MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER26494 chr1 13938563 13938716 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER146839 chr1 64329466 64330208 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER181656 chr1 84421868 84422153 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER258719 chr1 148838928 148839023 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER299983 chr1 170153260 170154829 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER333412 chr1 188703284 188704235 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER443763 chr1 248702144 248702395 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER445533 chr10 979970 981408 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER451347 chr10 4958131 4958858 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER451429 chr10 5007635 5008356 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER451474 chr10 5034452 5034757 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER451625 chr10 5147371 5147967 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER459172 chr10 9162379 9162586 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER494608 chr10 27635041 27635483 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER527476 chr10 48722035 48722083 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER534874 chr10 53205389 53205660 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER534876 chr10 53206040 53206698 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER534920 chr10 53237522 53237580 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER537657 chr10 55006633 55006884 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER575750 chr10 74729398 74729444 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER603118 chr10 89636752 89636867 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER603120 chr10 89637158 89637204 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER609163 chr10 92672715 92672811 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER633860 chr10 104303226 104303796 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER653199 chr10 115107113 115108273 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER814791 chr11 73214411 73214480 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER911052 chr11 123852623 123854148 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER916781 chr11 127158878 127160175 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1009486 chr12 45686225 45686887 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1038559 chr12 60528290 60528470 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1104987 chr12 97430730 97430847 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1121148 chr12 105400565 105400636 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1124811 chr12 107081959 107082025 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1124814 chr12 107085912 107086917 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1124816 chr12 107087109 107087259 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1206574 chr13 26520115 26520179 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1216661 chr13 31807405 31807457 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1279905 chr13 68904621 68904710 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1285943 chr13 72692575 72693422 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1299986 chr13 80976887 80976988 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1299988 chr13 80977018 80977662 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1301521 chr13 81990844 81990952 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1302062 chr13 82344500 82344964 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1308190 chr13 86365278 86366425 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1323988 chr13 95814584 95814710 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1365631 chr14 24554010 24554592 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1365634 chr14 24554904 24555965 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1388825 chr14 38017249 38017390 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1457767 chr14 75557659 75557943 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1517247 chr14 106430293 106430990 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1517983 chr14_GL000009v2_random 62568 62671 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1517984 chr14_GL000009v2_random 62785 62840 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1517994 chr14_GL000009v2_random 65874 65929 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1518018 chr14_GL000009v2_random 72846 72978 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1521560 chr14_KI270846v1_alt 921972 922669 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1532493 chr15 23991519 23992490 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1532495 chr15 23992536 23992712 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1533065 chr15 24310475 24311025 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1533449 chr15 24517524 24518061 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1533645 chr15 24627399 24628522 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1533649 chr15 24629445 24629508 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1763783 chr16 27653238 27653300 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1775056 chr16 32074846 32074992 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1776404 chr16 33018103 33018249 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1777606 chr16 33836153 33836299 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1872320 chr16_KI270728v1_random 1279758 1279904 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1949838 chr17 35319444 35319647 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1974498 chr17 46040916 46041071 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2053787 chr17_GL000258v2_alt 747545 747700 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2069713 chr17_KI270908v1_alt 743028 743183 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2097455 chr18 14266516 14266666 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2097549 chr18 14295023 14295252 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2124269 chr18 34726304 34727297 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2151311 chr18 50460589 50460651 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2200675 chr18_GL383567v1_alt 175611 175673 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2314854 chr19 49081645 49082486 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2314856 chr19 49082792 49082880 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2322406 chr19 52011265 52011602 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2328191 chr19 54366239 54366489 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2328193 chr19 54366788 54367046 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2333055 chr19 56363415 56364094 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2342819 chr19_GL949747v2_alt 347645 347895 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2342821 chr19_GL949747v2_alt 348194 348452 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2349311 chr19_GL949752v1_alt 270890 271140 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2349313 chr19_GL949752v1_alt 271439 271697 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2351762 chr19_GL949753v2_alt 348200 348450 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2351764 chr19_GL949753v2_alt 348749 349007 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2362282 chr19_KI270938v1_alt 348960 349210 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2362284 chr19_KI270938v1_alt 349509 349767 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2394938 chr2 14444955 14446221 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2404869 chr2 20028876 20028925 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2406975 chr2 21171787 21171985 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2406978 chr2 21172880 21173138 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2503235 chr2 72386197 72386691 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2505950 chr2 73738001 73738129 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2517319 chr2 80282973 80283016 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2518530 chr2 81048293 81049605 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2536844 chr2 94771641 94771881 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2599604 chr2 130054099 130054334 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2601877 chr2 131283130 131283365 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2745293 chr2 216901336 216902156 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2745295 chr2 216902466 216902777 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2807440 chr20 7058251 7058323 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2807441 chr20 7058395 7058475 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2843025 chr20 30645153 30645288 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2843027 chr20 30645616 30645848 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2941635 chr21 22158424 22158798 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2985628 chr21_GL383579v2_alt 55951 56325 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3036397 chr22 36897562 36897785 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3057376 chr22 45420264 45420311 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3195799 chr3 63851897 63852287 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3273533 chr3 113863933 113864118 