MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER383	chr1	260946	261385	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER476	chr1	350351	350790	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER6031	chr1	4239939	4240180	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER6033	chr1	4240738	4240924	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER12004	chr1	7544615	7545054	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER66550	chr1	29434917	29434978	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER66552	chr1	29435285	29435473	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER66554	chr1	29435781	29435971	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER66556	chr1	29437599	29437675	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER66557	chr1	29437666	29437908	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER90685	chr1	39500578	39500651	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER90687	chr1	39500954	39501333	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER106361	chr1	46145316	46145752	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER107895	chr1	46820992	46821127	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER107897	chr1	46822233	46822363	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER108050	chr1	46927825	46928254	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER108355	chr1	47150643	47151084	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER147679	chr1	64730379	64730824	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER184015	chr1	85650537	85650993	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER190208	chr1	89285504	89285950	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER191911	chr1	90308310	90308596	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER221987	chr1	107559720	107560108	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER237744	chr1	115759177	115759625	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER256848	chr1	147843105	147843543	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER265063	chr1	151667952	151668133	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER282461	chr1	160729080	160729125	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER312482	chr1	177131672	177132076	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER328675	chr1	185740484	185740715	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER328677	chr1	185741023	185741276	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER338272	chr1	191791304	191791746	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER339066	chr1	192284129	192284541	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER356396	chr1	202316129	202316556	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER376457	chr1	212465933	212466010	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER376459	chr1	212466304	212466669	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER441344	chr1	247159134	247159542	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER444174	chr1	248933237	248933680	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER455814	chr10	7373005	7373431	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER458206	chr10	8601410	8601735	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER476650	chr10	18243473	18243915	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER485125	chr10	22810498	22810928	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER485730	chr10	23136783	23136837	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER486458	chr10	23458769	23458847	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER486460	chr10	23459529	23459934	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER487047	chr10	23763777	23763854	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER487049	chr10	23764930	23765010	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER497669	chr10	29115641	29116091	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER498839	chr10	29742014	29742455	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER507386	chr10	34213046	34213487	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER513502	chr10	37476455	37476678	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER513504	chr10	37476970	37477194	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER517268	chr10	42826948	42827365	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER518951	chr10	43662710	43662779	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER526772	chr10	48296570	48296614	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER529962	chr10	50216943	50217220	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER529964	chr10	50217527	50217731	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER531114	chr10	50903096	50903169	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER537447	chr10	54862487	54862936	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER546114	chr10	60151218	60151729	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER549471	chr10	62113995	62114066	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER549473	chr10	62114383	62114690	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER563763	chr10	69404435	69404880	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER578605	chr10	76171837	76172286	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER590741	chr10	82758968	82759366	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER590742	chr10	82759371	82759470	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER601044	chr10	88502202	88502658	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER603440	chr10	89796871	89796935	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER639791	chr10	107654018	107654254	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER639793	chr10	107654568	107654784	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER647126	chr10	111885767	111886263	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER656345	chr10	116991301	116991767	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER657375	chr10	117474635	117475006	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER683643	chr10	133774124	133774567	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER689726	chr11	3182795	3183016	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER689728	chr11	3183320	3183522	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER693616	chr11	5379829	5380044	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER699106	chr11	8689926	8690321	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER715565	chr11	17151849	17151916	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER720684	chr11	19635420	19635868	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER724287	chr11	21528258	21528690	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER725446	chr11	22186100	22186550	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER728011	chr11	23704763	23705199	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER731071	chr11	25588016	25588369	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER731072	chr11	25588889	25588972	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER732467	chr11	26440254	26440342	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER738402	chr11	29764759	29765201	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER739457	chr11	30386040	30386100	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER749664	chr11	35647485	35648019	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER753879	chr11	37987918	37988265	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER763174	chr11	43355722	43356164	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER768429	chr11	45813938	45814011	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER768431	chr11	45814302	45814445	