328 chr12 11321242 11321621 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955384 chr12 11361725 11362112 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER955441 chr12 11400922 11401317 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER958267 chr12 12791977 12792438 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER959138 chr12 13191118 13191183 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER963132 chr12 15453504 15453564 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER964084 chr12 16001924 16001981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER967662 chr12 18306280 18306449 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER968425 chr12 18806670 18806971 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER974883 chr12 22592199 22592311 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER986780 chr12 29437389 29437927 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER989731 chr12 31213305 31213368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER989733 chr12 31213670 31213911 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER990637 chr12 31601415 31601467 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER990641 chr12 31601796 31601827 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER990648 chr12 31603743 31603988 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER992387 chr12 32188339 32188529 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER995002 chr12 33591094 33591251 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER998724 chr12 39286995 39287098 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1001770 chr12 41219730 41219864 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1011219 chr12 46701250 46701480 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1011220 chr12 46701543 46702013 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1013921 chr12 48218129 48218482 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1035838 chr12 58772876 58772990 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1035840 chr12 58773370 58773453 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039908 chr12 61425871 61426012 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039910 chr12 61426192 61426373 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039929 chr12 61439258 61439931 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1040206 chr12 61596403 61596523 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1041037 chr12 62117192 62117306 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1041038 chr12 62117415 62117516 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1041219 chr12 62219274 62219853 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1041971 chr12 62618977 62619242 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1043523 chr12 63514516 63514563 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1043526 chr12 63514894 63515280 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1043616 chr12 63556951 63557187 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1043943 chr12 63751581 63751817 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1045666 chr12 64553396 64553515 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1049619 chr12 66651979 66652081 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1050235 chr12 66986889 66986969 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1050875 chr12 67330799 67330874 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1051874 chr12 67910529 67910635 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1054068 chr12 68969288 68969901 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1056119 chr12 69948617 69948769 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1059448 chr12 71795568 71795650 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1061648 chr12 73138986 73139132 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1063015 chr12 74026876 74027069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1063200 chr12 74160341 74160564 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1064128 chr12 74737027 74737273 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1064131 chr12 74738118 74738293 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1064952 chr12 75260025 75260574 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1065206 chr12 75408083 75408277 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1065601 chr12 75635767 75636025 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1065639 chr12 75657904 75657952 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1065688 chr12 75680339 75680363 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1065690 chr12 75680677 75681025 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1065693 chr12 75682519 75682746 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1066039 chr12 75863165 75863475 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1066766 chr12 76200468 76200566 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1066767 chr12 76200821 76200922 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1068609 chr12 77070398 77070785 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1070425 chr12 78236166 78236435 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1074821 chr12 80873953 80874044 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1075187 chr12 81051455 81051674 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1075197 chr12 81055405 81055597 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1076439 chr12 81872651 81872832 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1076440 chr12 81872913 81873238 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1077373 chr12 82411569 82411739 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1078548 chr12 83156830 83157133 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1080074 chr12 84199407 84199854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1081761 chr12 85226194 85226376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1081766 chr12 85228528 85228725 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1085450 chr12 87552904 87553260 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1085596 chr12 87653500 87653714 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1089796 chr12 90050630 90050791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1090837 chr12 90642164 90642599 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1090838 chr12 90642706 90642838 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1091920 chr12 91276541 91276640 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1094850 chr12 92869377 92869461 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1094852 chr12 92869783 92869885 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1098168 chr12 94294396 94294458 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1099556 chr12 94930904 94931087 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1100532 chr12 95323795 95324118 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1108512 chr12 99276788 99277270 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1112036 chr12 101024663 101024733 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1114561 chr12 102211622 102211692 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1114562 chr12 102211966 102212030 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1114567 chr12 102213135 102213452 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1114677 chr12 102272196 102272837 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1116749 chr12 103357390 103357708 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1117097 chr12 103552141 103552211 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1117790 chr12 103880196 103880329 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1120504 chr12 105060073 105060207 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1121545 chr12 105575937 105576002 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1121891 chr12 105737301 105737512 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1124417 chr12 106914960 106915155 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1124750 chr12 107058883 107058960 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1126080 chr12 107569244 107569704 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1126082 chr12 107570189 107570211 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1126084 chr12 107570515 107570603 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1128257 chr12 108465808 108466097 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1150517 chr12 117073376 117073755 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1154906 chr12 118742899 118743282 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1160855 chr12 120991919 120991993 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1172196 chr12 125324118 125324187 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1172199 chr12 125325520 125325590 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1173584 chr12 126035944 126036061 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1173586 chr12 126036466 126036752 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1174606 chr12 126575958 126576186 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1174832 chr12 126704132 126704623 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1177312 chr12 127961912 127962443 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1177996 chr12 128303133 128303341 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1177997 chr12 128303360 128303653 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1179983 chr12 129195569 129195726 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1180088 chr12 129247966 129248432 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180318 chr12 129370518 129370591 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180326 chr12 129373036 129373172 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180997 chr12 129697898 129697936 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1181151 chr12 129769052 129769177 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1181153 chr12 129769538 129769869 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1181380 chr12 129897037 129897179 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1181650 chr12 130031849 130032100 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1181651 chr12 130032704 130032980 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1186362 chr12 132853071 132853195 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1190037 chr12_KI270835v1_alt 104023 104162 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1190039 chr12_KI270835v1_alt 104464 104705 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1190396 chr12_KI270837v1_alt 15163 15557 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1191087 chr12_KI270904v1_alt 427965 428354 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1191120 chr12_KI270904v1_alt 444245 444612 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1191157 chr12_KI270904v1_alt 470529 470950 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1191203 chr12_KI270904v1_alt 516205 516584 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1191259 chr12_KI270904v1_alt 556688 557075 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1197751 chr13 21414074 21414205 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1197905 chr13 21474689 21474855 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1197907 chr13 21475152 21475548 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1197962 chr13 21493742 21493830 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1201159 chr13 23435960 23436104 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1201161 chr13 23436682 23436804 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1203290 chr13 24695925 24696032 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1208899 chr13 27681878 27681961 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1213833 chr13 30324987 30325069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1213837 chr13 30327137 30327682 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1221370 chr13 34378300 34378408 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1221371 chr13 34378631 34378767 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1221779 chr13 34625451 34625721 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1221937 chr13 34708524 34709110 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1225477 chr13 36837011 36837096 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1225478 chr13 36837464 36837561 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1225961 chr13 37093332 37093402 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1225962 chr13 37093419 37093666 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1226131 chr13 37187670 37187773 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1227912 chr13 38334565 38334788 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1227914 chr13 38335404 38335488 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1229721 chr13 39420408 39420686 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1229722 chr13 39420896 39420963 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1235999 chr13 42785075 42785212 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1236127 chr13 42853424 42853497 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1236810 chr13 43194616 43194764 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1236900 chr13 43253583 43253700 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1237668 chr13 43754853 43754993 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1240656 chr13 45225935 45225995 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1240848 chr13 45307988 45308083 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1240852 chr13 45309160 45309226 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1241526 chr13 45613709 45613826 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1243680 chr13 46800748 46801078 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1246297 chr13 48274854 48274986 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1246299 chr13 48275636 48275792 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1249426 chr13 49837584 49837852 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1249428 chr13 49837989 49837999 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1249430 chr13 49838293 49838685 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1250463 chr13 50368295 50368484 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1250470 chr13 50370912 50371012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1250793 chr13 50562456 50562776 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1252469 chr13 51518414 51518499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257052 chr13 54158519 54158838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257326 chr13 54361635 54361885 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257662 chr13 54567577 54567713 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1262542 chr13 57764278 57764466 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1263690 chr13 58541515 58541855 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1264076 chr13 58796382 58796545 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1264077 chr13 58796563 58796683 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266007 chr13 59966789 59966830 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266008 chr13 59966921 59967054 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266010 chr13 59967375 59967431 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1267478 chr13 60788960 60789555 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1267480 chr13 60789691 60789860 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1271898 chr13 63619937 63620090 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1272710 chr13 64167324 64167515 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1275499 chr13 65947004 65947089 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1276147 chr13 66374696 66374828 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1279111 chr13 68387098 68387421 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1280601 chr13 69353036 69353213 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1289877 chr13 74860040 74860192 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1290189 chr13 75042369 75042835 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1290969 chr13 75492858 75493023 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1291619 chr13 75878819 75878934 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1291621 chr13 75879253 75879314 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1292164 chr13 76211193 76211448 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1292166 chr13 76212050 76212275 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1292281 chr13 76286229 76286556 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1292551 chr13 76446398 76446692 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1295246 chr13 78052609 78052703 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1296741 chr13 78983638 78983749 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1297677 chr13 79514241 79514389 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1298227 chr13 79872661 79872845 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1298569 chr13 80120227 80120390 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1298571 chr13 80120774 80120840 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1300361 chr13 81201385 81201648 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301006 chr13 81633874 81633964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301008 chr13 81634408 81634577 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301009 chr13 81634666 81634847 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301428 chr13 81921402 81921549 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1301933 chr13 82265252 82265359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311003 chr13 88117439 88117863 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311005 chr13 88118177 88118338 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1313965 chr13 89915703 89915830 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1314735 chr13 90416944 90417075 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315436 chr13 90858904 90859506 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315924 chr13 91170290 91170441 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315926 chr13 91170552 91170952 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1318158 chr13 92553777 92553857 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1318753 chr13 92951015 92951094 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1319889 chr13 93667250 93667302 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1321377 chr13 94564816 94565006 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1324124 chr13 95892958 95893053 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1325869 chr13 96950258 96950331 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1325970 chr13 97013230 97013820 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1326451 chr13 97289477 97289613 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1326911 chr13 97559332 97559505 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1327998 chr13 98086077 98086598 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1334476 chr13 101505696 101506023 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1335381 chr13 102110040 102110411 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1335564 chr13 102219502 102219625 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1337285 chr13 103245123 103245486 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1337477 chr13 103362814 103362970 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1337823 chr13 103580042 103580199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1340193 chr13 105178231 105178440 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1340612 chr13 105472020 105472170 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341403 chr13 105962298 105962411 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341428 chr13 105982990 105983068 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341430 chr13 105983201 105983272 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341964 chr13 106316375 106316674 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1342053 chr13 106374266 106374388 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1342131 chr13 106424549 106424696 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1342133 chr13 106424927 106425233 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1342416 chr13 106613358 106613705 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1345440 chr13 108527031 108527558 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1346592 chr13 109312885 109313060 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1349733 chr13 111430200 111430491 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1358068 chr14 20483480 20483530 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1361611 chr14 22333444 22333621 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1361613 chr14 22333875 22334387 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1361761 chr14 22442546 22442702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1361762 chr14 22442759 22443077 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1362107 chr14 22660683 22660940 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1366582 chr14 25161751 25162286 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367211 chr14 25562305 25562600 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367213 chr14 25563045 25563248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367715 chr14 25904311 25904520 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1368048 chr14 26131446 26131567 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1370276 chr14 27599737 27599897 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1370416 chr14 27695770 27696025 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1374729 chr14 30511169 30511258 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1375370 chr14 30852145 30852217 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1375372 chr14 30852515 30852753 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1377369 chr14 31734760 31734964 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1377508 chr14 31806291 31806455 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1377618 chr14 31883580 31884365 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1379160 chr14 32784262 32784359 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380637 chr14 33911239 33911278 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380639 chr14 33911731 33912440 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380643 chr14 33913633 33913723 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380783 chr14 33987486 33987573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380784 chr14 33987597 33987622 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380786 chr14 33987831 33988042 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380788 chr14 33988202 33988401 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1381366 chr14 34287284 34287361 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1382493 chr14 34688439 34688561 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1384337 chr14 35432904 35433024 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1389838 chr14 38665876 38666350 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1389839 chr14 38666430 38666561 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1391704 chr14 39682836 39683193 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1391705 chr14 39683234 39683669 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1392677 chr14 40382955 40383086 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1393537 chr14 40913645 40913748 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1394349 chr14 41446525 41446607 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1397556 chr14 43570873 43571202 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1397558 chr14 43571506 43571530 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1397630 chr14 43623796 43623912 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1401018 chr14 45697659 45697892 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1402060 chr14 46411792 46412112 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1403218 chr14 47168088 47168189 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1403448 chr14 47302837 47302875 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1403595 chr14 47396058 47396161 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1409223 chr14 50534656 50534841 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1409224 chr14 50535101 50535297 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1409482 chr14 50669137 50669234 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1409487 chr14 50671238 50671304 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1409502 chr14 50677910 50678025 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1411815 chr14 52012099 52012322 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1411817 chr14 52012615 52012685 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1412182 chr14 52222147 52222396 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1412196 chr14 52228072 52228340 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1412205 chr14 52231482 52231764 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1412737 chr14 52525770 52525780 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1412739 chr14 52526096 52526236 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1414335 chr14 53325628 53325701 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1415070 chr14 53759341 53759935 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1415970 chr14 54315420 54315729 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1416585 chr14 54637816 54637952 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1419843 chr14 56293685 56294001 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1422680 chr14 57967727 57968300 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1429022 chr14 61582516 61582877 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1431350 chr14 62987975 62988163 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1435602 chr14 64978159 64978587 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1438328 chr14 66323005 66323044 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1439211 chr14 66865771 66865878 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1445970 chr14 70213795 70213942 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1446027 chr14 70240674 70240887 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446124 chr14 70288277 70288374 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1446455 chr14 70461439 70461613 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446871 chr14 70687271 70687729 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446872 chr14 70687782 70687882 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446878 chr14 70689117 70689254 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1461608 chr14 77312069 77312381 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1461610 chr14 77312665 77313042 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1465312 chr14 79031562 79031813 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1465917 chr14 79405758 79405841 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469091 chr14 81291903 81292165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469092 chr14 81292179 81292364 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469094 chr14 81292756 81292883 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1471032 chr14 82361041 82361227 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1473327 chr14 83752772 83753237 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1476885 chr14 85900613 85901086 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1477649 chr14 86400499 86400753 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480511 chr14 88066421 88066569 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480512 chr14 88066762 88067005 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480622 chr14 88129104 88129199 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1490219 chr14 92662701 92662840 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1493910 chr14 94400349 94400866 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1493914 chr14 94401593 94401695 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1496704 chr14 95662031 95662282 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1496797 chr14 95703004 95703351 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1496816 chr14 95708610 95708746 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1499633 chr14 97049034 97049283 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1499634 chr14 97049410 97049527 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1501544 chr14 98034999 98035137 