MamRep1527|LTR|LTR-HOMER52 chr1 42370 42504 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER7198 chr1 4927865 4928363 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER27235 chr1 14284914 14285047 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER27237 chr1 14285293 14285618 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER78455 chr1 34330771 34330931 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER78456 chr1 34330962 34331258 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER84334 chr1 36725575 36725788 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER84342 chr1 36727142 36727616 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER99373 chr1 43144186 43144373 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112205 chr1 48940755 48940868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER112208 chr1 48942058 48942186 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER115290 chr1 50496166 50496298 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER115317 chr1 50505065 50505282 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER116794 chr1 51169906 51170069 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER129142 chr1 56197865 56198057 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER129144 chr1 56198216 56198467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER130838 chr1 56939034 56939809 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131044 chr1 57042796 57042827 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131046 chr1 57042878 57043231 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER131050 chr1 57044362 57044859 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER138496 chr1 60422280 60422483 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER145538 chr1 63712859 63713757 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER161384 chr1 72139923 72140207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER163798 chr1 73736308 73736423 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER166167 chr1 75232262 75232408 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER178261 chr1 82371530 82371846 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER178769 chr1 82669162 82669604 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER184938 chr1 86198937 86199335 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189610 chr1 88909268 88909361 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189612 chr1 88909789 88909838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER189791 chr1 89001490 89001697 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER203206 chr1 96217473 96217861 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER210809 chr1 100523209 100523319 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER210810 chr1 100523335 100523790 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER219832 chr1 106235110 106235167 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER221484 chr1 107247503 107248031 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER221487 chr1 107248337 107248487 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER223517 chr1 108531512 108532113 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER223518 chr1 108532183 108532348 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244077 chr1 119297502 119297673 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244079 chr1 119297995 119298341 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER244081 chr1 119298500 119298866 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245865 chr1 120375506 120375650 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245871 chr1 120376307 120376533 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER245872 chr1 120376558 120376682 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247240 chr1 121135777 121136038 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247242 chr1 121136319 121136515 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER247244 chr1 121136828 121136878 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER249527 chr1 143923718 143924456 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER249529 chr1 143924768 143924818 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250648 chr1 144502316 144502418 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250649 chr1 144502465 144502691 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER250655 chr1 144503348 144503492 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252951 chr1 145753510 145753719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252953 chr1 145754008 145754149 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252968 chr1 145758568 145758810 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER252969 chr1 145758965 145759043 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254323 chr1 146430708 146430845 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254328 chr1 146431520 146431746 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER254329 chr1 146431771 146431898 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER255764 chr1 147239649 147239719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259224 chr1 149141245 149141372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259225 chr1 149141397 149141619 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER259231 chr1 149142288 149142432 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER261251 chr1 150180533 150180643 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER281920 chr1 160430077 160430872 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER286209 chr1 162536564 162536985 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER286211 chr1 162537279 162537362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287687 chr1 163318962 163319148 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER287688 chr1 163319197 163319304 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER292488 chr1 165990593 165990698 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER292679 chr1 166110528 166110662 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293369 chr1 166511604 166511747 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293371 chr1 166511958 166512110 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER293373 chr1 166512321 166512702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER296260 chr1 168077053 168077160 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER296261 chr1 168077231 168077719 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER301158 chr1 170882285 170882863 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER304206 chr1 172583233 172583359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER304837 chr1 172953893 172954493 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER312937 chr1 177422066 177422130 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328919 chr1 185897792 185897898 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328920 chr1 185898416 185898973 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER328925 chr1 185899593 185899770 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER329125 chr1 186041830 186042635 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331024 chr1 187202547 187202715 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331505 chr1 187487919 187488154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER331506 chr1 187488223 187488353 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364574 chr1 206154614 206154875 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364576 chr1 206155156 206155352 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER364578 chr1 206155662 206155715 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER378544 chr1 213473040 213473384 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER378545 chr1 213473563 213473644 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER383827 chr1 216777748 216777806 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER383829 chr1 216778501 216778770 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER390350 chr1 220509460 220509528 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER396708 chr1 224042898 224043017 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER396715 chr1 224046227 224046335 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER403950 chr1 227472190 227472350 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER422469 chr1 237235017 237235211 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER422470 chr1 237235280 237235912 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER423575 chr1 237896417 237896858 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER432840 chr1 242878364 242878501 