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER768433	chr11	45814722	45814818	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER768437	chr11	45815639	45815767	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER907601	chr11	122255469	122255899	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER909883	chr11	123289337	123289668	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER909885	chr11	123289981	123290188	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER929536	chr11	134938042	134938483	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER930932	chr11_KI270826v1_alt	161622	162064	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER941218	chr12	3946682	3947109	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER948158	chr12	7550537	7550716	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER984759	chr12	28168012	28168442	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1010111	chr12	46005788	46006235	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1012323	chr12	47323627	47323694	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1028393	chr12	54879190	54879620	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1028479	chr12	54935535	54935980	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1037909	chr12	60115914	60116343	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1041301	chr12	62249957	62250111	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1061500	chr12	73039330	73039779	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1070375	chr12	78208004	78208432	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1097266	chr12	93857562	93857760	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1106219	chr12	98142048	98142498	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1107480	chr12	98696105	98696557	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1117956	chr12	103956534	103956600	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1124810	chr12	107081847	107081949	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1126624	chr12	107816003	107816442	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1135527	chr12	111240983	111241394	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1160685	chr12	120942640	120942686	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1162016	chr12	121390863	121390935	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1171719	chr12	125144474	125144882	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1184021	chr12	131376958	131377444	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1214855	chr13	30768267	30768320	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1241046	chr13	45375994	45376039	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1246679	chr13	48486854	48487076	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1246681	chr13	48487363	48487580	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1261601	chr13	57128975	57129272	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1261603	chr13	57129639	57129786	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1275178	chr13	65746231	65746676	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1278820	chr13	68208823	68209276	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1282573	chr13	70560171	70560650	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1298401	chr13	80013282	80013702	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1299469	chr13	80616444	80616459	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1299471	chr13	80616570	80616624	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1300583	chr13	81354524	81354940	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1313829	chr13	89838463	89838607	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1342683	chr13	106792442	106792881	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1351860	chr13	113189373	113189461	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1365992	chr14	24798921	24799359	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1371553	chr14	28425138	28425571	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1393992	chr14	41201674	41201721	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1437019	chr14	65564926	65565372	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1438481	chr14	66412057	66412546	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1464937	chr14	78817468	78817912	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1467144	chr14	80132613	80133055	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1480520	chr14	88069587	88070031	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1489716	chr14	92426142	92426385	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1517372	chr14	106500022	106500076	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1525933	chr15	20163984	20164415	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1527658	chr15	21170517	21170948	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1558521	chr15	39320224	39320660	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1558529	chr15	39329558	39329701	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1572182	chr15	45625627	45625715	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1572184	chr15	45626003	45626057	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1587463	chr15	54207164	54207472	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1588799	chr15	55095630	55095666	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1590669	chr15	55964743	55965150	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1613243	chr15	66984056	66984504	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1674220	chr15	97306639	97307056	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1675259	chr15	97957198	97957653	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1701763	chr16	3228800	3228854	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1707634	chr16	5687082	5687154	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1735517	chr16	16828765	16829210	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1741224	chr16	19083105	19083528	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1755322	chr16	24396850	24397103	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1755324	chr16	24397415	24397612	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1760313	chr16	26297818	26298269	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1777383	chr16	33691352	33691783	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1788020	chr16	50150105	50150153	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1790941	chr16	51508742	51508879	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1798521	chr16	55197888	55198350	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1798523	chr16	55199931	55200378	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1799431	chr16	55663182	55663568	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1799914	chr16	55895772	55896003	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1799916	chr16	55896366	55896583	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1828672	chr16	69847708	69847911	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1850627	chr16	80535582	80535634	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1865270	chr16	87313384	87313448	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1866267	chr16	87800125	87800174	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1866269	chr16	87800422	87800779	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1870580	chr16_GL383556v1_alt	119686	119917	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1870582	chr16_GL383556v1_alt	120280	120497	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1872778	chr16_KI270728v1_random	1539531	1539962	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1880080	chr16_KI270853v1_alt	2489674	