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1506463 chr14 100477239 100477452 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1506464 chr14 100477670 100477742 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1538815 chr15 27842984 27843593 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1541181 chr15 29178867 29179149 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1551796 chr15 35027868 35027956 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1553017 chr15 35813239 35813363 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558185 chr15 39090817 39090869 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558187 chr15 39091165 39091283 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1558343 chr15 39193214 39193426 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558441 chr15 39259877 39260059 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1560689 chr15 40537979 40538295 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1564293 chr15 42029020 42029085 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1564296 chr15 42029396 42029477 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1565045 chr15 42418056 42418357 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1565049 chr15 42418679 42418792 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1573554 chr15 46439973 46440362 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1577115 chr15 48677169 48677739 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1578743 chr15 49648093 49648148 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1581779 chr15 51083167 51083219 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1583278 chr15 51901645 51901717 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1583279 chr15 51902148 51902467 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1583283 chr15 51903082 51903300 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1583903 chr15 52148006 52148092 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1585716 chr15 53155576 53155690 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1586935 chr15 53868263 53868710 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1587907 chr15 54507995 54508099 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1589995 chr15 55645545 55645737 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1590246 chr15 55768654 55768741 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1594558 chr15 58123089 58123483 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1594906 chr15 58307698 58307955 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1594996 chr15 58351170 58351227 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1598263 chr15 59815157 59815600 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1598265 chr15 59815812 59815997 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1602044 chr15 61937916 61938597 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1617675 chr15 69052394 69053163 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1621775 chr15 70995830 70995940 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1621776 chr15 70995991 70996116 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623204 chr15 71741779 71741898 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623206 chr15 71742554 71742772 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623208 chr15 71743071 71743434 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1638893 chr15 79123170 79123338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1639461 chr15 79376838 79377268 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1639950 chr15 79640788 79640845 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1641494 chr15 80359542 80359843 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1642199 chr15 80728603 80728754 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1642856 chr15 81049993 81050152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1643732 chr15 81473093 81473364 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1643733 chr15 81473397 81473538 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1644726 chr15 81986530 81986586 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1644802 chr15 82030567 82030895 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1645300 chr15 82285738 82285760 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1645303 chr15 82286331 82286660 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1646707 chr15 82982437 82982533 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1648862 chr15 84049558 84049875 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1648864 chr15 84050081 84050159 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1652658 chr15 86005375 86005853 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1652660 chr15 86006159 86006218 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1652898 chr15 86129933 86129994 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1654644 chr15 87164163 87164638 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1654975 chr15 87408758 87409192 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1657044 chr15 88534183 88534275 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1660482 chr15 90008887 90009059 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1663525 chr15 91235269 91235853 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664215 chr15 91599042 91599150 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664492 chr15 91732484 91733125 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664494 chr15 91733172 91733216 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1664517 chr15 91744955 91745490 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664670 chr15 91815739 91815898 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1665493 chr15 92289024 92289676 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1665853 chr15 92478154 92478521 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1666015 chr15 92564007 92564152 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1667930 chr15 93463017 93463129 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1667934 chr15 93463615 93463654 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668519 chr15 93820839 93820996 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668713 chr15 93914716 93915395 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668797 chr15 93965463 93965906 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1670669 chr15 95106759 95106886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1671480 chr15 95570673 95570748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1672943 chr15 96492571 96492679 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1674720 chr15 97648493 97648616 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1675360 chr15 98024252 98024646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1675361 chr15 98024668 98024787 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1678448 chr15 99770947 99771037 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1681516 chr15 101684942 101685317 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1681518 chr15 101685510 101685567 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1681971 chr15 101948459 101948593 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1689428 chr15_KI270905v1_alt 1454430 1454712 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1698175 chr16 1269245 1269391 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706982 chr16 5414256 5414456 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706983 chr16 5414611 5414737 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706988 chr16 5415821 5415948 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1707356 chr16 5564940 5565083 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712528 chr16 7996829 7997315 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712529 chr16 7997402 7997598 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712810 chr16 8122867 8123470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712846 chr16 8135855 8136226 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1718849 chr16 10475990 10476077 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1719057 chr16 10557412 10557692 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1724766 chr16 12784566 12785167 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1724901 chr16 12827644 12827878 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726283 chr16 13348951 13349115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726284 chr16 13349317 13349589 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726286 chr16 13349782 13349942 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726997 chr16 13629779 13630001 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726999 chr16 13630274 13630595 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1727000 chr16 13630688 13630913 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1735297 chr16 16732376 16732449 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1735309 chr16 16735236 16735727 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1735357 chr16 16758396 16758639 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1739832 chr16 18600597 18600840 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1739883 chr16 18623452 18623943 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1739895 chr16 18626722 18626795 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1740715 chr16 18937328 18937595 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1743051 chr16 19720707 19720734 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1743053 chr16 19721030 19721578 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1746868 chr16 21215034 21215230 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1746869 chr16 21215251 21215332 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1748333 chr16 21794564 21795094 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1750399 chr16 22611000 22611531 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1751858 chr16 23201297 23201492 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1753042 chr16 23598980 23599165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1753939 chr16 23899087 23899571 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1758384 chr16 25475867 25476067 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1758406 chr16 25481965 25482147 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1759670 chr16 26011941 26012574 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759711 chr16 26024963 26025233 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759713 chr16 26025314 26025733 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759716 chr16 26026216 26026300 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759718 chr16 26026862 26026958 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1765026 chr16 28105378 28105968 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1766161 chr16 28479797 28479971 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1766164 chr16 28480356 28480406 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1766166 chr16 28480707 28481037 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1780606 chr16 46638299 46638430 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1782319 chr16 47408415 47408584 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1782607 chr16 47599255 47599345 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1782608 chr16 47599851 47599945 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783345 chr16 48006321 48006455 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783347 chr16 48006883 48007301 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783349 chr16 48007375 48007675 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1783469 chr16 48070403 48070595 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1784443 chr16 48486443 48486551 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1785488 chr16 48963286 48964080 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1789691 chr16 50905854 50905985 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1790080 chr16 51080268 51080378 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1790109 chr16 51091436 51091534 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1790803 chr16 51433687 51433857 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1793560 chr16 52883713 52883886 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1796162 chr16 54120711 54120979 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1798570 chr16 55219143 55219427 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1799779 chr16 55836200 55836502 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1807397 chr16 59197226 59197888 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1807699 chr16 59356726 59356850 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1808153 chr16 59629697 59629918 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1808154 chr16 59630011 59630218 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1809226 chr16 60247150 60247311 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1811114 chr16 61321015 61321195 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1811120 chr16 61325289 61325396 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1812753 chr16 62244161 62244255 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1816434 chr16 64320947 64321491 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1816564 chr16 64394574 64394620 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1816568 chr16 64397642 64397757 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1818831 chr16 65647372 65647547 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1820220 chr16 66334887 66335554 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1832272 chr16 71473939 71474290 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1832400 chr16 71533630 71533724 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1832402 chr16 71534078 71534187 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1833762 chr16 72138818 72139072 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1838232 chr16 74507833 74507956 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1838233 chr16 74508233 74508317 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1843414 chr16 76944416 76944681 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1849792 chr16 80122855 80122978 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1855374 chr16 82608734 82609231 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1856290 chr16 83070041 83070166 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1857306 chr16 83557626 83558234 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1857950 chr16 83877728 83877980 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1860058 chr16 84795516 84795666 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1860345 chr16 84917702 84918058 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1870447 chr16_GL383556v1_alt 60109 60407 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1879858 chr16_KI270853v1_alt 2393313 2393386 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1879871 chr16_KI270853v1_alt 2396172 2396663 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1879920 chr16_KI270853v1_alt 2419332 2419575 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1888567 chr17 3147235 3147353 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1888569 chr17 3153414 3153748 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1888913 chr17 3356743 3357006 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891953 chr17 4654643 4654855 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891970 chr17 4660446 4660565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891972 chr17 4660607 4660823 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1892919 chr17 5047450 5047471 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1892921 chr17 5047504 5047996 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1893471 chr17 5259496 5259670 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895090 chr17 5944691 5945563 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895572 chr17 6163132 6163389 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895609 chr17 6178712 6179160 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1897209 chr17 6903676 6903862 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1900928 chr17 8527240 8527312 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1901532 chr17 8781788 8781864 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1902762 chr17 9324176 9324345 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1903909 chr17 9791724 9791940 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1904411 chr17 10006879 10006926 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1904969 chr17 10231877 10232013 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1905596 chr17 10561478 10561907 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1905759 chr17 10625540 10625614 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908121 chr17 11758176 11758666 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908123 chr17 11758969 11759096 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1909172 chr17 12299803 12299875 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1909813 chr17 12615572 12615701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1914083 chr17 14746011 14746257 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER1915354 chr17 15409562 15409704 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1916028 chr17 15720593 15720769 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1916906 chr17 16129711 16130010 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1916907 chr17 16130253 16130359 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1921143 chr17 18047224 18047411 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1922365 chr17 18658447 18658623 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1925773 chr17 19981256 19981406 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1925775 chr17 19981709 19981880 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1928019 chr17 21056251 21056321 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1928021 chr17 21056624 21056691 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1928027 chr17 21058448 21058672 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1928079 chr17 21074926 21074944 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1928081 chr17 21075243 21075312 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1932952 chr17 27935808 27936169 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1932954 chr17 27936479 27936657 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1944213 chr17 32696455 32697015 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER1944766 chr17 32962223 32962971 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1945916 chr17 33452978 33453346 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1945920 chr17 33455608 33455678 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1946582 chr17 33767448 33768011 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER1946584 chr17 33768306 33768364 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1946697 chr17 33819857 33820000 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1947767 chr17 34399478 34399702 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1947804 chr17 34416703 34416944 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951282 chr17 36024557 36024622 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951284 chr17 36025071 36025169 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951540 chr17 36160819 36160896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951698 chr17 36248777 36248856 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951873 chr17 36338001 36338089 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951962 chr17 36372669 36372748 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1952085 chr17 36423750 36423829 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955456 chr17 37938613 37938701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955545 chr17 37973293 37973372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955607 chr17 38018150 38018238 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955695 chr17 38052831 38052910 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955878 chr17 38142110 38142198 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955968 chr17 38176797 38176876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1960028 chr17 39803050 39803118 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER1964552 chr17 41952581 41952660 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987431 chr17 51712807 51712901 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987432 chr17 51713477 51713606 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987597 chr17 51789693 51790449 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989228 chr17 52706455 52706604 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989851 chr17 53070293 53070380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989853 chr17 53070431 53070822 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1991286 chr17 53941019 53941201 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1991660 chr17 54180538 54181284 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995230 chr17 56071415 56071614 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995232 chr17 56071644 56071685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995233 chr17 56071746 56072055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1996754 chr17 56810853 56811062 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2002456 chr17 59260178 59260259 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2002458 chr17 59260550 59260740 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004315 chr17 60004599 60004748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004316 chr17 60004791 60004870 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004483 chr17 60095964 60096442 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004484 chr17 60096488 60096567 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2009446 chr17 62259844 62259923 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2019138 chr17 66825466 66825551 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2019294 chr17 66893238 66893519 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2024278 chr17 69078544 69078733 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2024337 chr17 69117377 69117556 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2024914 chr17 69412797 69412988 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2026720 chr17 70424164 70424257 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2029815 chr17 72215570 72215849 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2034073 chr17 74180066 74180187 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2039251 chr17 76505578 76505741 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2039253 chr17 76506056 76506103 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2044937 chr17 79099427 79099498 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2057613 chr17_GL383565v1_alt 123940 124033 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059593 chr17_KI270857v1_alt 259122 259187 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059595 chr17_KI270857v1_alt 259636 259734 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059610 chr17_KI270857v1_alt 265710 265909 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059855 chr17_KI270857v1_alt 395718 395797 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060014 chr17_KI270857v1_alt 483681 483760 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060197 chr17_KI270857v1_alt 572905 572993 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060286 chr17_KI270857v1_alt 607573 607652 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060407 chr17_KI270857v1_alt 658654 658733 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2063800 chr17_KI270857v1_alt 2177222 2177310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2063889 chr17_KI270857v1_alt 2211914 2211993 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071481 chr17_KI270909v1_alt 114915 114992 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071643 chr17_KI270909v1_alt 202958 203037 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071839 chr17_KI270909v1_alt 304520 304599 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2074369 chr18 1090090 1090166 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2074371 chr18 1090662 1090848 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2074742 chr18 1324446 1324543 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2075400 chr18 1741788 1742003 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2075922 chr18 2048789 2048901 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2076536 chr18 2418950 2419278 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2081472 chr18 5042201 5042237 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2081474 chr18 5042530 5042602 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2081475 chr18 5042781 5042925 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2085630 chr18 7493496 7493621 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2087195 chr18 8541699 8541850 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2087197 chr18 8542164 8542261 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2089870 chr18 9828693 9828797 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2089881 chr18 9834758 9834934 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2091271 chr18 10768601 10768739 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2091855 chr18 11136267 11136388 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2092942 chr18 11798390 11798471 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2094148 chr18 12396286 12396467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2094149 chr18 12396574 12396782 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2095172 chr18 12847561 12847617 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2095174 chr18 12847899 12848274 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2096433 chr18 13604621 13604722 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2096434 chr18 13605070 13605230 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2106313 chr18 24151221 24151687 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2106315 chr18 24151990 24152014 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2106316 chr18 24152131 24152187 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2107427 chr18 24725468 24725643 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2107428 chr18 24726015 24726152 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2107834 chr18 24959961 24960278 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2107836 chr18 24960735 24960837 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2109267 chr18 25871381 25871489 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2109362 chr18 25919508 25919595 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2109364 chr18 25919724 25919814 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2110934 chr18 26647150 26647225 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2116684 chr18 30204558 30204874 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2117913 chr18 30975995 30976061 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2117916 chr18 30977040 30977195 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121882 chr18 33186114 33186222 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121884 chr18 33186352 33186632 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121895 chr18 33190369 33190451 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2124471 chr18 34855498 34855568 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2127771 chr18 36752485 36752568 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2127772 chr18 36752778 36752905 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2130940 chr18 38777694 38777786 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2131599 chr18 39202343 39202617 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2132652 chr18 39873102 39873317 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2132848 chr18 39997495 39997644 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134214 chr18 40870184 40870222 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134220 chr18 40871810 40872017 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134947 chr18 41326344 41326499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134948 chr18 41326526 41326820 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136017 chr18 41984625 41984771 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136019 chr18 41985328 41985391 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2136571 chr18 42306336 42306522 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136799 chr18 42446329 42446569 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2138320 chr18 43388270 43388944 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2138891 chr18 43733061 43733264 