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER432841 chr1 242878636 242878922 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER448088 chr10 2874248 2874448 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER458984 chr10 9052027 9052144 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER470781 chr10 15180757 15180842 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER472366 chr10 16031691 16032061 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477770 chr10 18834864 18835217 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477771 chr10 18835243 18835341 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477777 chr10 18836618 18836662 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER477779 chr10 18836966 18837182 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER478257 chr10 19110732 19111173 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490801 chr10 25726078 25726345 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490809 chr10 25728924 25728965 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER490811 chr10 25729193 25729256 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER497532 chr10 29052269 29052356 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER498227 chr10 29397402 29397615 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER500827 chr10 30578960 30579090 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER500829 chr10 30579255 30579758 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER504338 chr10 32393911 32394056 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER504339 chr10 32394051 32394260 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER510060 chr10 35542636 35542953 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER510065 chr10 35544886 35545030 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER523725 chr10 46554369 46554805 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER524763 chr10 47101324 47101394 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER524764 chr10 47101523 47101632 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER527520 chr10 48749849 48750086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER528327 chr10 49275895 49276295 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER539666 chr10 56305991 56306356 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER539668 chr10 56306786 56307074 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541280 chr10 57311914 57312107 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541490 chr10 57462698 57462923 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER541492 chr10 57463721 57463808 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER547804 chr10 61147111 61147935 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER553827 chr10 64336510 64337253 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER558012 chr10 66833827 66834175 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER558922 chr10 67431580 67431791 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER584628 chr10 79322948 79323157 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER587233 chr10 80654064 80654253 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER589256 chr10 81884240 81884397 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER589259 chr10 81885079 81885647 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591704 chr10 83346293 83346678 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER591741 chr10 83364801 83365078 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER592862 chr10 84010493 84010710 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER593175 chr10 84165078 84165216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER593176 chr10 84165662 84165867 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER594783 chr10 85106811 85107706 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER595087 chr10 85305165 85305635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER595837 chr10 85777147 85777203 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601870 chr10 88971513 88971626 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601871 chr10 88971776 88971912 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER601873 chr10 88972207 88972396 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER602546 chr10 89342289 89342503 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER602547 chr10 89342565 89342870 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER617346 chr10 96722626 96722714 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER617347 chr10 96722894 96723184 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631425 chr10 103204701 103204825 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631427 chr10 103205033 103205440 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631436 chr10 103213665 103213901 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER631438 chr10 103214380 103214399 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER636618 chr10 105858106 105858434 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER637113 chr10 106159211 106159568 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER637115 chr10 106159676 106159894 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER638527 chr10 106938240 106938933 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER646189 chr10 111363145 111363290 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER654256 chr10 115776811 115776874 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER659379 chr10 118603538 118603672 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER664775 chr10 121267253 121267379 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER664777 chr10 121267766 121267848 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER668737 chr10 123442899 123443295 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER675567 chr10 127438186 127438290 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER692463 chr11 4578781 4578832 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER692464 chr11 4579020 4579170 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER693886 chr11 5557634 5557891 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698621 chr11 8416635 8417249 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER698622 chr11 8417341 8417398 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER706848 chr11 12461333 12462165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713147 chr11 15784391 15785265 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713468 chr11 15944278 15944352 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713470 chr11 15944585 15944823 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER713472 chr11 15945451 15945713 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER723610 chr11 21150221 21150462 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER723613 chr11 21151226 21151413 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725108 chr11 21990015 21990210 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725110 chr11 21990626 21990938 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725113 chr11 21992467 21992529 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725450 chr11 22187658 22188066 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725452 chr11 22188712 22188804 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER725936 chr11 22460929 22461359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER726174 chr11 22585053 22585254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER736123 chr11 28499256 28500000 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER736124 chr11 28500048 28500108 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER737743 chr11 29396266 29396747 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738269 chr11 29688258 29688795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738271 chr11 29688865 29688932 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER738273 chr11 29689212 29689362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751697 chr11 36714672 36715160 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751699 chr11 36715465 36715565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751701 chr11 36715756 36715820 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER751850 chr11 36783103 36783157 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER758549 chr11 40830317 40830547 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER758550 chr11 40831225 40831355 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER760449 chr11 41878831 41879026 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER775847 chr11 49510867 49511019 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER780087 chr11 56813848 