2490119	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1901517	chr17	8775233	8775617	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1901519	chr17	8775921	8775992	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1924557	chr17	19490128	19490187	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2023777	chr17	68766213	68766733	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2051702	chr17	83235790	83236233	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2077302	chr18	2786981	2787393	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2089695	chr18	9723530	9723967	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2095773	chr18	13145613	13146057	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2098670	chr18	14980842	14981284	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2100812	chr18	21563744	21564157	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2117577	chr18	30743133	30743582	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2129327	chr18	37757944	37758128	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2129329	chr18	37758547	37758811	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2129488	chr18	37864101	37864535	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2138001	chr18	43182218	43182322	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2141127	chr18	45138584	45138723	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2141136	chr18	45142429	45142566	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2149890	chr18	49647790	49647850	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2153728	chr18	51558843	51559216	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2155612	chr18	52685404	52685657	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2175818	chr18	64123688	64124105	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2184107	chr18	69286428	69286859	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2197234	chr18	77728389	77728901	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2203063	chr19	254130	254605	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2217618	chr19	6137084	6137146	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2218085	chr19	6316934	6316966	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2218087	chr19	6317274	6317313	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2235712	chr19	12574041	12574311	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2249517	chr19	17501478	17501516	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2262317	chr19	23499767	23499815	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2264916	chr19	28453764	28454036	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2264918	chr19	28454126	28454327	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2274776	chr19	33610457	33610882	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2297466	chr19	42673886	42674063	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2313142	chr19	48481834	48482248	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2318420	chr19	50355552	50355614	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2325267	chr19	53259951	53259996	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2338053	chr19	58594828	58595271	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2381653	chr2	7417290	7417730	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2424791	chr2	30011903	30012334	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2442976	chr2	39538795	39539239	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2455491	chr2	46257337	46257392	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2485048	chr2	62540868	62541288	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2493715	chr2	67378934	67379308	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2493717	chr2	67379619	67379687	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2494679	chr2	67965241	67965378	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2494788	chr2	68020570	68021013	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2504160	chr2	72856619	72857055	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2518529	chr2	81048104	81048302	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2518531	chr2	81049615	81050037	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2536354	chr2	94192460	94192891	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2569979	chr2	113615945	113616388	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2572470	chr2	114966216	114966652	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2586470	chr2	122670987	122671402	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2593179	chr2	126689425	126689864	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2593188	chr2	126693036	126693475	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2598293	chr2	129279759	129280198	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2605536	chr2	133641915	133642359	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2612852	chr2	137621746	137622187	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2612858	chr2	137626913	137627362	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2615763	chr2	139364148	139364567	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2636073	chr2	152212731	152213161	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2693623	chr2	187223546	187223984	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2699133	chr2	190600394	190600841	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2732506	chr2	209191200	209191454	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2734739	chr2	210659138	210659607	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2735805	chr2	211350795	211351240	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2740148	chr2	214135488	214135867	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2779616	chr2	234770213	234770322	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2788834	chr2	240584104	240584142	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2788836	chr2	240584468	240584856	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2791397	chr2	242172809	242173248	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2824527	chr20	16769151	16769574	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2833420	chr20	21581339	21581763	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2837672	chr20	24425626	24426041	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2837978	chr20	24646299	24646626	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2837980	chr20	24646920	24647036	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2845905	chr20	32119117	32119176	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2864394	chr20	39015990	39016410	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2865517	chr20	39539504	39539955	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2883304	chr20	47140723	47141129	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2897527	chr20	52413461	52413677	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2897529	chr20	52413983	52414204	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2903834	chr20	55164519	55164968	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2904548	chr20	55577775	55578216	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2908148	chr20	57147116	57147550	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2933177	chr21	16973344	16973386	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2933329	chr21	17083604	17084050	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2941614	chr21	22145587	22145889	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2950854	chr21	27500905	27501067	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2951842	chr21	28118502	28118563	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2962555	chr21	33664092	