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2141197 chr18 45175742 45175916 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2151921 chr18 50758357 50759008 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2153677 chr18 51537888 51538074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2153995 chr18 51721928 51722537 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2153996 chr18 51722640 51722792 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2154743 chr18 52166785 52167227 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2154745 chr18 52167615 52167844 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2157776 chr18 54062283 54062508 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2158846 chr18 54655793 54655890 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2162150 chr18 56645846 56645983 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2167076 chr18 59240540 59241012 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2168596 chr18 60025203 60025665 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2169653 chr18 60689949 60690061 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2170138 chr18 60987095 60987870 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2171811 chr18 61929312 61929472 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175087 chr18 63645371 63645450 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175112 chr18 63662373 63662502 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175114 chr18 63663008 63663087 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2175852 chr18 64143904 64144133 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2180306 chr18 66924491 66924743 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2181285 chr18 67529793 67530246 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2181570 chr18 67710082 67710466 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2186124 chr18 70468158 70468240 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2186126 chr18 70468417 70468545 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187005 chr18 71021317 71021564 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187369 chr18 71261318 71261393 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187371 chr18 71261569 71261960 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190256 chr18 73058393 73058638 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190257 chr18 73059285 73059470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190258 chr18 73059491 73059672 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190647 chr18 73286523 73286928 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2192306 chr18 74313609 74314255 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2193337 chr18 75047508 75047649 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2194390 chr18 75846615 75846840 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2194394 chr18 75853519 75853648 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2201391 chr18_GL383570v1_alt 98851 99003 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2201392 chr18_GL383570v1_alt 99106 99715 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2201685 chr18_GL383571v1_alt 175520 175973 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2202207 chr18_KI270864v1_alt 45749 45952 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2202753 chr19 83981 84115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2205683 chr19 1542670 1542796 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2241921 chr19 14659849 14660285 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264109 chr19 27971451 27971635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264632 chr19 28305330 28305476 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264633 chr19 28305621 28305741 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264636 chr19 28306658 28306739 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2265453 chr19 28745487 28745618 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2275076 chr19 33769774 33769869 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2275077 chr19 33770343 33770432 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2277170 chr19 34648339 34648544 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2286866 chr19 38538640 38539231 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2286868 chr19 38539538 38539610 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2307505 chr19 46574036 46574120 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2320409 chr19 51101270 51101370 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2320411 chr19 51101601 51102002 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2321221 chr19 51460956 51461055 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2321467 chr19 51600411 51600662 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2326846 chr19 53843427 53843569 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2326849 chr19 53843817 53844157 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2333398 chr19 56534987 56535039 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2334522 chr19 56977924 56978226 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2334523 chr19 56978282 56978432 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2339300 chr19_GL383574v1_alt 98388 98487 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2369197 chr1_KI270763v1_alt 668256 668373 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369764 chr1_KI270765v1_alt 13611 13713 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369765 chr1_KI270765v1_alt 13760 13986 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369771 chr1_KI270765v1_alt 14643 14787 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2371395 chr2 449493 449624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378769 chr2 5644856 5645002 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378774 chr2 5645655 5645880 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378775 chr2 5645908 5646029 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2379992 chr2 6372659 6372890 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2382464 chr2 7889682 7889906 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2383106 chr2 8288375 8288458 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2383108 chr2 8288615 8288670 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2386162 chr2 9850364 9850715 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2390129 chr2 11752776 11752964 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393233 chr2 13443993 13444158 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393796 chr2 13787852 13788077 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393797 chr2 13788152 13788279 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2395375 chr2 14692411 14692525 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2395380 chr2 14694923 14695001 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2399740 chr2 16944685 16945252 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400031 chr2 17106932 17107012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400032 chr2 17107181 17107280 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400119 chr2 17157771 17158159 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401536 chr2 17968720 17968899 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401538 chr2 17969246 17969428 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401539 chr2 17969768 17969997 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401845 chr2 18154060 18154160 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401849 chr2 18155337 18155631 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401875 chr2 18171706 18172195 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401912 chr2 18193794 18194361 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2403637 chr2 19251395 19251528 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2403640 chr2 19252546 19252891 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2404353 chr2 19707770 19708396 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405696 chr2 20420398 20420453 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405698 chr2 20420913 20420951 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405700 chr2 20421363 20421587 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2407244 chr2 21354827 21355508 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2407588 chr2 21556171 21556249 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2408238 chr2 21994162 21994335 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2410082 chr2 23105812 23105948 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2410220 chr2 23191758 23191815 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2412747 chr2 24435788 24435908 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2412900 chr2 24497767 24497837 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2412901 chr2 24497888 24498233 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2414106 chr2 25063738 25063892 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2414107 chr2 25064067 25064536 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2415972 chr2 25881212 25881358 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2418590 chr2 26951584 26951771 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2418592 chr2 26951988 26952171 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2420804 chr2 27938175 27938397 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2420806 chr2 27938690 27938956 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2420808 chr2 27939251 27939291 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2424748 chr2 29990904 29991065 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2427540 chr2 31468525 31468909 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2431168 chr2 33158539 33158776 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2431666 chr2 33447304 33447399 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2432823 chr2 34005746 34005845 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2433382 chr2 34299431 34299806 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2434089 chr2 34713371 34713929 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2434134 chr2 34740732 34740788 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2438742 chr2 37474018 37474224 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2439315 chr2 37803042 37803152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442116 chr2 39153428 39153642 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442117 chr2 39153674 39153952 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442120 chr2 39154268 39154375 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442123 chr2 39155268 39155337 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2442191 chr2 39182591 39182699 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2443815 chr2 40063463 40063811 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2443817 chr2 40063852 40063868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2444631 chr2 40613961 40614043 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2444636 chr2 40616115 40616317 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2444715 chr2 40663352 40663513 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2444716 chr2 40663607 40663845 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2445145 chr2 40922384 40922454 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2445237 chr2 40973035 40973347 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2446546 chr2 41784622 41784893 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2446627 chr2 41828059 41828756 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2454223 chr2 45553860 45553932 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2457975 chr2 47431381 47431511 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461241 chr2 48934957 48935152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461243 chr2 48935459 48935469 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461245 chr2 48935768 48936248 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2461485 chr2 49072573 49072648 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2461486 chr2 49072666 49073063 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2462557 chr2 49750358 49750575 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2462832 chr2 49907096 49907199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2464626 chr2 51131508 51131981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2466862 chr2 52613750 52613896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2466864 chr2 52614302 52614780 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2468101 chr2 53381153 53381631 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2468782 chr2 53755316 53755503 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2469094 chr2 53887555 53887673 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469579 chr2 54084629 54084819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469584 chr2 54085896 54085943 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469586 chr2 54086244 54086743 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2470256 chr2 54399897 54400014 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2470260 chr2 54401022 54401148 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2470324 chr2 54427402 54427472 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2470796 chr2 54750009 54750074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2470799 chr2 54751061 54751246 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2471100 chr2 54936489 54936751 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2472837 chr2 55744896 55744952 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2473399 chr2 56114791 56114911 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2473404 chr2 56116817 56116950 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2473868 chr2 56427797 56427891 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2476167 chr2 58003673 58003805 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2478410 chr2 59460444 59460523 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2479076 chr2 59897468 59897574 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2487051 chr2 63741008 63741298 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2488516 chr2 64507208 64507451 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2488522 chr2 64510116 64510266 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2491802 chr2 66051976 66052380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2491823 chr2 66059511 66059691 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2495149 chr2 68207455 68207874 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2495151 chr2 68208161 68208235 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2497748 chr2 69628691 69628769 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2501957 chr2 71603541 71603828 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2508264 chr2 74821608 74822207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2508268 chr2 74823047 74823204 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2511960 chr2 76985587 76985683 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2511961 chr2 76986126 76986247 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2511977 chr2 77002053 77002232 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2512020 chr2 77025058 77025510 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2513121 chr2 77716060 77716488 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2514305 chr2 78451813 78452080 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2514306 chr2 78452069 78452310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2515659 chr2 79277031 79277198 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2516477 chr2 79778991 79779088 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2517939 chr2 80663126 80663188 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2518070 chr2 80743636 80743860 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2518247 chr2 80858743 80859445 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2518571 chr2 81084286 81084466 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519227 chr2 81504413 81504627 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519686 chr2 81824285 81824459 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519687 chr2 81824541 81824712 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2521960 chr2 83236006 83236085 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2523694 chr2 84300653 84301170 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2523696 chr2 84301557 84301712 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2527472 chr2 86010146 86010795 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2527543 chr2 86050292 86050406 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2530047 chr2 87322032 87322134 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2537482 chr2 95153469 95153599 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2539797 chr2 96473326 96473512 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2540841 chr2 96962593 96962678 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2544639 chr2 99248797 99248901 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2544640 chr2 99248921 99249138 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2544642 chr2 99249441 99249470 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2549960 chr2 102057816 102058316 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2553511 chr2 104392199 104392275 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2558887 chr2 107506078 107506176 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2563746 chr2 110250147 110250191 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2563974 chr2 110419267 110419311 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2564774 chr2 110844279 110844431 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2565035 chr2 110993918 110994018 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2565036 chr2 110994163 110994506 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2565842 chr2 111539485 111539587 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2568833 chr2 113006992 113007250 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2568835 chr2 113007468 113007664 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2570427 chr2 113821994 113822254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2571476 chr2 114384926 114385056 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2571477 chr2 114385198 114385399 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2574413 chr2 116171980 116172099 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2574677 chr2 116366802 116367326 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2576494 chr2 117495540 117495706 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2576889 chr2 117746743 117747069 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2579630 chr2 119285689 119285779 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2579635 chr2 119287480 119287720 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2582417 chr2 120657445 120657544 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2585023 chr2 121876661 121876766 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2586811 chr2 122868578 122869215 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2587253 chr2 123145913 123146096 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2587254 chr2 123146146 123146322 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588906 chr2 124171008 124171152 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588907 chr2 124171605 124171726 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2591240 chr2 125494351 125494458 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2591373 chr2 125576314 125576395 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2592600 chr2 126346176 126346378 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2592601 chr2 126346528 126346615 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2593498 chr2 126851539 126851811 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2598601 chr2 129480670 129480874 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2600889 chr2 130788790 130788981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2603724 chr2 132482171 132482243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2604402 chr2 132911700 132911932 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2608909 chr2 135438951 135439034 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2608910 chr2 135439093 135439473 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2609978 chr2 135953189 135953416 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612682 chr2 137504423 137504629 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612683 chr2 137504756 137504807 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2613519 chr2 138030460 138030708 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2613889 chr2 138252023 138252139 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2614413 chr2 138559829 138559944 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2614683 chr2 138698511 138698572 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2614685 chr2 138698875 138698928 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2614798 chr2 138761594 138761806 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2614799 chr2 138762183 138762383 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2616209 chr2 139657179 139657549 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2616212 chr2 139658273 139658509 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2617101 chr2 140183891 140184091 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2618467 chr2 141096059 141096262 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2618617 chr2 141187940 141188014 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2618618 chr2 141188028 141188346 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2619250 chr2 141612547 141612667 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2620415 chr2 142385947 142386220 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2620417 chr2 142386592 142386699 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2630791 chr2 149067833 149067975 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2632399 chr2 150122845 150123226 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2633364 chr2 150699680 150700060 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2633380 chr2 150713130 150713649 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2633381 chr2 150713699 150714047 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2635586 chr2 151979286 151979517 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2637279 chr2 152871404 152871621 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2637733 chr2 153162644 153162739 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2639817 chr2 154555883 154556060 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2639962 chr2 154637394 154637614 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2640328 chr2 154892726 154892856 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2642129 chr2 156124459 156124763 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643393 chr2 156904150 156904610 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643395 chr2 156904659 156905130 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2643540 chr2 157005983 157006182 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2643541 chr2 157006343 157006549 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643799 chr2 157179460 157179829 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643801 chr2 157180146 157180402 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643806 chr2 157181424 157181615 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2645703 chr2 158292522 158292738 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2649459 chr2 160507989 160508120 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2649619 chr2 160586118 160586199 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2649831 chr2 160717119 160717160 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2651307 chr2 161645235 161645332 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2654941 chr2 164005379 164005662 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2655200 chr2 164154708 164154873 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2659415 chr2 166871743 166871825 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2662302 chr2 168730012 168730185 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2669698 chr2 172378574 172378633 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2669699 chr2 172378664 172379015 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2670302 chr2 172705581 172705902 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2670307 chr2 172707754 172707955 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2671342 chr2 173310835 173310896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2671344 chr2 173310922 173310973 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2671780 chr2 173519536 173519902 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2674151 chr2 174788286 174788555 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2674156 chr2 174790498 174790681 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2678534 chr2 177409033 177409154 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2678541 chr2 177413257 177413799 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2679437 chr2 177991874 177991952 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2682362 chr2 179982712 179982809 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2687683 chr2 183372620 183373154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2688372 chr2 183876043 183876123 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2690134 chr2 185088426 185088804 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2692332 chr2 186443742 186444207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2694342 chr2 187713053 187713193 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2694343 chr2 187713227 187713647 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2699698 chr2 190883130 190883202 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2700950 chr2 191610202 191610397 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2701909 chr2 192227328 192227422 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2704110 chr2 193693665 193694135 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2704112 chr2 193694513 193694708 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2705062 chr2 194331676 194331869 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2708012 chr2 196136478 196136846 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2708578 chr2 196489595 196489799 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2711261 chr2 197902053 197902714 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2711285 chr2 197915237 197915339 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2712635 chr2 198736955 198737095 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2712636 chr2 198737156 198737279 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2712826 chr2 198861009 198861084 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2722735 chr2 203662120 203662194 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2722738 chr2 203662513 203662617 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2723015 chr2 203790756 203791233 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2723017 chr2 203791674 203791763 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2724038 chr2 204363929 204364131 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2727733 chr2 206505181 206505249 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2727737 chr2 206506031 206506176 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2728027 chr2 206695464 206695684 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2728968 chr2 207275915 207276596 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2729942 chr2 207742916 207743152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2730846 chr2 208133656 208133789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2730849 chr2 208134375 208134596 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2733879 chr2 210083449 210083572 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2737154 chr2 212220987 212221210 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2738047 chr2 212810991 212811100 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2738741 chr2 213273861 213274030 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2740951 chr2 214648101 214648618 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2741855 chr2 215169351 215169543 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2751998 chr2 220275023 220275110 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2751999 chr2 220275130 220275260 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752001 chr2 220275367 220275480 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752002 chr2 220275537 