56814007 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784316 chr11 58902615 58902743 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784317 chr11 58903095 58903263 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784430 chr11 58965284 58965420 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784431 chr11 58965685 58966008 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784563 chr11 59060139 59060299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784564 chr11 59060599 59060919 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784632 chr11 59103927 59104086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784633 chr11 59104373 59104701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784682 chr11 59134194 59134275 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784684 chr11 59135189 59135556 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER784954 chr11 59308562 59308820 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER809759 chr11 70696444 70696527 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER810685 chr11 71287236 71287446 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER811019 chr11 71457130 71457408 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER817511 chr11 74272142 74272210 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER817513 chr11 74272243 74272969 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824533 chr11 77305107 77305238 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824535 chr11 77305601 77305882 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER824537 chr11 77306247 77306449 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER835783 chr11 82639328 82639624 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER835786 chr11 82640481 82640827 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER845870 chr11 87891115 87891480 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER847984 chr11 89113611 89114007 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER860848 chr11 96664544 96664646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER860849 chr11 96664737 96664795 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER861875 chr11 97402391 97402569 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER866886 chr11 100588553 100588765 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870286 chr11 102494847 102495401 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870287 chr11 102495447 102495545 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870691 chr11 102700697 102700777 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870693 chr11 102701543 102702010 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870694 chr11 102702126 102702272 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER870988 chr11 102885390 102885881 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER871870 chr11 103366235 103366278 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER873438 chr11 104313904 104314059 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER873439 chr11 104314098 104314365 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER884380 chr11 110325937 110326068 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER916369 chr11 126882440 126883112 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER917421 chr11 127523521 127524274 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925023 chr11 131952649 131953342 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925169 chr11 132043219 132043359 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER925170 chr11 132043530 132043978 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER926542 chr11 133001237 133002172 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER926571 chr11 133017753 133018254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927369 chr11 133557532 133557743 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER927371 chr11 133558110 133558344 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER930490 chr11_JH159137v1_alt 131690 131849 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER940675 chr12 3660892 3661604 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER948600 chr12 7727249 7727319 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER948602 chr12 7727637 7727766 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951336 chr12 8903962 8904071 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951338 chr12 8904487 8904647 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER951362 chr12 8910224 8910426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER954161 chr12 10576651 10576755 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER958267 chr12 12791977 12792438 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER959138 chr12 13191118 13191183 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER967662 chr12 18306280 18306449 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER989731 chr12 31213305 31213368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER989733 chr12 31213670 31213911 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1011219 chr12 46701250 46701480 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1011220 chr12 46701543 46702013 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039908 chr12 61425871 61426012 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039910 chr12 61426192 61426373 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1039929 chr12 61439258 61439931 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1041971 chr12 62618977 62619242 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1043616 chr12 63556951 63557187 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1043943 chr12 63751581 63751817 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1063015 chr12 74026876 74027069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1063200 chr12 74160341 74160564 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1064952 chr12 75260025 75260574 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1068609 chr12 77070398 77070785 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1074821 chr12 80873953 80874044 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1076439 chr12 81872651 81872832 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1076440 chr12 81872913 81873238 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1078548 chr12 83156830 83157133 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1081761 chr12 85226194 85226376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1081766 chr12 85228528 85228725 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1089796 chr12 90050630 90050791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1090837 chr12 90642164 90642599 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1090838 chr12 90642706 90642838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1094850 chr12 92869377 92869461 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1094852 chr12 92869783 92869885 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1116749 chr12 103357390 103357708 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1117790 chr12 103880196 103880329 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1121545 chr12 105575937 105576002 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1154906 chr12 118742899 118743282 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1177996 chr12 128303133 128303341 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1177997 chr12 128303360 128303653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180318 chr12 129370518 129370591 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180326 chr12 129373036 129373172 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1180997 chr12 129697898 129697936 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1186362 chr12 132853071 132853195 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1190037 chr12_KI270835v1_alt 104023 104162 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1190039 chr12_KI270835v1_alt 104464 104705 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1197905 chr13 21474689 21474855 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1197907 chr13 21475152 21475548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1213833 chr13 30324987 30325069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1213837 chr13 30327137 30327682 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1225477 chr13 36837011 36837096 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1225478 chr13 36837464 36837561 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1243680 chr13 46800748 46801078 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1250793 chr13 50562456 50562776 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257052 