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3276017 chr3 115380068 115380496 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3333142 chr3 146429237 146429621 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3333144 chr3 146430047 146430197 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3338925 chr3 149932331 149933362 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3338926 chr3 149933363 149933441 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3364039 chr3 164741213 164741308 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3376637 chr3 172361075 172361753 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3388993 chr3 179476836 179476929 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3412376 chr3 191106641 191106858 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3412891 chr3 191404858 191406482 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3454744 chr4 11999539 11999644 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3491238 chr4 31358201 31358688 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3514979 chr4 44062112 44062250 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3524064 chr4 49574561 49574693 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3530392 chr4 55278836 55279192 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3554811 chr4 70455965 70456214 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3629550 chr4 115078319 115078608 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3629552 chr4 115078834 115078957 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3647099 chr4 126024040 126024077 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3702403 chr4 159491143 159492159 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3719503 chr4 169882909 169883045 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3785429 chr5 18197234 18198849 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3814245 chr5 35262184 35262235 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3815361 chr5 35942919 35943343 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3826299 chr5 42108931 42109097 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3826301 chr5 42109586 42110376 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3893765 chr5 84780815 84780898 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3906107 chr5 92788061 92789635 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3990618 chr5 143463694 143464401 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3990620 chr5 143464714 143465631 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4086500 chr6 5319821 5320072 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4112160 chr6 18823124 18823314 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4133873 chr6 30493707 30494073 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4187353 chr6 58374668 58376201 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4188699 chr6 61070950 61072476 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4213899 chr6 77362252 77363141 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4213901 chr6 77363421 77363680 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4243093 chr6 95616259 95616732 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4331382 chr6 147930043 147930415 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4377500 chr6_GL000251v2_alt 1973442 1973808 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4386043 chr6_GL000252v2_alt 1749539 1749905 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4394241 chr6_GL000253v2_alt 1803942 1804308 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4401354 chr6_GL000254v2_alt 1837763 1838129 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4409142 chr6_GL000255v2_alt 1748803 1749169 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4417656 chr6_GL000256v2_alt 1794476 1794842 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4498743 chr7 41288387 41288524 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4506385 chr7 45307576 45308396 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4516019 chr7 51367660 51368794 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4561185 chr7 75934338 75935241 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4598413 chr7 98261235 98262187 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4608230 chr7 102269737 102269851 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4632513 chr7 116331210 116331274 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4694206 chr7 150541233 150541463 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4694207 chr7 150541454 150541560 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4743202 chr8 18904300 18904627 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4752279 chr8 23431073 23431133 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4769024 chr8 31687417 31687494 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4791553 chr8 43527163 43527970 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4791556 chr8 43528643 43529121 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4914369 chr8 117854844 117854916 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4939374 chr8 129823353 129824350 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4964964 chr8 143066929 143066972 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4971374 chr8_KI270817v1_alt 57233 57276 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5031391 chr9 33597275 33597516 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5034410 chr9 35011976 35012290 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045382 chr9 40295712 40295817 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045384 chr9 40295937 40296021 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045409 chr9 40302895 40302964 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045411 chr9 40303281 40303434 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045420 chr9 40306253 40306311 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045421 chr9 40306383 40307958 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049619 chr9 42932622 42932855 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049623 chr9 42934155 42934222 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049625 chr9 42934539 42934692 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055147 chr9 64441936 64442041 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055148 chr9 64442161 64442245 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055172 chr9 64449129 64449198 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055174 chr9 64449515 64449668 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057331 chr9 66057563 66057702 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057333 chr9 66058010 66058252 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057380 chr9 66072873 66073026 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057382 chr9 66073343 66073412 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057408 chr9 66080285 66080369 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057410 chr9 66080489 66080594 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5098775 chr9 88825331 88825478 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5098818 chr9 88846005 88846924 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5105818 chr9 92888421 92888596 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5107470 chr9 93874207 93875424 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5274003 chrX 35109804 35111349 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5287276 chrX 42077203 42078403 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5287278 chrX 42078716 42078913 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5332260 chrX 70948041 70948405 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5332262 chrX 70948725 70948845 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5336308 chrX 72668723 72669337 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5336312 chrX 72672029 72672380 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5345366 chrX 79045207 79045325 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5346917 chrX 80216691 80218294 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5357327 chrX 87678890 87679350 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5360154 chrX 89500181 89500794 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5360839 chrX 89938776 89939192 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5362444 chrX 91017043 91017107 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5368884 chrX 95398094 95398135 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5373369 chrX 98062193 98062540 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5373371 chrX 98062831 98062882 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5373456 chrX 98115473 98115526 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5373458 chrX 98115667 98116031 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5382278 chrX 103420503 103420904 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5444207 chrX 137938065 137938160 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5451459 chrX 141918106 141918304 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5454631 chrX 143757904 143758395 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5459138 chrX 146405381 146405449 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5484810 chrY 3156058 3156676 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5485479 chrY 3596335 3596751 1 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5486934 chrY 4591864 4591928 0 LTR MST-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5509427 chrY 19536448 19536586 0 LTR