33664575	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2972005	chr21	38726995	38727046	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2975369	chr21	40557124	40557343	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2975371	chr21	40557634	40557840	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2976738	chr21	41366328	41366397	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2980610	chr21	43643297	43643677	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2980612	chr21	43643978	43644031	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2985403	chr21	46686630	46687073	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2985606	chr21_GL383579v2_alt	43114	43416	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2993121	chr22	17596219	17596642	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3001982	chr22	22313558	22313989	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3002486	chr22	22598580	22598790	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3002796	chr22	22799041	22799253	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3003014	chr22	22952006	22952447	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3006617	chr22	24762566	24762989	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3063446	chr22	48999848	49000000	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3063447	chr22	49000008	49000284	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3066408	chr22	50794504	50794947	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3068863	chr22_KI270875v1_alt	234237	234447	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3076438	chr3	1346269	1346731	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3076739	chr3	1545419	1545480	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3091010	chr3	9252415	9252485	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3142116	chr3	36285140	36285580	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3176855	chr3	53991593	53992036	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3180951	chr3	56344989	56345036	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3180956	chr3	56346421	56346500	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3195143	chr3	63534578	63535006	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3202880	chr3	67535605	67535659	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3207778	chr3	70038111	70038549	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3208381	chr3	70388821	70389264	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3218607	chr3	75628845	75629288	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3225581	chr3	80252902	80253024	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3230747	chr3	83576260	83576536	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3230749	chr3	83576606	83576807	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3242875	chr3	94842314	94842348	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3247993	chr3	98432783	98432851	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3276007	chr3	115374989	115375429	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3298586	chr3	127983271	127983474	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3298588	chr3	127983762	127984001	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3326077	chr3	142244190	142244621	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3333145	chr3	146430178	146430268	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3342243	chr3	151748425	151748861	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3351194	chr3	156918855	156919064	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3351195	chr3	156919964	156920207	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3378216	chr3	173198185	173198236	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3385985	chr3	177768071	177768417	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3427565	chr3_GL383526v1_alt	169598	170034	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3432445	chr4	18254	18698	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3433887	chr4	839480	839890	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3452229	chr4	10707394	10707467	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3452511	chr4	10858521	10858967	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3454354	chr4	11791811	11792249	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3461911	chr4	15742154	15742592	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3465289	chr4	17383893	17384106	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3465291	chr4	17384403	17384580	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3476485	chr4	23426038	23426475	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3486176	chr4	28212123	28212210	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3487599	chr4	29061372	29061774	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3490061	chr4	30617094	30617246	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3511264	chr4	41889449	41889896	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3563915	chr4	75831954	75832390	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3566249	chr4	76940449	76940888	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3579607	chr4	84560816	84561169	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3592459	chr4	92189344	92189798	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3600066	chr4	97019911	97020103	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3600067	chr4	97020117	97020190	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3632433	chr4	116982767	116983193	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3637920	chr4	120338887	120339316	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3647375	chr4	126230690	126231135	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3654608	chr4	130561605	130561658	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3691485	chr4	153049680	153049741	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3714467	chr4	166872730	166873172	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3724887	chr4	173312197	173312627	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3727504	chr4	174965075	174965463	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3732792	chr4	178204011	178204086	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3732793	chr4	178204116	178204490	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3735110	chr4	179633921	179634362	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3750926	chr4	188845820	188846229	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3752734	chr4	190113875	190114319	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3752780	chr4	190191604	190192047	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3758094	chr5	16029	16472	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3777402	chr5	13568501	13568936	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3780765	chr5	15624182	15624381	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3780767	chr5	15624900	15625152	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3781182	chr5	15864193	15864303	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3781183	chr5	15864359	15864470	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3792745	chr5	22691976	22692361	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3793870	chr5	23390517	23390593	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3801976	chr5	28416952	28417399	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3804731	chr5	30150305	30150744	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3804733	chr5	30152486	30152753	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3804735	chr5	30152831	30153001	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3807341	chr5	31713467	31714018	