220275736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752188 chr2 220374161 220374673 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2754655 chr2 221785989 221786766 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2754914 chr2 221922521 221923002 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2757956 chr2 223563336 223563476 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2764496 chr2 227173212 227173352 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2765473 chr2 227661117 227661345 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2765849 chr2 227828094 227828212 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2766057 chr2 227929719 227929889 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2766146 chr2 227973176 227973480 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2766677 chr2 228310164 228310453 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2768781 chr2 229515587 229515635 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2768783 chr2 229515942 229516595 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2770839 chr2 230612627 230612960 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2770843 chr2 230613807 230613868 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2771325 chr2 230827040 230827234 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2776553 chr2 233127367 233127615 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2776555 chr2 233127908 233128010 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2776557 chr2 233128324 233128487 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2776559 chr2 233128777 233128898 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2776561 chr2 233129193 233129219 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2777774 chr2 233789106 233789255 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778285 chr2 234110643 234111116 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778781 chr2 234347550 234347671 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2780523 chr2 235260926 235261574 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2782224 chr2 236266280 236266573 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2786788 chr2 239042556 239043014 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2788380 chr2 240231689 240231836 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797203 chr20 2439607 2439788 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797205 chr20 2440326 2440475 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797207 chr20 2440652 2440699 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2799886 chr20 3541999 3542179 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2801111 chr20 4091111 4091394 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2805901 chr20 6193157 6193301 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2813069 chr20 10215047 10215342 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2814532 chr20 11044047 11044389 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2816120 chr20 11968523 11968620 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2816126 chr20 11969670 11970129 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2817606 chr20 12871940 12872054 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2820145 chr20 14222844 14222911 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2820149 chr20 14224548 14224656 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2820991 chr20 14745117 14745246 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2822883 chr20 15850502 15851093 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2824515 chr20 16758503 16758859 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2824516 chr20 16758966 16759068 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2825830 chr20 17514970 17515008 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2825832 chr20 17515243 17515640 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2833847 chr20 21836189 21836281 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837204 chr20 24122948 24123178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837205 chr20 24123272 24123415 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837683 chr20 24430342 24430438 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2837745 chr20 24478971 24479075 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2838202 chr20 24795303 24795430 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2838602 chr20 25088074 25088260 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2843508 chr20 31301210 31301300 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2847929 chr20 32855103 32855176 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2848667 chr20 33150833 33151195 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2848669 chr20 33151641 33151957 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2849272 chr20 33384184 33384262 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2851259 chr20 34091304 34091356 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2851263 chr20 34091929 34092059 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864785 chr20 39193072 39193304 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864791 chr20 39194976 39195051 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864792 chr20 39195275 39195442 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2865565 chr20 39564209 39564549 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2866012 chr20 39793236 39793765 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2867206 chr20 40426134 40426608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868453 chr20 40985960 40986340 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868456 chr20 40986869 40987090 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868458 chr20 40987386 40987676 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2870311 chr20 41928940 41929066 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2870312 chr20 41929129 41929299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870846 chr20 42172832 42172979 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870848 chr20 42173099 42173279 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870874 chr20 42185359 42185494 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2871070 chr20 42279751 42280000 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2877353 chr20 44763598 44763867 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2882447 chr20 46836384 46836609 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2883476 chr20 47195193 47195585 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2885639 chr20 48014152 48014386 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2885640 chr20 48014595 48014682 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2886362 chr20 48331958 48332059 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2896962 chr20 52199179 52199400 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2896966 chr20 52200173 52200251 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2896968 chr20 52200399 52200689 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2897360 chr20 52351239 52351393 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2897376 chr20 52356778 52357250 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2898361 chr20 52778625 52778794 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2898363 chr20 52779356 52779470 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2901803 chr20 54185484 54185770 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2906504 chr20 56541672 56541782 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2911487 chr20 58846743 58846874 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2930035 chr21 14873722 14873930 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2931317 chr21 15708240 15708322 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2931322 chr21 15710004 15710112 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2933054 chr21 16870398 16870635 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2934734 chr21 17865399 17865518 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2937291 chr21 19481906 19482104 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2939253 chr21 20668791 20668845 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2939256 chr21 20669367 20669467 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2939490 chr21 20798147 20798254 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2940386 chr21 21372673 21372825 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2941216 chr21 21900885 21901019 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2944683 chr21 23923873 23924028 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2946097 chr21 24739052 24739128 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER2948387 chr21 26071724 26071883 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2950738 chr21 27426726 27426803 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2952639 chr21 28587041 28587133 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2952918 chr21 28748554 28748690 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2953213 chr21 28915416 28915513 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2953214 chr21 28915512 28915661 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2955255 chr21 30009222 30009476 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2955870 chr21 30383903 30384546 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956816 chr21 30957929 30958081 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956818 chr21 30958314 30958507 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2958805 chr21 31858590 31858702 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2964653 chr21 34778903 34779013 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2966373 chr21 35817842 35818648 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER2968228 chr21 36639600 36639718 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2968850 chr21 36968741 36968842 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2968852 chr21 36969551 36969581 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER2968854 chr21 36969873 36969991 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2973669 chr21 39553239 39553613 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2978111 chr21 42164680 42164816 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2985188 chr21 46531488 46531898 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER2985189 chr21 46531916 46532051 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3001740 chr22 22150838 22151423 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3003707 chr22 23356705 23356854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3003708 chr22 23357045 23357282 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3005011 chr22 23945612 23945783 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3010101 chr22 26105449 26105626 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3016946 chr22 28929101 28929292 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3018715 chr22 29657674 29657743 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3026812 chr22 32919634 32919718 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3027727 chr22 33290192 33290293 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029876 chr22 34166164 34166372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029882 chr22 34168363 34168890 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029941 chr22 34189586 34189838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3031497 chr22 34920955 34921021 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3037761 chr22 37454970 37455068 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3037763 chr22 37455512 37455728 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3039752 chr22 38184033 38184237 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3041486 chr22 38886938 38887038 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3043838 chr22 39871863 39872021 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3064419 chr22 49709677 49709732 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3066325 chr22 50736672 50736747 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3066326 chr22 50737642 50737817 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3066788 chr22_GL383583v2_alt 2645 2745 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3069727 chr22_KI270878v1_alt 2663 2812 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3069728 chr22_KI270878v1_alt 3003 3240 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3074806 chr3 374389 374776 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3076058 chr3 1141901 1142471 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3076875 chr3 1628986 1629138 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3078749 chr3 2731684 2731819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3078751 chr3 2732412 2732571 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3081347 chr3 4154715 4155102 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3086644 chr3 6976694 6977309 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3088704 chr3 8133282 8133442 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3089063 chr3 8307570 8307618 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3094445 chr3 10607043 10607143 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3106629 chr3 16166602 16166697 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3110969 chr3 18748346 18748474 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3110970 chr3 18748671 18748835 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3112547 chr3 19766957 19767482 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3112575 chr3 19783691 19783870 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3113597 chr3 20260135 20260268 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3114503 chr3 20856844 20857011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3114992 chr3 21162642 21162877 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3117885 chr3 22994891 22995497 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3120438 chr3 24299672 24299757 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3121195 chr3 24721436 24721517 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3121196 chr3 24721767 24721961 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3122999 chr3 25819635 25819864 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3123001 chr3 25820203 25820506 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3127887 chr3 28562579 28562711 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3128314 chr3 28798650 28798740 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3138960 chr3 34247876 34248143 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3144658 chr3 37601551 37601637 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3148837 chr3 39898286 39898365 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3149457 chr3 40280805 40280997 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3149459 chr3 40281315 40281403 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3149909 chr3 40470766 40470857 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3149910 chr3 40470909 40471105 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3151587 chr3 41392379 41392552 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3153226 chr3 42231354 42231753 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3153413 chr3 42332393 42332466 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3154387 chr3 42828483 42828535 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3154389 chr3 42829927 42830271 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3154415 chr3 42837831 42838033 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3157751 chr3 44678951 44679429 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3157755 chr3 44682813 44683070 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3158697 chr3 45133937 45134039 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3160194 chr3 45858675 45858971 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3160195 chr3 45858986 45859096 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3160985 chr3 46294914 46295126 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3161543 chr3 46574659 46574847 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3164152 chr3 47716645 47716834 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3164154 chr3 47716947 47717184 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3178311 chr3 54841591 54841774 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3179697 chr3 55663018 55663218 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3186759 chr3 58966149 58966261 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3187245 chr3 59245842 59245919 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3187246 chr3 59246003 59246131 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3187247 chr3 59246257 59246485 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3188901 chr3 60218231 60218660 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3188904 chr3 60218907 60219098 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3189233 chr3 60409156 60409783 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3193781 chr3 62867385 62867542 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3193783 chr3 62868045 62868203 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194272 chr3 63101410 63101540 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194441 chr3 63179431 63179573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194443 chr3 63180114 63180573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3202668 chr3 67410081 67410570 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3203693 chr3 67946151 67946437 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3204439 chr3 68348439 68348617 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3216098 chr3 74190711 74191080 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3216627 chr3 74513264 74513917 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3216851 chr3 74645647 74645883 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3217098 chr3 74767124 74767457 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217373 chr3 74944641 74944662 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217375 chr3 74945014 74945127 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217376 chr3 74945331 74945705 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3217970 chr3 75301380 75301458 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3220071 chr3 76586705 76587086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3220859 chr3 77106681 77106774 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3221763 chr3 77750975 77751373 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3222454 chr3 78220132 78220234 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3222718 chr3 78372232 78372426 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3222720 chr3 78372533 78372684 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3222911 chr3 78498898 78498993 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3224312 chr3 79419334 79419592 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3225239 chr3 80048344 80048593 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3235650 chr3 86855417 86855499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3235651 chr3 86855640 86855855 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3237132 chr3 87832803 87833093 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3238783 chr3 88900064 88900230 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3239742 chr3 89596080 89596557 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245612 chr3 96726487 96726583 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245613 chr3 96726614 96726974 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245731 chr3 96828525 96828996 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3249693 chr3 99503208 99503333 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3249695 chr3 99503812 99503869 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3250075 chr3 99761736 99761979 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3250872 chr3 100218667 100218731 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3250874 chr3 100219012 100219307 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3251473 chr3 100524758 100524868 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3252678 chr3 101334782 101334916 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3256114 chr3 103314269 103314703 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3256252 chr3 103403458 103403560 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3258955 chr3 105146795 105147320 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3261172 chr3 106587317 106587445 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261475 chr3 106781580 106781724 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261477 chr3 106782321 106782343 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261479 chr3 106782420 106782526 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261482 chr3 106782866 106783011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3264787 chr3 108740258 108740907 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3266396 chr3 109518010 109518389 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3271625 chr3 112818325 112818887 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3275732 chr3 115207038 115207536 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3276875 chr3 115916076 115916149 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3278223 chr3 116774304 116774459 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3279770 chr3 117760691 117761018 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3279772 chr3 117761370 117761546 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3280441 chr3 118208059 118208167 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3282627 chr3 119497722 119497848 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3283765 chr3 120098020 120098138 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3285850 chr3 121382365 121382546 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3285851 chr3 121382615 121382908 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3286286 chr3 121579346 121579424 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3288411 chr3 122640881 122640961 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3291097 chr3 124023851 124023929 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3296591 chr3 126961279 126961355 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3297219 chr3 127320053 127320193 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3297220 chr3 127320214 127320650 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298566 chr3 127975427 127975682 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298567 chr3 127975738 127975886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298571 chr3 127978182 127978261 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3307705 chr3 132557393 132557568 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3310138 chr3 133914646 133914929 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3310635 chr3 134217122 134217275 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3311001 chr3 134396903 134397036 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3313112 chr3 135643262 135643848 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3313119 chr3 135649894 135649950 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3315462 chr3 136756129 136756195 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3316085 chr3 137022135 137022241 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3316667 chr3 137321298 137321516 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3316676 chr3 137326434 137326655 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3316678 chr3 137327192 137327332 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3316680 chr3 137327774 137327890 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3317794 chr3 138065762 138066236 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3317795 chr3 138066213 138066519 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3320565 chr3 139348678 139348839 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3322347 chr3 140350166 140350316 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3322354 chr3 140352360 140352463 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3323911 chr3 141247383 141248009 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3324574 chr3 141616919 141617148 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3325084 chr3 141842914 141843065 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3327538 chr3 142971121 142971298 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3327886 chr3 143170020 143170186 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3327887 chr3 143170218 143170304 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3329326 chr3 144042829 144042959 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3329336 chr3 144049089 144049342 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3329366 chr3 144064794 144065083 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3329847 chr3 144351976 144352374 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3330030 chr3 144465247 144465424 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3330562 chr3 144809419 144809763 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3331241 chr3 145213157 145213329 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3331524 chr3 145398425 145398537 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3331526 chr3 145398908 145398995 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3337592 chr3 149272533 149272725 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3337594 chr3 149272900 149273219 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3340769 chr3 150861589 150861903 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3340888 chr3 150938436 150938496 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3340890 chr3 150938989 150939066 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344202 chr3 152939152 152939479 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344206 chr3 152940354 152940469 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344208 chr3 152940928 152941131 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3347369 chr3 154707753 154707827 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3347375 chr3 154712131 154712196 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3348436 chr3 155370694 155370812 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3348438 chr3 155371696 155371864 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3348440 chr3 155371982 155372128 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3348734 chr3 155569997 155570103 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3348736 chr3 155570911 155571005 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3349963 chr3 156165887 156166055 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3352377 chr3 157597722 157597890 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3354390 chr3 158851820 158852022 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3355001 chr3 159219296 159219660 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3355834 chr3 159740456 159740583 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3355837 chr3 159741317 159741363 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357177 chr3 160456272 160456582 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357191 chr3 160462794 160462889 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357195 chr3 160464406 160464548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3359477 chr3 161706504 161706571 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360265 chr3 162243263 162243310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360272 chr3 162248605 162248636 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360274 chr3 162248927 162249245 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3365829 chr3 165860997 165861104 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3367471 chr3 166971333 166971413 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3368855 chr3 167867975 167868085 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3369072 chr3 167992726 167992946 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3370680 chr3 169007808 169008259 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3377980 chr3 173049679 173050239 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3381344 chr3 175091424 175091755 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3382012 chr3 175515033 175515428 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3382014 chr3 175516042 175516443 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3383874 chr3 176694304 176694444 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3383878 chr3 176696229 176696312 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3383995 chr3 176775975 176776116 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3384226 chr3 176917537 