chr13 54158519 54158838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257326 chr13 54361635 54361885 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1257662 chr13 54567577 54567713 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1262542 chr13 57764278 57764466 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266007 chr13 59966789 59966830 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266008 chr13 59966921 59967054 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1266010 chr13 59967375 59967431 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1267478 chr13 60788960 60789555 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1267480 chr13 60789691 60789860 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1291619 chr13 75878819 75878934 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1291621 chr13 75879253 75879314 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301006 chr13 81633874 81633964 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301008 chr13 81634408 81634577 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301009 chr13 81634666 81634847 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1301428 chr13 81921402 81921549 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311003 chr13 88117439 88117863 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1311005 chr13 88118177 88118338 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1313965 chr13 89915703 89915830 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1314735 chr13 90416944 90417075 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315436 chr13 90858904 90859506 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315924 chr13 91170290 91170441 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1315926 chr13 91170552 91170952 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1324124 chr13 95892958 95893053 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1334476 chr13 101505696 101506023 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1337285 chr13 103245123 103245486 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1337823 chr13 103580042 103580199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1340193 chr13 105178231 105178440 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341403 chr13 105962298 105962411 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341428 chr13 105982990 105983068 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341430 chr13 105983201 105983272 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1341964 chr13 106316375 106316674 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1342053 chr13 106374266 106374388 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1358068 chr14 20483480 20483530 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1361761 chr14 22442546 22442702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1361762 chr14 22442759 22443077 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367211 chr14 25562305 25562600 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367213 chr14 25563045 25563248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1367715 chr14 25904311 25904520 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1375370 chr14 30852145 30852217 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1375372 chr14 30852515 30852753 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1377369 chr14 31734760 31734964 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1377618 chr14 31883580 31884365 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380637 chr14 33911239 33911278 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380639 chr14 33911731 33912440 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380643 chr14 33913633 33913723 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380783 chr14 33987486 33987573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380784 chr14 33987597 33987622 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380786 chr14 33987831 33988042 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1380788 chr14 33988202 33988401 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1389838 chr14 38665876 38666350 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1389839 chr14 38666430 38666561 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1391704 chr14 39682836 39683193 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1391705 chr14 39683234 39683669 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1393537 chr14 40913645 40913748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1402060 chr14 46411792 46412112 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1403218 chr14 47168088 47168189 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1429022 chr14 61582516 61582877 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1445970 chr14 70213795 70213942 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446124 chr14 70288277 70288374 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446871 chr14 70687271 70687729 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446872 chr14 70687782 70687882 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1446878 chr14 70689117 70689254 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469091 chr14 81291903 81292165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469092 chr14 81292179 81292364 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1469094 chr14 81292756 81292883 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1476885 chr14 85900613 85901086 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480511 chr14 88066421 88066569 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480512 chr14 88066762 88067005 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1480622 chr14 88129104 88129199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1493910 chr14 94400349 94400866 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1493914 chr14 94401593 94401695 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1538815 chr15 27842984 27843593 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558185 chr15 39090817 39090869 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558187 chr15 39091165 39091283 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1558441 chr15 39259877 39260059 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1586935 chr15 53868263 53868710 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1602044 chr15 61937916 61938597 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623204 chr15 71741779 71741898 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623206 chr15 71742554 71742772 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1623208 chr15 71743071 71743434 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1638893 chr15 79123170 79123338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1639461 chr15 79376838 79377268 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1641494 chr15 80359542 80359843 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1643732 chr15 81473093 81473364 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1643733 chr15 81473397 81473538 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664215 chr15 91599042 91599150 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664492 chr15 91732484 91733125 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664494 chr15 91733172 91733216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1664670 chr15 91815739 91815898 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1665493 chr15 92289024 92289676 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668519 chr15 93820839 93820996 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668713 chr15 93914716 93915395 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1668797 chr15 93965463 93965906 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1670669 chr15 95106759 95106886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1671480 chr15 95570673 95570748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1672943 chr15 96492571 96492679 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1674720 chr15 97648493 97648616 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1675360 chr15 98024252 98024646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1675361 chr15 98024668 98024787 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1678448 chr15 99770947 99771037 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1681971 chr15 101948459 101948593 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706982 chr16 5414256 5414456 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706983 chr16 5414611 5414737 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1706988 chr16 5415821 5415948 