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3814879	chr5	35647125	35647660	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3828182	chr5	43219541	43219595	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3877837	chr5	75984961	75985409	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3885394	chr5	80023606	80024058	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3905627	chr5	92472942	92473341	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3905631	chr5	92475007	92475451	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3907999	chr5	94176044	94176460	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3921472	chr5	102887094	102887507	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3958221	chr5	126186529	126186967	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3960637	chr5	127489203	127489262	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3967262	chr5	131608552	131608836	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3967264	chr5	131609088	131609282	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3985274	chr5	140768936	140769357	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4008034	chr5	151844771	151845283	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4008348	chr5	152000641	152001081	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4010396	chr5	153099378	153099807	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4021112	chr5	158017373	158017434	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4032424	chr5	164051237	164051471	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4056592	chr5	175790880	175791330	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4061655	chr5	177968279	177968320	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4061657	chr5	177968633	177969013	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4069009	chr5	181469603	181470042	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4077402	chr5_KI270898v1_alt	102812	102853	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4077404	chr5_KI270898v1_alt	103166	103546	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4105799	chr6	15698567	15698991	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4126617	chr6	26737128	26737176	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4126663	chr6	26764500	26764548	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4132423	chr6	29688475	29688890	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4179492	chr6	53446256	53446305	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4186466	chr6	57806910	57806958	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4190550	chr6	62600882	62601113	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4205652	chr6	72421295	72421732	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4213077	chr6	76784113	76784557	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4221610	chr6	82304601	82304834	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4222872	chr6	83062339	83062550	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4229573	chr6	87378639	87378696	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4229576	chr6	87379042	87379449	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4241851	chr6	94725286	94725726	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4241884	chr6	94751951	94752380	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4244530	chr6	96532398	96532840	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4254226	chr6	102785794	102786227	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4261845	chr6	107136849	107137230	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4261847	chr6	107137540	107137597	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4273629	chr6	113272464	113272525	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4279066	chr6	116593603	116593664	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4279068	chr6	116593959	116594311	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4298120	chr6	128649417	128649832	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4313389	chr6	137369005	137369450	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4323541	chr6	143258888	143258932	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4323542	chr6	143259067	143259277	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4342581	chr6	153879978	153880421	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4359286	chr6	163579125	163579549	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4366277	chr6	168303251	168303686	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4369025	chr6	170599335	170599773	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4369359	chr6	170743158	170743597	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4376062	chr6_GL000251v2_alt	1174979	1175393	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4384605	chr6_GL000252v2_alt	954012	954427	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4392799	chr6_GL000253v2_alt	953577	953992	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4400342	chr6_GL000254v2_alt	953849	954264	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4407709	chr6_GL000255v2_alt	953967	954382	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4416244	chr6_GL000256v2_alt	997506	997921	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4453846	chr7	15760725	15760791	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4453848	chr7	15761112	15761481	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4457919	chr7	18274186	18274619	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4493902	chr7	38715016	38715438	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4502469	chr7	43472937	43473364	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4513460	chr7	49729903	49729959	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4571563	chr7	81672992	81673434	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4598346	chr7	98234454	98234522	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4688062	chr7	147339169	147339590	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4691925	chr7	149247808	149248221	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4696230	chr7	151667982	151668401	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4704647	chr7	156421282	156421722	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4712912	chr8	215768	216169	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4714783	chr8	1815286	1815486	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4714785	chr8	1815800	1815817	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4714787	chr8	1815895	1816160	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4721324	chr8	6303228	6303292	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4740757	chr8	17490638	17491081	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4771700	chr8	33282461	33282890	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4777504	chr8	36498790	36499208	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4787637	chr8	41640070	41640135	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4787639	chr8	41640442	41640508	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4795470	chr8	48756005	48756511	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4798437	chr8	50770616	50771052	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4798439	chr8	50772657	50773105	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4801949	chr8	52897127	52897575	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4818586	chr8	62897597	62898023	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4833390	chr8	71033470	71033923	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4862823	chr8	88823154	88823301	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4864262	chr8	89784723	89785137	