176918089 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3386705 chr3 178216524 178217028 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3387928 chr3 178956756 178956822 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3387930 chr3 178957251 178957421 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3390315 chr3 180134366 180134575 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3397560 chr3 183838347 183838508 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3399618 chr3 184727209 184727283 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3400542 chr3 185200390 185200459 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3402872 chr3 186214052 186214118 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3409301 chr3 189387756 189387868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3410921 chr3 190279728 190279981 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413895 chr3 191986294 191986431 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413896 chr3 191986637 191986686 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413897 chr3 191986741 191987111 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3415224 chr3 192767189 192767873 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3416181 chr3 193281452 193281905 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3416367 chr3 193386508 193386636 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3416369 chr3 193387145 193387360 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3420425 chr3 195405155 195405363 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3420429 chr3 195406071 195406186 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3421208 chr3 195698949 195699070 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3425654 chr3 197593194 197593315 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3425658 chr3 197594420 197594662 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3428785 chr3_KI270779v1_alt 69446 69567 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3430738 chr3_KI270895v1_alt 93330 93451 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431033 chr3_KI270924v1_alt 96974 97095 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431329 chr3_KI270934v1_alt 93892 94013 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431605 chr3_KI270935v1_alt 69446 69567 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431998 chr3_KI270936v1_alt 94604 94725 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3432295 chr3_KI270937v1_alt 96041 96162 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3433396 chr4 509176 509354 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3433865 chr4 815691 816213 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3433867 chr4 816518 816577 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441600 chr4 5026746 5026854 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441601 chr4 5027097 5027327 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441777 chr4 5097493 5097785 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441779 chr4 5098364 5098516 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3442771 chr4 5605684 5605758 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3442772 chr4 5605998 5606095 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3445026 chr4 6644646 6644822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3450756 chr4 9817730 9818150 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3451802 chr4 10516418 10516551 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3451804 chr4 10516851 10516992 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3451833 chr4 10530409 10530688 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3451834 chr4 10530988 10531200 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3452494 chr4 10842847 10842918 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3452496 chr4 10843770 10843907 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3454224 chr4 11721339 11721497 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3456146 chr4 12788083 12788537 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3459001 chr4 14262037 14262491 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3462692 chr4 16127593 16127653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3464253 chr4 16926389 16926532 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3464259 chr4 16927041 16927470 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3464581 chr4 17073200 17073698 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3468876 chr4 19161831 19161940 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3470260 chr4 19954166 19954827 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3471130 chr4 20447111 20447248 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3472317 chr4 21150730 21151287 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3473419 chr4 21738932 21739102 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3473420 chr4 21739151 21739297 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3474408 chr4 22317258 22317376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3474410 chr4 22317864 22317925 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3475062 chr4 22668619 22669232 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3475065 chr4 22669479 22669758 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3479536 chr4 25037052 25037599 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3483034 chr4 26465927 26466298 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3483037 chr4 26466870 26467021 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3484307 chr4 27145094 27145217 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3485072 chr4 27567598 27567738 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3487641 chr4 29089652 29089771 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3487642 chr4 29089754 29089833 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3488917 chr4 29902926 29903214 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3489609 chr4 30341304 30341400 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3489763 chr4 30438628 30439099 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3492174 chr4 31932087 31932243 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3492178 chr4 31933231 31933331 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3494454 chr4 33302127 33302274 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3494455 chr4 33302395 33302739 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3496494 chr4 34582007 34582489 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3497972 chr4 35484679 35484882 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3502181 chr4 37951410 37951881 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3505566 chr4 39539062 39539195 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3505676 chr4 39581017 39581206 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3511442 chr4 41989155 41989613 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512280 chr4 42384575 42384702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512281 chr4 42384770 42385134 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512285 chr4 42385823 42385987 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3513786 chr4 43321896 43321981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3515441 chr4 44346274 44346608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3515442 chr4 44346636 44346905 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3516050 chr4 44719119 44719260 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3516389 chr4 44933702 44934174 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3516390 chr4 44934171 44934267 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516630 chr4 45096625 45096950 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516631 chr4 45097171 45097374 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516819 chr4 45212952 45213393 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516820 chr4 45213515 45213722 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3520410 chr4 47419188 47419676 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3521527 chr4 48027733 48027828 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3521795 chr4 48174076 48174275 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3535764 chr4 57916018 57916280 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3535893 chr4 57991991 57992062 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3538546 chr4 59776355 59776793 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3539731 chr4 60588803 60588958 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3541537 chr4 61787210 61787337 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3543587 chr4 63070008 63070138 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545697 chr4 64518288 64518439 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545699 chr4 64518572 64518861 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545700 chr4 64518888 64518989 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3546118 chr4 64785755 64785995 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3546120 chr4 64786368 64786664 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3546156 chr4 64811054 64811242 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3547700 chr4 65869113 65869323 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3547837 chr4 65948766 65948967 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3548365 chr4 66296894 66297077 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3549898 chr4 67308902 67309382 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3549912 chr4 67315926 67316418 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3557956 chr4 72221713 72221939 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3558529 chr4 72608509 72608721 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558886 chr4 72861058 72861132 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558887 chr4 72861183 72861357 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558888 chr4 72861419 72861585 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560101 chr4 73525487 73525637 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560103 chr4 73526020 73526632 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3560586 chr4 73847111 73847349 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3560598 chr4 73852689 73852796 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560634 chr4 73875049 73875492 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560899 chr4 74062241 74062472 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560900 chr4 74062529 74062678 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560922 chr4 74079797 74080236 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3561331 chr4 74330016 74330104 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3561332 chr4 74330121 74330196 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3568477 chr4 78301021 78301311 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3570575 chr4 79523360 79523492 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3571312 chr4 80044704 80044836 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3571314 chr4 80045301 80045425 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3571359 chr4 80076075 80076189 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3575082 chr4 82375961 82376092 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3582969 chr4 86624327 86624670 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3585681 chr4 88028211 88028338 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3585682 chr4 88028405 88028568 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3585684 chr4 88028850 88029050 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588386 chr4 89431283 89431499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588514 chr4 89506518 89506620 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588517 chr4 89506925 89507034 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3588983 chr4 89796471 89796881 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3589351 chr4 90036629 90036763 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3591837 chr4 91778982 91779090 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3591838 chr4 91779138 91779246 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3594009 chr4 93190346 93190550 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3595416 chr4 94106015 94106458 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3599217 chr4 96465866 96465972 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600332 chr4 97187801 97188248 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600334 chr4 97188546 97188653 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3601014 chr4 97673169 97673686 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3601155 chr4 97761749 97761876 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3612485 chr4 104658691 104658817 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3613173 chr4 105107050 105107629 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3613174 chr4 105107717 105107873 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3614138 chr4 105682386 105682525 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3623710 chr4 111481268 111481605 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3623713 chr4 111482095 111482154 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3624440 chr4 111995664 111995880 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3624728 chr4 112139815 112139953 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3625744 chr4 112680631 112680668 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3625746 chr4 112680986 112681063 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3625747 chr4 112681180 112681271 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3625790 chr4 112696743 112696847 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3627855 chr4 113921204 113921304 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3627967 chr4 114005939 114006043 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3630114 chr4 115465649 115465804 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3630398 chr4 115633826 115634183 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3637166 chr4 119842884 119843141 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3637943 chr4 120356353 120356607 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3640712 chr4 122059124 122059803 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3640714 chr4 122060884 122060936 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3645521 chr4 125024509 125024763 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3645538 chr4 125032525 125032977 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3646270 chr4 125517080 125517357 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3648343 chr4 126881346 126881978 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3648344 chr4 126882001 126882247 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3651236 chr4 128496160 128496323 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3651237 chr4 128496547 128496911 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3651270 chr4 128513516 128513618 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3651271 chr4 128513905 128514050 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653376 chr4 129748365 129748955 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653911 chr4 130114925 130115029 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653912 chr4 130115126 130115665 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3659809 chr4 134042876 134043078 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3662849 chr4 136149150 136149234 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3663740 chr4 136761250 136761594 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3663742 chr4 136761920 136762058 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3665299 chr4 137809989 137810211 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3665719 chr4 138080036 138080185 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3666224 chr4 138412947 138413331 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3667917 chr4 139251131 139251506 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670513 chr4 140613297 140613383 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670516 chr4 140613843 140614024 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670517 chr4 140614082 140614212 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3672132 chr4 141555586 141555664 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3672732 chr4 141908371 141908484 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3672758 chr4 141922538 141922766 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3675354 chr4 143560926 143561351 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3675356 chr4 143562003 143562150 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3676333 chr4 144145371 144145501 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3676367 chr4 144170154 144170269 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3677421 chr4 144882800 144882969 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3678174 chr4 145325667 145325838 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3679805 chr4 146277213 146277378 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3683357 chr4 148456543 148456715 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3683358 chr4 148457216 148457276 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3685833 chr4 150023844 150023966 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3690619 chr4 152564652 152564828 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3690622 chr4 152565137 152565265 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3690639 chr4 152569023 152569116 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3693390 chr4 154049676 154049930 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3694779 chr4 154899357 154899589 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3694781 chr4 154899899 154900050 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3694782 chr4 154900575 154900671 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3694948 chr4 155001491 155001753 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3695121 chr4 155114634 155114719 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3695137 chr4 155123358 155123793 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3696091 chr4 155656926 155657026 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3699452 chr4 157794237 157794622 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3699666 chr4 157929819 157929890 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3699777 chr4 158012127 158012299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3699961 chr4 158144464 158145030 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3699962 chr4 158145046 158145289 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3702201 chr4 159412101 159412445 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3704910 chr4 161153018 161153221 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3704911 chr4 161154099 161154181 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3705522 chr4 161549542 161549927 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3706654 chr4 162241500 162241628 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3710025 chr4 164280597 164280654 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3710377 chr4 164504390 164504526 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3715321 chr4 167452726 167453253 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3724334 chr4 172980131 172980239 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3730393 chr4 176744307 176744420 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731383 chr4 177320414 177320466 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731385 chr4 177320767 177320932 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3733669 chr4 178753470 178753559 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3736490 chr4 180555254 180555342 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3736547 chr4 180594357 180594587 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3741490 chr4 183587831 183587897 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3742666 chr4 184237481 184238015 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3742733 chr4 184269258 184269526 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3743630 chr4 184702488 184702550 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3743632 chr4 184703051 184703388 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3749997 chr4 188298795 188298945 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3751049 chr4 188923197 188923394 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3751233 chr4 189056617 189056667 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3754517 chr4_GL383528v1_alt 64053 64535 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3762334 chr5 3520984 3521055 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3766128 chr5 6261685 6261825 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3770787 chr5 9461855 9461945 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3771949 chr5 10192171 10192449 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3772474 chr5 10442657 10443053 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3775077 chr5 12092485 12092685 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3775601 chr5 12427325 12427417 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3775602 chr5 12427481 12427955 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3776995 chr5 13324903 13325442 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3777180 chr5 13445572 13445751 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3778636 chr5 14295599 14295685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3778637 chr5 14295857 14295957 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3782368 chr5 16559316 16559421 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3782369 chr5 16559469 16559533 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3785194 chr5 18053511 18053637 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3785195 chr5 18053858 18053960 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3785638 chr5 18324105 18324292 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3785967 chr5 18527093 18527240 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3787073 chr5 19227724 19227902 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3787105 chr5 19258288 19258401 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3789113 chr5 20518213 20518347 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3790330 chr5 21257574 21257900 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3797331 chr5 25516757 25517294 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3799358 chr5 26779673 26779801 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3800327 chr5 27355420 27355744 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3801621 chr5 28194798 28195302 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3802680 chr5 28865038 28865118 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3802898 chr5 29018243 29018474 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3804951 chr5 30276749 30276934 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3808514 chr5 32220505 32220622 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3809258 chr5 32526769 32526873 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3810051 chr5 32963820 32964031 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3811658 chr5 33887524 33887746 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3811661 chr5 33888164 33888443 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811675 chr5 33900146 33900380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811690 chr5 33908308 33908528 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811695 chr5 33909762 33909966 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3811772 chr5 33956988 33957184 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3811773 chr5 33957391 33957556 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3813463 chr5 34843369 34843563 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3814500 chr5 35429467 35429789 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3815147 chr5 35812346 35812597 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3815148 chr5 35812871 35813073 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3817655 chr5 37198036 37198091 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3819504 chr5 38086062 38086303 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3819505 chr5 38086478 38086578 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3819902 chr5 38295661 38295830 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3819906 chr5 38297352 38297499 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3821649 chr5 39286719 39287174 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3822844 chr5 40011267 40011459 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3826157 chr5 42008068 42008276 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829205 chr5 43819652 43819819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829208 chr5 43820146 43820232 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829211 chr5 43820716 43820876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829537 chr5 44073227 44074002 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3830277 chr5 44574061 44574147 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3837257 chr5 53505048 53505310 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3839683 chr5 54897583 54897954 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3839853 chr5 54991115 54991328 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3839861 chr5 54993224 54993478 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3843946 chr5 57055816 57055988 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3843948 chr5 57056587 57056676 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3845280 chr5 57695239 57695392 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3845281 chr5 57695434 57696001 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3846997 chr5 58801627 58801826 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847282 chr5 58964545 58964660 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847283 chr5 58964723 58964796 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847285 chr5 58965020 58965081 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3851278 chr5 61416252 61416419 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3852577 chr5 62195092 62195577 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3852589 chr5 62198618 62198789 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3854804 chr5 63424226 63424461 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3855918 chr5 64162830 64163038 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3859478 chr5 66131269 66131527 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3859480 chr5 66131791 66132009 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3862726 chr5 68098555 68098668 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3862727 chr5 68098686 68099010 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3869821 chr5 71507660 71507749 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3871450 chr5 72414509 72414824 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3873300 chr5 73463029 73463213 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3878619 chr5 76422562 76422667 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3885143 chr5 79884295 79884459 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3885684 chr5 80156114 80156222 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3889756 chr5 82236578 82236679 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3890138 chr5 82442809 82443109 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3890140 chr5 82443396 82443632 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3890853 chr5 82890255 82890333 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890928 chr5 82929898 82929984 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890931 chr5 82930561 82930694 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890932 chr5 82930895 82931089 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3892642 chr5 84067710 84067851 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3892808 chr5 84178479 84178560 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3893302 chr5 84481489 84481606 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3893304 chr5 84481648 84481795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3894361 chr5 85148784 85149548 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3896713 chr5 86663937 86664066 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3898045 chr5 87498684 87498770 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3901963 chr5 90222885 90222970 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3902313 chr5 90438262 90438330 