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1707356 chr16 5564940 5565083 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712528 chr16 7996829 7997315 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712529 chr16 7997402 7997598 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712810 chr16 8122867 8123470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1712846 chr16 8135855 8136226 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726283 chr16 13348951 13349115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726284 chr16 13349317 13349589 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726286 chr16 13349782 13349942 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726997 chr16 13629779 13630001 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1726999 chr16 13630274 13630595 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1727000 chr16 13630688 13630913 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1735357 chr16 16758396 16758639 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1739832 chr16 18600597 18600840 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1748333 chr16 21794564 21795094 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1750399 chr16 22611000 22611531 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1753042 chr16 23598980 23599165 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1753939 chr16 23899087 23899571 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1758384 chr16 25475867 25476067 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1758406 chr16 25481965 25482147 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759711 chr16 26024963 26025233 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759713 chr16 26025314 26025733 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759716 chr16 26026216 26026300 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1759718 chr16 26026862 26026958 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1782319 chr16 47408415 47408584 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783345 chr16 48006321 48006455 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783347 chr16 48006883 48007301 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1783349 chr16 48007375 48007675 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1784443 chr16 48486443 48486551 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1785488 chr16 48963286 48964080 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1790803 chr16 51433687 51433857 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1799779 chr16 55836200 55836502 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1807397 chr16 59197226 59197888 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1807699 chr16 59356726 59356850 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1808153 chr16 59629697 59629918 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1808154 chr16 59630011 59630218 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1811114 chr16 61321015 61321195 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1811120 chr16 61325289 61325396 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1816434 chr16 64320947 64321491 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1832272 chr16 71473939 71474290 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1843414 chr16 76944416 76944681 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1857306 chr16 83557626 83558234 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1857950 chr16 83877728 83877980 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1860345 chr16 84917702 84918058 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1870447 chr16_GL383556v1_alt 60109 60407 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1879920 chr16_KI270853v1_alt 2419332 2419575 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891953 chr17 4654643 4654855 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891970 chr17 4660446 4660565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1891972 chr17 4660607 4660823 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895090 chr17 5944691 5945563 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895572 chr17 6163132 6163389 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1895609 chr17 6178712 6179160 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1897209 chr17 6903676 6903862 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908121 chr17 11758176 11758666 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1908123 chr17 11758969 11759096 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1914083 chr17 14746011 14746257 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1916906 chr17 16129711 16130010 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1916907 chr17 16130253 16130359 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1946697 chr17 33819857 33820000 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1947767 chr17 34399478 34399702 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1947804 chr17 34416703 34416944 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951282 chr17 36024557 36024622 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951284 chr17 36025071 36025169 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951540 chr17 36160819 36160896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951698 chr17 36248777 36248856 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951873 chr17 36338001 36338089 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1951962 chr17 36372669 36372748 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1952085 chr17 36423750 36423829 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955456 chr17 37938613 37938701 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955545 chr17 37973293 37973372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955607 chr17 38018150 38018238 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955695 chr17 38052831 38052910 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955878 chr17 38142110 38142198 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1955968 chr17 38176797 38176876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1960028 chr17 39803050 39803118 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987431 chr17 51712807 51712901 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987432 chr17 51713477 51713606 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1987597 chr17 51789693 51790449 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989228 chr17 52706455 52706604 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989851 chr17 53070293 53070380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1989853 chr17 53070431 53070822 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1991286 chr17 53941019 53941201 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1991660 chr17 54180538 54181284 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995230 chr17 56071415 56071614 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995232 chr17 56071644 56071685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1995233 chr17 56071746 56072055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER1996754 chr17 56810853 56811062 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004315 chr17 60004599 60004748 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004316 chr17 60004791 60004870 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004483 chr17 60095964 60096442 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2004484 chr17 60096488 60096567 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2009446 chr17 62259844 62259923 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2019294 chr17 66893238 66893519 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059593 chr17_KI270857v1_alt 259122 259187 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059595 chr17_KI270857v1_alt 259636 259734 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059610 chr17_KI270857v1_alt 265710 265909 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2059855 chr17_KI270857v1_alt 395718 395797 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060014 chr17_KI270857v1_alt 483681 483760 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060197 chr17_KI270857v1_alt 572905 572993 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060286 chr17_KI270857v1_alt 607573 607652 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2060407 chr17_KI270857v1_alt 658654 658733 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2063800 chr17_KI270857v1_alt 2177222 2177310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2063889 chr17_KI270857v1_alt 2211914 2211993 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071481 chr17_KI270909v1_alt 