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4868139	chr8	92136035	92136478	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4872496	chr8	94587640	94587708	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4875408	chr8	96015723	96015819	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4876542	chr8	96632731	96633164	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4877490	chr8	97193393	97193811	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4907873	chr8	114034069	114034491	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4932033	chr8	126412414	126412860	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4954415	chr8	137143491	137143870	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4958121	chr8	139166165	139166229	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4987878	chr9	7075307	7075730	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4993305	chr9	10532901	10533322	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4994300	chr9	11160684	11161078	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4995849	chr9	12202981	12203424	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4997183	chr9	13011885	13012330	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5011449	chr9	21360253	21360362	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5011451	chr9	21360859	21360876	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5011572	chr9	21451400	21451520	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5042802	chr9	38803051	38803279	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5042803	chr9	38803272	38803384	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045790	chr9	40568265	40568696	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5052114	chr9	62027470	62027698	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5052115	chr9	62027691	62027803	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5053556	chr9	63062383	63062814	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5053902	chr9	63369176	63369607	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055537	chr9	64702139	64702570	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5056016	chr9	65186404	65186835	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5057001	chr9	65834862	65835293	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5059626	chr9	67560908	67561020	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5059627	chr9	67561013	67561241	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5063113	chr9	69661584	69662014	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5079735	chr9	78536095	78536124	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5079737	chr9	78536349	78536388	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5084521	chr9	81438548	81439015	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5088253	chr9	83570961	83571417	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5093034	chr9	85956754	85957031	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5093036	chr9	85957457	85957634	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5102293	chr9	91031250	91031314	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5103050	chr9	91448198	91448630	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5105477	chr9	92704582	92705018	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5112009	chr9	96193119	96193539	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5113463	chr9	96833970	96834106	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5113465	chr9	96834466	96834756	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5113469	chr9	96836651	96837080	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5119559	chr9	99566911	99567333	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5142165	chr9	111257146	111257182	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5199241	chr9	137735606	137735979	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5205898	chrUn_KI270745v1	35757	36194	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5216682	chrX	4096428	4096623	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5216684	chrX	4096944	4096960	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5216686	chrX	4096993	4097298	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5226549	chrX	9426294	9426736	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5239134	chrX	16196283	16196721	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5248545	chrX	20686009	20686061	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5248547	chrX	20686372	20686580	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5261866	chrX	27905151	27905387	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5261867	chrX	27905474	27905666	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5262376	chrX	28218477	28218931	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5273920	chrX	35053279	35053346	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5273922	chrX	35053655	35053725	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5273924	chrX	35053956	35054200	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5309155	chrX	52910112	52910506	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5309157	chrX	52910816	52910883	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5309218	chrX	52944931	52944998	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5309220	chrX	52945308	52945702	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5319121	chrX	63396684	63397178	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5319134	chrX	63402513	63402950	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5327306	chrX	68492554	68492943	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5335996	chrX	72506240	72506686	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5346369	chrX	79799040	79799093	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5352293	chrX	84043116	84043176	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5357357	chrX	87694601	87695037	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5364666	chrX	92683365	92683482	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5366073	chrX	93589967	93590364	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5366355	chrX	93763260	93763673	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5372704	chrX	97663684	97663753	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5385738	chrX	105368014	105368447	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5387046	chrX	106224668	106224970	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5387048	chrX	106225042	106225274	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5387884	chrX	106745450	106745515	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5388343	chrX	107018539	107018727	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5388345	chrX	107018877	107019011	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5388347	chrX	107019407	107019485	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5392777	chrX	109573588	109573832	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5392781	chrX	109575631	109576042	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5459367	chrX	146530566	146531028	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5467372	chrX	151049479	151050013	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5488527	chrY	5800145	5800262	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5501772	chrY	14747820	14747883	0	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5556002	chr19_KV575253v1_alt	164366	164417	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5556811	chr19_KV575256v1_alt	221975	222026	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5576827	chr4_KQ983257v1_fix	217483	217926	1	LTR
MSTA1|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5581447	chr6_KQ090016v1_fix	174416	174649	1	LTR