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3904188 chr5 91495604 91495778 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3906041 chr5 92760589 92760758 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3909782 chr5 95354436 95355112 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3910642 chr5 95850453 95850982 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3910644 chr5 95852650 95852762 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3911088 chr5 96113745 96113876 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3911134 chr5 96144172 96144254 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3911136 chr5 96145028 96145335 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3912694 chr5 97076553 97077163 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3916108 chr5 99381764 99381894 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3917448 chr5 100222495 100222666 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3917942 chr5 100525418 100525469 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3920041 chr5 101957900 101958007 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3920718 chr5 102399916 102399964 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3923316 chr5 104044899 104045066 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3923688 chr5 104302178 104302326 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3923691 chr5 104304569 104304746 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3923981 chr5 104507537 104507702 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3927846 chr5 107058472 107058797 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3928124 chr5 107243974 107244616 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3929214 chr5 108008445 108008517 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3931294 chr5 109302075 109302335 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3939083 chr5 114067976 114068374 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3939086 chr5 114069368 114069519 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941328 chr5 115569999 115570105 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941332 chr5 115571316 115571805 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941333 chr5 115571871 115572015 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941468 chr5 115638630 115639453 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3942646 chr5 116368779 116368906 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3942647 chr5 116368903 116369290 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3945992 chr5 118435523 118435601 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3951022 chr5 121598423 121598566 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3952365 chr5 122536280 122536386 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3952396 chr5 122552583 122552776 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3952409 chr5 122562107 122562265 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3952411 chr5 122563269 122563375 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3953129 chr5 122916572 122916901 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3953636 chr5 123233772 123233833 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3953641 chr5 123234487 123234653 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3953642 chr5 123234649 123234828 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3955045 chr5 124121693 124122044 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3956905 chr5 125261100 125261501 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3957794 chr5 125862317 125862500 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3958012 chr5 126037503 126038001 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3958118 chr5 126109966 126110023 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3960285 chr5 127256140 127256399 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3960290 chr5 127257728 127257889 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3960315 chr5 127274950 127275239 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3960317 chr5 127275750 127275966 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3966143 chr5 131114666 131114838 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3966145 chr5 131115357 131115490 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3971117 chr5 133713296 133713365 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977363 chr5 137133721 137133946 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977659 chr5 137327815 137328244 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977660 chr5 137328393 137328490 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER3985701 chr5 141048132 141048195 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER3992056 chr5 144232187 144232333 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3992157 chr5 144286630 144286849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993281 chr5 144972627 144972680 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993283 chr5 144973250 144973313 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993287 chr5 144976851 144977016 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993757 chr5 145228239 145228496 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993758 chr5 145228597 145228684 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993767 chr5 145234908 145235725 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3996511 chr5 146535367 146535577 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3996513 chr5 146535878 146536043 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3996516 chr5 146536678 146536760 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER3998313 chr5 147468192 147468708 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3999067 chr5 147850155 147850578 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3999347 chr5 147988241 147988470 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3999361 chr5 147996346 147996430 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER3999363 chr5 147997252 147997518 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3999877 chr5 148287519 148287632 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4005760 chr5 150831588 150831788 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4005786 chr5 150850982 150851158 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4008602 chr5 152127055 152127101 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4010148 chr5 152966277 152966424 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4015964 chr5 155598976 155599318 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4015965 chr5 155599396 155599716 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4016958 chr5 156117816 156118163 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4016959 chr5 156118339 156118447 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4017195 chr5 156253819 156253947 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4017515 chr5 156419174 156419810 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4017897 chr5 156626809 156626953 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4021177 chr5 158046023 158046184 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4024092 chr5 159633491 159633577 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4026734 chr5 160750223 160750366 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4028702 chr5 161914543 161914776 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4028922 chr5 162040096 162040537 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4030168 chr5 162792618 162792795 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031192 chr5 163385920 163386069 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031193 chr5 163386232 163386759 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031517 chr5 163548414 163548555 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031519 chr5 163548711 163548824 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4031701 chr5 163632147 163632669 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031899 chr5 163737885 163738055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031900 chr5 163738446 163738498 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4034167 chr5 165173646 165174445 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4034169 chr5 165174475 165174504 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4034568 chr5 165405142 165405721 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4035974 chr5 166246019 166246636 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4039109 chr5 168027256 168027435 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4042513 chr5 169673913 169673968 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4042514 chr5 169673978 169674185 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4042752 chr5 169799200 169799811 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4042754 chr5 169800105 169800228 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4048503 chr5 172380387 172380524 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4056040 chr5 175579902 175580041 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4057012 chr5 175957841 175958034 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4057013 chr5 175958113 175958358 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4061464 chr5 177885440 177885685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4061465 chr5 177885765 177885958 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4072200 chr5_GL339449v2_alt 1506145 1506234 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4074069 chr5_KI270794v1_alt 88844 89066 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4074072 chr5_KI270794v1_alt 89484 89761 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074088 chr5_KI270794v1_alt 101468 101702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074102 chr5_KI270794v1_alt 109630 109850 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074107 chr5_KI270794v1_alt 111084 111288 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4074183 chr5_KI270794v1_alt 158310 158506 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4074184 chr5_KI270794v1_alt 158713 158878 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074259 chr5_KI270795v1_alt 19976 20221 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074260 chr5_KI270795v1_alt 20301 20494 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4076934 chr5_KI270897v1_alt 1037635 1037724 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4077213 chr5_KI270898v1_alt 19976 20221 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4077214 chr5_KI270898v1_alt 20301 20494 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4077694 chr6 181972 182038 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4077696 chr6 182343 182772 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4081359 chr6 2548957 2549307 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4086198 chr6 5137583 5137898 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087818 chr6 6088810 6088881 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087824 chr6 6089935 6090242 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087825 chr6 6090308 6090482 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4088936 chr6 6787401 6787430 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4088938 chr6 6787734 6788129 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4091736 chr6 8178700 8178741 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4091738 chr6 8179039 8179139 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4093646 chr6 9331091 9331685 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4095614 chr6 10504604 10504687 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4101155 chr6 13495851 13495929 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4101183 chr6 13504824 13504905 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4101253 chr6 13535306 13535373 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4106640 chr6 16095660 16095766 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4110340 chr6 17940696 17940817 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4110342 chr6 17941125 17941320 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4116576 chr6 21241346 21241642 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4117605 chr6 21724671 21724767 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4118910 chr6 22452322 22452621 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4121291 chr6 23988278 23988333 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4121293 chr6 23988641 23988780 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4121294 chr6 23988797 23989048 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124824 chr6 25870188 25870316 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124825 chr6 25870580 25870999 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4128916 chr6 27799535 27799621 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4130383 chr6 28562191 28562739 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4134293 chr6 30691362 30691531 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4134701 chr6 30844868 30844992 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4134704 chr6 30845908 30846009 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4135307 chr6 31114273 31114350 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4139619 chr6 33387054 33387248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4140026 chr6 33545638 33545815 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4140631 chr6 33840816 33840961 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4140668 chr6 33859285 33859466 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4142822 chr6 34729671 34729877 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4147160 chr6 36520685 36520816 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4147161 chr6 36521157 36521386 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4156867 chr6 41289249 41289324 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4162234 chr6 43474117 43474182 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4168516 chr6 46889987 46890097 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4168518 chr6 46890393 46890435 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4168520 chr6 46890743 46891183 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4171406 chr6 48574233 48574337 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4173044 chr6 49598208 49598552 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4173047 chr6 49604763 49604854 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4183421 chr6 55943737 55944178 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4183881 chr6 56258115 56258220 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4184196 chr6 56447583 56448086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4185091 chr6 56998288 56998438 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4186880 chr6 58028991 58029158 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4187076 chr6 58142103 58142260 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4188297 chr6 60780390 60780653 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4188494 chr6 60895739 60895896 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4189871 chr6 62140118 62140179 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4190225 chr6 62369448 62369573 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4190227 chr6 62370369 62370740 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4192670 chr6 63866393 63866575 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4192671 chr6 63866782 63866860 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4194183 chr6 64886120 64886210 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4196464 chr6 66421558 66421719 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4196465 chr6 66421786 66421867 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4196856 chr6 66694540 66694666 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4200420 chr6 69064164 69064257 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4201978 chr6 70083671 70083965 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4205697 chr6 72448882 72449033 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4206367 chr6 72861209 72861301 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4208719 chr6 73987933 73988064 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4209521 chr6 74565438 74565631 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4210461 chr6 75226386 75226767 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4212104 chr6 76129229 76129749 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4212874 chr6 76653710 76653757 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4213501 chr6 77104849 77105338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4213913 chr6 77369899 77370093 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4213914 chr6 77370325 77370443 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4215519 chr6 78462093 78462214 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4215776 chr6 78622108 78622190 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4215777 chr6 78622332 78622419 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4215778 chr6 78622540 78622681 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4215868 chr6 78690801 78691188 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4215899 chr6 78716709 78716875 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217790 chr6 79864177 79864387 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217793 chr6 79865551 79865762 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217794 chr6 79865841 79866067 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217820 chr6 79877560 79877781 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217839 chr6 79888284 79888521 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218269 chr6 80145103 80145201 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218270 chr6 80145209 80145367 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218272 chr6 80145570 80145807 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218273 chr6 80145846 80146027 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4218345 chr6 80183164 80183284 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4218838 chr6 80526695 80527334 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4218874 chr6 80545605 80545767 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4220050 chr6 81367410 81367494 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4220053 chr6 81368134 81368324 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4221142 chr6 82054658 82055008 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4221143 chr6 82055040 82055258 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4222251 chr6 82697180 82697276 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4222252 chr6 82697740 82697929 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4227272 chr6 85801403 85801667 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4228648 chr6 86833041 86833172 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4230674 chr6 87887280 87887372 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4231376 chr6 88321694 88321945 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4231579 chr6 88456915 88457074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4231580 chr6 88457101 88457391 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4236748 chr6 91266149 91266646 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4238687 chr6 92586016 92586115 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4239383 chr6 93069928 93070781 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4241059 chr6 94192665 94192830 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4241061 chr6 94193107 94193489 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4241063 chr6 94193791 94193864 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4241186 chr6 94285979 94286034 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4241189 chr6 94287515 94287717 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4242389 chr6 95152390 95152459 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4244177 chr6 96305059 96305284 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4244178 chr6 96305403 96305475 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4244925 chr6 96803581 96803713 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4245991 chr6 97472464 97472658 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4249844 chr6 99899538 99900014 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4249847 chr6 99900925 99901028 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4254460 chr6 102927137 102927578 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4258150 chr6 105211921 105212094 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4260329 chr6 106501755 106501869 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4262795 chr6 107567618 107567723 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4262796 chr6 107567989 107568125 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4262870 chr6 107625787 107625972 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4264708 chr6 108463551 108464309 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4265550 chr6 108945846 108945892 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4268084 chr6 110338532 110339171 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4270752 chr6 111499247 111499435 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4271836 chr6 112125851 112125926 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4271837 chr6 112125969 112126294 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4273541 chr6 113206009 113206358 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4273807 chr6 113366625 113366748 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4273927 chr6 113425866 113426148 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4275531 chr6 114252519 114252645 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4275603 chr6 114302893 114303089 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4278013 chr6 115911424 115911767 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4278871 chr6 116475506 116475555 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4289553 chr6 123091780 123091966 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4291959 chr6 124682292 124682491 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4295426 chr6 126911365 126911469 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4295588 chr6 127013812 127013971 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4299708 chr6 129675614 129676069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4299709 chr6 129676233 129676368 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4300213 chr6 129956626 129956810 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4300292 chr6 129993317 129993483 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4300302 chr6 129996308 129996421 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4300822 chr6 130282211 130282307 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4301429 chr6 130680163 130680263 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4302424 chr6 131258439 131258746 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4302425 chr6 131258749 131258797 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4303422 chr6 131789254 131789439 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4304121 chr6 132172579 132173097 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4309181 chr6 135012827 135012865 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310158 chr6 135557671 135557739 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310159 chr6 135557886 135558447 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4310613 chr6 135833870 135833985 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310620 chr6 135840241 135840371 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310621 chr6 135840427 135840648 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4311203 chr6 136205796 136206030 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4311204 chr6 136206908 136207341 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4311485 chr6 136348035 136348835 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4312970 chr6 137127404 137127548 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4316997 chr6 139299889 139300319 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319013 chr6 140459953 140460005 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319014 chr6 140460147 140460339 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319016 chr6 140460787 140461040 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4326517 chr6 144965504 144965601 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4326519 chr6 144965994 144966236 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4326921 chr6 145209172 145209401 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4329173 chr6 146603517 146603667 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4330358 chr6 147307254 147307499 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4331011 chr6 147703523 147703658 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4332532 chr6 148556818 148557292 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4333700 chr6 149225856 149226031 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4335234 chr6 149882955 149883027 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4335615 chr6 150097178 150097324 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4335617 chr6 150097721 150097846 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4335939 chr6 150261321 150261403 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4343946 chr6 154588970 154589067 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4343949 chr6 154590085 154590358 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4346037 chr6 155696524 155696564 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4349116 chr6 157532668 157532830 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4349119 chr6 157534443 157534533 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4349122 chr6 157534882 157534949 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4352818 chr6 159512678 159513378 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4352958 chr6 159593925 159594201 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4355195 chr6 161014208 161014544 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4357344 chr6 162311110 162311438 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4359670 chr6 163808262 163808385 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4359671 chr6 163808685 163808792 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4359673 chr6 163809980 163810075 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4360510 chr6 164332176 164332311 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4361853 chr6 165165410 165165611 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4364285 chr6 166820385 166820996 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4364949 chr6 167250947 167251161 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4367374 chr6 169244111 169244313 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4367376 chr6 169244343 169244539 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4371974 chr6_GL000250v2_alt 2020869 2021038 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4374038 chr6_GL000251v2_alt 52072 52620 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4377920 chr6_GL000251v2_alt 2171106 2171275 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4378332 chr6_GL000251v2_alt 2324608 2324732 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4378335 chr6_GL000251v2_alt 2325651 2325752 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4386463 chr6_GL000252v2_alt 1947216 1947385 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4386879 chr6_GL000252v2_alt 2101129 2101253 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4386882 chr6_GL000252v2_alt 2102169 2102270 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4394660 chr6_GL000253v2_alt 2001615 2001784 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4395042 chr6_GL000253v2_alt 2155112 2155236 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4395045 chr6_GL000253v2_alt 2156153 2156254 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4401774 chr6_GL000254v2_alt 2035439 2035608 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4401915 chr6_GL000254v2_alt 2188948 2189072 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4401918 chr6_GL000254v2_alt 2189989 2190090 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4402499 chr6_GL000254v2_alt 2458390 2458467 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4406186 chr6_GL000254v2_alt 4823000 4823194 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4409562 chr6_GL000255v2_alt 1946476 1946645 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4409980 chr6_GL000255v2_alt 2099973 2100097 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4409983 chr6_GL000255v2_alt 2101014 2101115 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4414540 chr6_GL000255v2_alt 4581461 4581655 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4427083 chr7 1131506 1131913 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4427165 chr7 1166421 1166606 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4431733 chr7 3390269 3390461 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4431735 chr7 3390912 3390979 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4432357 chr7 3728359 3728573 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4432606 chr7 3866061 3866160 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4434629 chr7 4824691 4824903 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4440441 chr7 7037094 7037364 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4440443 chr7 7037757 7037980 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4441340 chr7 7594777 7594948 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4442606 chr7 8324409 8324451 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4442896 chr7 8527254 8527646 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4445582 chr7 10304259 10304365 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4445616 chr7 10321506 10321736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4445617 chr7 10321897 10322065 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4446034 chr7 10633858 10634397 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4448000 chr7 11933332 11933386 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4448004 chr7 11934715 11934912 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4451742 chr7 14342063 14342172 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4455381 chr7 16725908 16726607 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456479 chr7 17403160 17403349 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456482 chr7 17404121 17404370 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456487 chr7 17405801 17405886 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4456571 chr7 17460140 17460245 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4458305 chr7 18515445 18515650 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4458634 chr7 18745230 18745382 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4460179 chr7 19865554 19865690 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4461861 chr7 20893996 20894103 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4461863 chr7 20894596 20894725 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4464733 chr7 22548043 22548730 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4467246 chr7 23731753 23731995 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4467248 chr7 23732685 23732818 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4467600 chr7 23956553 23956966 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4469688 chr7 25105708 25105897 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4469975 chr7 25247490 25247732 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4474361 chr7 27735089 27735141 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4474362 chr7 27735193 27735364 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4474547 chr7 27848751 27848911 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4478161 chr7 29881674 29881817 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4478162 chr7 29882146 29882392 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4479477 chr7 30584980 30585198 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4479479 chr7 30585503 30585684 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4480658 chr7 31253845 31254000 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4481375 chr7 31640761 31640961 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4482303 chr7 32189698 32189796 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4482326 chr7 32201273 32201358 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4482374 chr7 32226349 32226456 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4482981 chr7 32512042 32512161 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4486775 chr7 34643584 34644278 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4491248 chr7 37149800 37150235 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4492889 chr7 38126340 38126465 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494224 chr7 38920964 38921126 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494226 chr7 38921443 38921728 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494227 chr7 38921884 38921960 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4497551 chr7 40538396 40538680 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4502406 chr7 43433494 43434122 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4502407 chr7 43434156 43434199 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4502944 chr7 43732608 43732713 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4506571 chr7 45438324 45438651 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4507499 chr7 46027725 46027907 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4511501 chr7 48475371 48475438 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4511758 chr7 48658485 48658672 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4513036 chr7 49457164 49457299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4513504 chr7 49752922 49753047 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4513505 chr7 49753265 49753325 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4514457 chr7 50358301 50358396 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4519383 chr7 53467940 53468126 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4519385 chr7 53468488 53468809 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4519626 chr7 53624734 53624844 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4525338 chr7 56748864 56748987 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4530469 chr7 63826753 63826876 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4533588 chr7 65441151 65441462 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4533590 chr7 65441943 65442274 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4535410 chr7 66135169 66135366 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4535701 chr7 66224061 66224641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539653 chr7 67695636 67695752 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539656 chr7 67696232 67696358 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539657 chr7 67696392 67696514 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4540358 chr7 67955105 67955299 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4540429 chr7 67975111 67975549 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4540431 chr7 67975857 67975979 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4540433 chr7 67976280 67976370 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4566127 chr7 78231471 78231891 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4566268 chr7 78337169 78337467 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4566269 chr7 78337713 78337859 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4567146 chr7 78905645 78905849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4569356 chr7 80270371 80270550 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4569410 chr7 80306469 80306577 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4570903 chr7 81236221 81236752 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4578070 chr7 85981239 85981409 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4578071 chr7 85981600 85981685 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4578106 chr7 86010212 86010300 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4578107 chr7 86010573 86010798 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4578737 chr7 86427136 86427372 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4578739 chr7 86427647 86428029 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4579622 chr7 86990623 86990694 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4582910 chr7 89094171 89094700 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4582984 chr7 89134265 89134369 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4589205 chr7 92941061 92941160 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4590680 chr7 93876290 93876511 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4590682 chr7 93876813 93876859 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4591880 chr7 94579575 94579665 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4596423 chr7 97297402 97297982 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4596493 chr7 97336770 97336873 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4596494 chr7 97337202 97337280 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609825 chr7 102965573 102965970 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609826 chr7 102966150 102966205 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609828 chr7 102966393 102966565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4610755 chr7 103466053 103466239 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4615955 chr7 106167396 106167560 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4615956 chr7 106167719 106167876 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4621843 chr7 109647679 109647811 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4621943 chr7 109716171 109716251 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4623862 chr7 110959526 110959652 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4623863 chr7 110960048 110960181 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4623865 chr7 110960509 110960666 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4624293 chr7 111260953 111261207 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4626566 chr7 112553763 112553980 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4626866 chr7 112742555 112742611 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4627649 chr7 113213697 113213876 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4628015 chr7 113465217 113465442 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4628017 chr7 113466002 113466251 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4628185 chr7 113586101 113586335 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4635368 chr7 118012676 118013344 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4640941 chr7 121591243 121591437 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4643390 chr7 123061904 123062038 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4643774 chr7 123312360 123312425 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4643775 chr7 123312451 123312524 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4648682 chr7 126282143 126282223 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4650478 chr7 127443606 127443827 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4653155 chr7 128793126 128793510 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4662362 chr7 133258121 133258218 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4663855 chr7 134109319 134109571 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4663857 chr7 134109890 134110360 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4664015 chr7 134194062 134194257 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4664021 chr7 134195795 134195893 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4664310 chr7 134353928 134354251 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4664312 chr7 134354388 134354491 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4664314 chr7 134354775 134354796 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4664913 chr7 134691639 134691854 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4664916 chr7 134693683 134693816 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4668309 chr7 136506880 136507028 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4669275 chr7 137085222 137085364 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4669491 chr7 137220319 137220713 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4669916 chr7 137527288 137527410 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4672634 chr7 138746219 138746506 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4672864 chr7 138835640 138835708 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4673389 chr7 139071503 139071567 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4674319 chr7 139459087 139459201 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4679275 chr7 141796184 141796249 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4679756 chr7 142108448 142109369 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4679758 chr7 142109434 142109484 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4679931 chr7 142206480 142206943 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4679951 chr7 142226521 142226666 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4681695 chr7 143378966 143379324 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4683387 chr7 144450806 144451108 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4683389 chr7 144451755 144451850 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4683568 chr7 144566651 144566778 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4683570 chr7 144567091 144567450 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4687400 chr7 146926902 146927521 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4687662 chr7 147081248 147081414 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4687666 chr7 147081753 147082401 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4687921 chr7 147256214 147256385 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4688061 chr7 147338316 147338574 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4688354 chr7 147524918 147525063 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4692741 chr7 149667213 149667368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693191 chr7 149942645 149943078 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693193 chr7 149943280 149943444 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693195 chr7 149943726 149943849 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4696328 chr7 151728232 151728411 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4698918 chr7 152857531 152857793 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4698920 chr7 152857943 152858255 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4698996 chr7 152905223 152905378 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4699755 chr7 153301101 153301280 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700847 chr7 153922852 153923107 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700848 chr7 153923213 153923391 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701167 chr7 154153065 154153188 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701169 chr7 154153487 154153580 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701171 chr7 154153986 154154289 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4702072 chr7 154738710 154738835 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4702201 chr7 154828374 154828473 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4708751 chr7 159260166 159260304 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4709154 chr7_KI270803v1_alt 70328 71249 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4709156 chr7_KI270803v1_alt 71314 71364 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4709329 chr7_KI270803v1_alt 168360 168823 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4709349 chr7_KI270803v1_alt 188401 188546 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4713833 chr8 931442 931541 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4716581 chr8 3126582 3126703 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4719376 chr8 5133016 5133093 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4719381 chr8 5133942 5134019 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4719573 chr8 5249930 5250032 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4720174 chr8 5606048 5606243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4722316 chr8 6844563 6844684 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4729933 chr8 11129913 11130010 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4731557 chr8 11991584 11991642 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4733028 chr8 12900434 12900539 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4735083 chr8 14046306 14046406 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4736160 chr8 14742627 14742978 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4736161 chr8 14743002 14743092 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4736543 chr8 14988505 14988606 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4739127 chr8 16549183 16549287 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4739128 chr8 16549344 16549769 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4739331 chr8 16685622 16685819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4739333 chr8 16686434 16686910 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4741947 chr8 18178633 18178814 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4742216 chr8 18328144 18328250 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4742865 chr8 18699605 18699671 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4745964 chr8 20318928 20319435 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4747029 chr8 20869694 20870068 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4747435 chr8 21094097 21094278 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4753969 chr8 24329476 24329538 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4754102 chr8 24409854 24409985 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4755003 chr8 24895568 24895799 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4755394 chr8 25085714 25085849 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4767989 chr8 31115747 31115973 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4767990 chr8 31115998 31116147 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4771630 chr8 33240971 33241141 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4771633 chr8 33241696 33241831 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4772730 chr8 33675659 33676143 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4772732 chr8 33676479 33676516 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4773418 chr8 34042354 34042735 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4774354 chr8 34630430 34630514 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4785817 chr8 40758395 40758438 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4785818 chr8 40758465 40758596 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4790029 chr8 42747172 42747229 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4790031 chr8 42747539 42747655 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4790032 chr8 42747722 42747884 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4796547 chr8 49501889 49502187 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4799791 chr8 51651751 51651958 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4800441 chr8 52009165 52009566 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4800443 chr8 52009774 52009864 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4802163 chr8 53016789 53016927 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4803157 chr8 53662704 53662884 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4805270 chr8 54711357 54711521 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4805272 chr8 54712559 54712919 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4812058 chr8 58758010 58758286 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4816846 chr8 61738328 61738614 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4817222 chr8 61960498 61960705 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4817225 chr8 61961119 61961338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4818072 chr8 62547335 62547376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4818073 chr8 62547501 62547810 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4819509 chr8 63374146 63374286 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4820294 chr8 63906159 63906365 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4820369 chr8 63952236 63952757 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4822241 chr8 65183321 65183567 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4822242 chr8 65183641 65183729 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4823941 chr8 66076115 66076265 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4824321 chr8 66297675 66297755 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4824856 chr8 66533516 66533572 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4828993 chr8 68650023 68650170 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4828997 chr8 68651098 68651129 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4833761 chr8 71268013 71268164 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4841512 chr8 75774662 75774833 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4844721 chr8 78021874 78022189 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4847161 chr8 79525885 79526185 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4847162 chr8 79526444 79526633 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4847245 chr8 79580660 79581064 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4848839 chr8 80332421 80332607 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4850595 chr8 81275690 81275873 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4852757 chr8 82573001 82573232 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4855352 chr8 84270079 84270553 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4855602 chr8 84425686 84425783 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4855604 chr8 84425825 84426051 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4857502 chr8 85569630 85569793 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4863686 chr8 89415784 89415833 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4864638 chr8 89967661 89967935 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4864642 chr8 89968980 89969057 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4865414 chr8 90457064 90457225 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4866002 chr8 90837072 90837258 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4866005 chr8 90837848 90838056 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4868786 chr8 92574624 92574788 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4870182 chr8 93429628 93430294 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4870287 chr8 93491453 93491591 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4873656 chr8 95074882 95075066 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4873657 chr8 95076033 95076232 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4874648 chr8 95583537 95583895 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4875781 chr8 96228018 96228311 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4877120 chr8 96959740 96959853 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4877122 chr8 96959940 96960103 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4877204 chr8 97025370 97025512 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4886772 chr8 101731554 101731679 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4886773 chr8 101731739 101732385 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4890202 chr8 103340280 103340672 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4890205 chr8 103341241 103341449 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4891860 chr8 104303781 104303900 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4893883 chr8 105486407 105486614 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4897325 chr8 107562724 107563217 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4897326 chr8 107563311 107563530 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4900496 chr8 109421003 109421141 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4900499 chr8 109421799 109421909 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4901570 chr8 110093831 110094054 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4901706 chr8 110192571 110192868 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4902263 chr8 110508028 110508191 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4902264 chr8 110508287 110508379 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4902987 chr8 110942583 110942750 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4905632 chr8 112605890 112605959 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4905637 chr8 112610353 112610810 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4906160 chr8 112924451 112924565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909376 chr8 114962407 114962553 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909378 chr8 114962768 114962998 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909379 chr8 114963061 114963105 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4911623 chr8 116368361 116368780 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4912959 chr8 117075396 117075627 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4914540 chr8 117948831 117948979 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4917229 chr8 119386412 119386850 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4917463 chr8 119513869 119514530 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4918543 chr8 120005205 120005848 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4920341 chr8 120940493 120940624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4920342 chr8 120940880 120941265 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4923039 chr8 122368241 122368361 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4923040 chr8 122368379 122368693 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4926399 chr8 123825623 123826184 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930475 chr8 125654578 125654920 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930599 chr8 125704269 125704329 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930601 chr8 125704744 125704928 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930608 chr8 125706725 125707142 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930773 chr8 125775231 125775612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930775 chr8 125775762 125776256 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4937597 chr8 128942990 128943847 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4941147 chr8 130561981 130562062 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941617 chr8 130767460 130768168 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941962 chr8 130926099 130926152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941964 chr8 130926224 130926385 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941973 chr8 130932856 130933056 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4942995 chr8 131463727 131463874 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4943259 chr8 131605960 131606200 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943446 chr8 131699442 131700097 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943724 chr8 131840472 131840690 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943725 chr8 131840709 131840957 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943729 chr8 131843385 131843508 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943731 chr8 131844058 131844178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4944244 chr8 132133993 132134105 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4945305 chr8 132596963 132597167 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4947892 chr8 133793524 133793690 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4947894 chr8 133793775 133793871 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4948586 chr8 134131509 134132190 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4948736 chr8 134203209 134203356 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4948947 chr8 134315611 134315759 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4950083 chr8 134899459 134900148 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4952382 chr8 136071227 136071608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954220 chr8 137028520 137028724 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954221 chr8 137028758 137028923 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954223 chr8 137029338 137029383 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4956933 chr8 138532877 138533219 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4957303 chr8 138721039 138721601 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4958903 chr8 139592035 139592305 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4960099 chr8 140250833 140250954 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4963369 chr8 142021005 142021176 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4966112 chr8 143709660 143709725 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4966113 chr8 143709836 143709940 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4966115 chr8 143710231 143710252 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4967187 chr8 144298101 144298166 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4969629 chr8_KI270812v1_alt 69801 69900 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4971034 chr8_KI270816v1_alt 186707 186772 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4971035 chr8_KI270816v1_alt 186883 186987 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4971037 chr8_KI270816v1_alt 187278 187299 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4980623 chr9 3091937 3092124 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4980626 chr9 3093968 3094063 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4980749 chr9 3172156 3172453 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4985622 chr9 5976481 5976548 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER4989772 chr9 8211374 8211596 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4989915 chr9 8296261 8296351 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4989916 chr9 8296568 8296730 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4992330 chr9 9926615 9926810 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER4992331 chr9 9926878 9927189 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4993112 chr9 10405038 10405174 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4993113 chr9 10405291 10405468 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER4993334 chr9 10555434 10555620 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4995370 chr9 11883008 11883178 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4996565 chr9 12644108 12644546 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER4996567 chr9 12644597 12644714 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004127 chr9 17129789 17130072 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004778 chr9 17538184 17538349 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004780 chr9 17538684 17538768 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004784 chr9 17539462 17539504 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004786 chr9 17545587 17545822 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5005706 chr9 18135363 18135514 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5005708 chr9 18135636 18135664 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5008892 chr9 19822708 19822927 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5013069 chr9 22378618 22378709 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5013966 chr9 22948374 22948641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5013967 chr9 22948707 22948855 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5014223 chr9 23127128 23127331 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5015859 chr9 24182571 24182723 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5015860 chr9 24182855 24183048 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5017893 chr9 25509580 25510119 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5019843 chr9 26767405 26767534 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5024812 chr9 29758798 29758906 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5025068 chr9 29929814 29930184 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5025069 chr9 29930219 29930345 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5026987 chr9 31210570 31210982 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5028774 chr9 32359182 32359249 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5029416 chr9 32704019 32704138 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5029417 chr9 32704227 32704503 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5029945 chr9 32969306 32969398 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5029946 chr9 32969546 32969650 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5042947 chr9 38876342 38876514 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5042948 chr9 38876609 38876747 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5052262 chr9 62100772 62100944 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5052263 chr9 62101039 62101262 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5059474 chr9 67487210 67487348 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5059475 chr9 67487443 67487615 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5061693 chr9 68969539 68969999 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5062287 chr9 69202957 69203090 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5063585 chr9 69911742 69912031 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5064089 chr9 70179006 70179140 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5064091 chr9 70179558 70179619 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064180 chr9 70253359 70253453 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064181 chr9 70253533 70253570 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064183 chr9 70253929 70254101 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5064521 chr9 70404652 70404721 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5064523 chr9 70405319 70405461 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5066120 chr9 71306052 71306214 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5066713 chr9 71654312 71654478 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5066715 chr9 71654753 71655024 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5069119 chr9 72675480 72676426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5070859 chr9 73770932 73771153 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5070860 chr9 73771359 73771414 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5070950 chr9 73830105 73830327 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5070965 chr9 73843116 73843268 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5082912 chr9 80438215 80438569 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5083378 chr9 80754506 80754592 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5084046 chr9 81175095 81175325 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5086229 chr9 82350971 82351043 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5087650 chr9 83242641 83242913 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5087651 chr9 83243518 83243694 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5088038 chr9 83451952 83452147 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5091849 chr9 85365638 85365791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5091850 chr9 85365824 85365939 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5095018 chr9 86953975 86954108 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5097047 chr9 88056667 88056786 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5101517 chr9 90541842 90541965 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5101998 chr9 90830930 90830992 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5103935 chr9 91916291 91916364 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5104132 chr9 92001773 92002110 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5104175 chr9 92020135 92020235 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5105882 chr9 92924854 92925049 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5111383 chr9 95856392 95856739 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5112655 chr9 96445785 96445968 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5112656 chr9 96446170 96446347 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5119719 chr9 99630461 99631311 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5121417 chr9 100457542 100457684 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5122547 chr9 101065441 101065490 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5123759 chr9 101751047 101751431 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5126648 chr9 103491914 103492010 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5126650 chr9 103492655 103492747 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5130203 chr9 105354420 105354565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5133635 chr9 107230951 107231709 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5141166 chr9 110756660 110756859 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5142651 chr9 111495461 111495533 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5142982 chr9 111618976 111619110 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5147982 chr9 113798835 113798973 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5150453 chr9 114850822 114850982 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5154909 chr9 116919433 116919512 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5154910 chr9 116919572 116919664 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5154912 chr9 116919957 116920091 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5160579 chr9 119586733 119586786 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5160582 chr9 119588047 119588306 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5162155 chr9 120262162 120262377 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5162160 chr9 120263148 120263470 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5165109 chr9 121539604 121539700 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5165112 chr9 121540243 121540347 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5167142 chr9 122403735 122403835 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5177354 chr9 127032391 127032574 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5177398 chr9 127056098 127056362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5178133 chr9 127419475 127419933 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5178733 chr9 127632732 127632858 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5178735 chr9 127633156 127633192 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5192460 chr9 133337106 133337232 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5192842 chr9 133561585 133561755 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5200908 chr9_GL383541v1_alt 160974 161108 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5200910 chr9_GL383541v1_alt 161526 161587 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5201747 chr9_KI270823v1_alt 116644 116693 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5216990 chrX 4246916 4247352 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5222263 chrX 6942366 6942473 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5222397 chrX 7020531 7021036 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5222398 chrX 7021050 7021386 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5224035 chrX 8025728 8026202 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5224049 chrX 8033765 8033840 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5231956 chrX 12415903 12416027 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5232186 chrX 12549441 12549530 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5232611 chrX 12772731 12772988 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5233438 chrX 13209280 13209387 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5233441 chrX 13210691 13211067 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5233977 chrX 13491615 13491715 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5234050 chrX 13523463 13523600 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5234053 chrX 13524242 13524440 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5238759 chrX 16012421 16012660 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5244164 chrX 18636066 18636296 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5245664 chrX 19320122 19320527 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5245666 chrX 19320848 19320913 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5248140 chrX 20479774 20480441 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5248707 chrX 20787696 20788383 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5248720 chrX 20792307 20792449 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5250255 chrX 21806847 21806974 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5250263 chrX 21810596 21810654 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5250265 chrX 21811156 21811333 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5251260 chrX 22294168 22294252 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5251285 chrX 22307235 22307346 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5251286 chrX 22307622 22307745 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5251319 chrX 22323262 22323323 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5251697 chrX 22523964 22524070 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5253871 chrX 23754273 23754641 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5253874 chrX 23754854 23755255 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5254799 chrX 24082491 24082622 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5254805 chrX 24084777 24084862 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5257132 chrX 25138103 25138297 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5257133 chrX 25138469 25138553 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5259229 chrX 26434596 26434700 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5261042 chrX 27435913 27435968 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5261623 chrX 27735650 27735812 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5264895 chrX 29610469 29610603 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5265881 chrX 30204711 30204856 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5267817 chrX 31243896 31244401 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5268932 chrX 31860651 31861099 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5268942 chrX 31862450 31862574 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5270841 chrX 33072506 33072659 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5270870 chrX 33089618 33089790 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5273633 chrX 34858624 34858680 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5273876 chrX 35023421 35023671 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5274264 chrX 35265514 35265829 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5274654 chrX 35502589 35503162 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5275629 chrX 36084509 36084653 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5276325 chrX 36538665 36538985 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5276686 chrX 36791109 36791370 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5276691 chrX 36793729 36793787 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5278113 chrX 37827808 37828012 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5278226 chrX 37880964 37881121 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5278495 chrX 38020590 38020688 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5287736 chrX 42324717 42324900 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289566 chrX 43386134 43386321 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289568 chrX 43386895 43386983 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289661 chrX 43438701 43439328 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5291239 chrX 44325175 44325583 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5291248 chrX 44327152 44327351 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5292018 chrX 44603128 44603241 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5292021 chrX 44603900 44603960 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5293412 chrX 45127615 45128059 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5294210 chrX 45568222 45568409 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5296610 chrX 46802683 46802747 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5316641 chrX 56734239 56734560 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5337323 chrX 73436161 73436205 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5342072 chrX 76970007 76970099 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5342110 chrX 77007493 77007643 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5344224 chrX 78166905 78167068 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5345804 chrX 79386757 79387035 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5347483 chrX 80648594 80648822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5358471 chrX 88431580 88431631 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5361842 chrX 90579657 90579955 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5363044 chrX 91442506 91443245 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5370401 chrX 96377915 96378208 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5372076 chrX 97314506 97314582 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5382080 chrX 103319053 103319181 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5388746 chrX 107227496 107227638 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5390158 chrX 107883837 107884207 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5393307 chrX 109850105 109850420 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5395604 chrX 111120308 111120499 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5395605 chrX 111120635 111120782 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5395758 chrX 111210003 111210345 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5399553 chrX 113288463 113288506 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5400480 chrX 113866685 113867045 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5400483 chrX 113867559 113867734 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5401804 chrX 114614863 114614913 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5406067 chrX 117385528 117385690 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5406544 chrX 117721392 117721691 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5406547 chrX 117722444 117722724 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5407247 chrX 118167770 118167902 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5413699 chrX 121097410 121097554 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5414234 chrX 121388896 121389017 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5416409 chrX 122878336 122878413 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5416410 chrX 122878515 122878580 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5424070 chrX 127324388 127324468 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5426647 chrX 129034528 129034986 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5426760 chrX 129100588 129100796 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5426819 chrX 129129982 129130106 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5431045 chrX 131265085 131265252 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5432568 chrX 132169674 132169799 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5436012 chrX 134009649 134010006 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5436014 chrX 134010482 134010803 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5442150 chrX 136946013 136946158 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5442152 chrX 136946461 136946684 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5444167 chrX 137914897 137915118 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5445277 chrX 138570480 138570648 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5454098 chrX 143443161 143443277 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5461536 chrX 147715394 147715475 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5463479 chrX 148867428 148867581 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5463512 chrX 148894474 148894519 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5464200 chrX 149341664 149341882 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5465317 chrX 150036480 150036587 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5465319 chrX 150037325 150037449 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5465320 chrX 150037679 150037794 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5467818 chrX 151279240 151279395 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5467820 chrX 151279811 151280014 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5474787 chrX 155084227 155084328 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5502700 chrY 15322727 15323124 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5502701 chrY 15323233 15323445 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5505576 chrY 17050491 17050961 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5511464 chrY 21340669 21340741 0 LTR EUTREP8|LTR|LTR-HOMER5521335 chr10_KQ090021v1_fix 40555 40746 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5521382 chr10_KQ090021v1_fix 64705 64925 0 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5521383 chr10_KQ090021v1_fix 65148 65263 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5521648 chr10_KQ090021v1_fix 220405 220478 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5521715 chr10_KQ090021v1_fix 243360 243718 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5521718 chr10_KQ090021v1_fix 244451 244650 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5524003 chr12_KN538369v1_fix 277801 277878 1 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5524004 chr12_KN538369v1_fix 277881 278160 1 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5525402 chr12_KQ759760v1_fix 225141 225205 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5525403 chr12_KQ759760v1_fix 225217 225349 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5526221 chr12_KZ208916v1_fix 366348 366479 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5526223 chr12_KZ208916v1_fix 366857 367255 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5526224 chr12_KZ208916v1_fix 367251 367400 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5526611 chr12_KZ208916v1_fix 585861 586370 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5526612 chr12_KZ208916v1_fix 586625 586701 0 LTR EUTREP16|LTR|LTR-HOMER5528661 chr13_KN538372v1_fix 302197 302285 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5529409 chr13_KQ090025v1_alt 82960 83363 0 LTR EUTREP8|LTR|LTR-HOMER5530198 chr14_KZ208920v1_fix 107313 107403 0 LTR EUTREP8|LTR|LTR-HOMER5530202 chr14_KZ208920v1_fix 108462 108628 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5530409 chr14_KZ208920v1_fix 215307 215346 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5530415 chr14_KZ208920v1_fix 217384 217461 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5530416 chr14_KZ208920v1_fix 217590 217724 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5530417 chr14_KZ208920v1_fix 217742 217896 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5530423 chr14_KZ208920v1_fix 223050 223112 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5533637 chr15_KN538374v1_fix 1341946 1342228 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5543179 chr16_KV880768v1_fix 38725 38921 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5543180 chr16_KV880768v1_fix 38942 39023 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5544326 chr16_KV880768v1_fix 493494 494025 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5546386 chr16_KV880768v1_fix 1309686 1310216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5547595 chr16_KV880768v1_fix 1777222 1777753 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5547857 chr16_KV880768v1_fix 1874438 1874535 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5547860 chr16_KV880768v1_fix 1875153 1875420 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5551312 chr18_KZ208922v1_fix 33835 33982 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5551347 chr18_KZ208922v1_fix 50968 51050 0 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5551349 chr18_KZ208922v1_fix 51227 51355 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5563292 chr1_KQ458384v1_alt 178541 178631 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5563294 chr1_KQ458384v1_alt 178885 179234 1 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5564258 chr1_KV880763v1_alt 207152 207354 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5564749 chr1_KV880763v1_alt 543108 543709 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5564750 chr1_KV880763v1_alt 543779 543944 1 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5567868 chr22_KQ759762v1_fix 72789 72864 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5567869 chr22_KQ759762v1_fix 73759 73934 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5568337 chr2_KN538363v1_fix 72705 72953 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5568339 chr2_KN538363v1_fix 73246 73348 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5568341 chr2_KN538363v1_fix 73662 73825 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5568343 chr2_KN538363v1_fix 74115 74236 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5568345 chr2_KN538363v1_fix 74531 74557 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571169 chr2_KZ208907v1_alt 166051 166253 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571170 chr2_KZ208907v1_alt 166403 166490 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571557 chr2_KZ208908v1_alt 131950 132083 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571560 chr2_KZ208908v1_alt 132669 132890 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571999 chr3_KN196475v1_fix 204305 204783 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5572003 chr3_KN196475v1_fix 208167 208424 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5574951 chr3_KV766192v1_fix 96451 96737 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5575323 chr3_KV766192v1_fix 351851 352027 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5575324 chr3_KV766192v1_fix 352193 352466 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5576030 chr4_KQ090014v1_alt 72238 72439 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5576478 chr4_KQ090015v1_alt 225857 225922 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5578867 chr5_KV575244v1_fix 15962 16118 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5582139 chr6_KZ208911v1_fix 15488 15571 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5582945 chr7_KQ031388v1_fix 150676 150809 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5585988 chr7_KZ208913v1_alt 500263 500565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5585990 chr7_KZ208913v1_alt 501212 501307 0 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5586172 chr7_KZ208913v1_alt 616382 616509 1 LTR LTR106_Mam|LTR|LTR-HOMER5586174 chr7_KZ208913v1_alt 616822 617181 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5586457 chr8_KV880766v1_fix 106620 106742 1 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5586734 chr8_KV880767v1_fix 98364 98517 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5586737 chr8_KV880767v1_fix 98637 99318 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5587134 chr8_KZ208914v1_fix 28704 28769 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5587706 chr8_KZ208915v1_fix 184929 185128 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5587708 chr8_KZ208915v1_fix 185455 185543 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5587791 chr8_KZ208915v1_fix 239859 239939 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5588614 chr8_KZ208915v1_fix 761401 761486 1 LTR LTR90B|LTR|LTR-HOMER5589530 chr8_KZ208915v1_fix 1356376 1356434 1 LTR LTR90A|LTR|LTR-HOMER5591178 chr8_KZ208915v1_fix 2216905 2217029 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5591677 chr8_KZ208915v1_fix 2510601 2510815 1 LTR EUTREP16|LTR|LTR-HOMER5591854 chr8_KZ208915v1_fix 2629289 2629614 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5592254 chr8_KZ208915v1_fix 2837404 2837472 1 LTR EUTREP8|LTR|LTR-HOMER5592986 chr8_KZ208915v1_fix 3260834 3260938 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5593210 chr8_KZ208915v1_fix 3375043 3375729 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5595142 chr8_KZ208915v1_fix 4300918 4301015 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5597399 chr8_KZ208915v1_fix 5450896 5450981 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5598326 chr8_KZ208915v1_fix 5996491 5996710 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5598328 chr8_KZ208915v1_fix 5997452 5997709 0 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5598329 chr8_KZ208915v1_fix 5997895 5997984 0 LTR LTR107_Mam|LTR|LTR-HOMER5599411 chr9_KN196479v1_fix 163200 163326 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5601255 chr11_KZ559108v1_fix 103850 104082 1 LTR LTR91A|LTR|LTR-HOMER5601510 chr11_KZ559108v1_fix 256343 256461 1 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5606130 chr3_KZ559102v1_alt 57227 57550 0 LTR LTR91|LTR|LTR-HOMER5606145 chr3_KZ559102v1_alt 64411 64530 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5606351 chr3_KZ559102v1_alt 188545 188940 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5606353 chr3_KZ559102v1_alt 189554 189955 1 LTR