114915 114992 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071643 chr17_KI270909v1_alt 202958 203037 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2071839 chr17_KI270909v1_alt 304520 304599 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2074742 chr18 1324446 1324543 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2094148 chr18 12396286 12396467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2094149 chr18 12396574 12396782 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2116684 chr18 30204558 30204874 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2117913 chr18 30975995 30976061 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2117916 chr18 30977040 30977195 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121882 chr18 33186114 33186222 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121884 chr18 33186352 33186632 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2121895 chr18 33190369 33190451 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2131599 chr18 39202343 39202617 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2132652 chr18 39873102 39873317 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134214 chr18 40870184 40870222 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134220 chr18 40871810 40872017 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134947 chr18 41326344 41326499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2134948 chr18 41326526 41326820 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136017 chr18 41984625 41984771 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136019 chr18 41985328 41985391 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2136799 chr18 42446329 42446569 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2138320 chr18 43388270 43388944 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2153995 chr18 51721928 51722537 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2153996 chr18 51722640 51722792 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2154743 chr18 52166785 52167227 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2154745 chr18 52167615 52167844 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2167076 chr18 59240540 59241012 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2170138 chr18 60987095 60987870 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175087 chr18 63645371 63645450 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175112 chr18 63662373 63662502 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2175114 chr18 63663008 63663087 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187005 chr18 71021317 71021564 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187369 chr18 71261318 71261393 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2187371 chr18 71261569 71261960 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190256 chr18 73058393 73058638 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190257 chr18 73059285 73059470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190258 chr18 73059491 73059672 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2190647 chr18 73286523 73286928 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2194390 chr18 75846615 75846840 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2194394 chr18 75853519 75853648 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2201391 chr18_GL383570v1_alt 98851 99003 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2201392 chr18_GL383570v1_alt 99106 99715 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2202753 chr19 83981 84115 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2205683 chr19 1542670 1542796 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264109 chr19 27971451 27971635 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264632 chr19 28305330 28305476 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264633 chr19 28305621 28305741 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2264636 chr19 28306658 28306739 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2275076 chr19 33769774 33769869 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2275077 chr19 33770343 33770432 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2321221 chr19 51460956 51461055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2339300 chr19_GL383574v1_alt 98388 98487 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369764 chr1_KI270765v1_alt 13611 13713 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369765 chr1_KI270765v1_alt 13760 13986 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2369771 chr1_KI270765v1_alt 14643 14787 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2371395 chr2 449493 449624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378769 chr2 5644856 5645002 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378774 chr2 5645655 5645880 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2378775 chr2 5645908 5646029 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393233 chr2 13443993 13444158 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393796 chr2 13787852 13788077 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2393797 chr2 13788152 13788279 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2399740 chr2 16944685 16945252 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400031 chr2 17106932 17107012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400032 chr2 17107181 17107280 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2400119 chr2 17157771 17158159 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401536 chr2 17968720 17968899 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401538 chr2 17969246 17969428 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401539 chr2 17969768 17969997 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401845 chr2 18154060 18154160 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401849 chr2 18155337 18155631 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401875 chr2 18171706 18172195 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2401912 chr2 18193794 18194361 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405696 chr2 20420398 20420453 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405698 chr2 20420913 20420951 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2405700 chr2 20421363 20421587 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2407244 chr2 21354827 21355508 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2407588 chr2 21556171 21556249 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2408238 chr2 21994162 21994335 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2410220 chr2 23191758 23191815 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2424748 chr2 29990904 29991065 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2431666 chr2 33447304 33447399 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2432823 chr2 34005746 34005845 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2433382 chr2 34299431 34299806 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2434089 chr2 34713371 34713929 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442116 chr2 39153428 39153642 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442117 chr2 39153674 39153952 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442120 chr2 39154268 39154375 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2442123 chr2 39155268 39155337 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2443815 chr2 40063463 40063811 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2443817 chr2 40063852 40063868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2444631 chr2 40613961 40614043 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2444636 chr2 40616115 40616317 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2446546 chr2 41784622 41784893 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461241 chr2 48934957 48935152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461243 chr2 48935459 48935469 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2461245 chr2 48935768 48936248 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2462832 chr2 49907096 49907199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2464626 chr2 51131508 51131981 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2466862 chr2 52613750 52613896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2466864 chr2 52614302 52614780 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2468101 chr2 53381153 53381631 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2468782 chr2 53755316 53755503 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469579 chr2 54084629 54084819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469584 chr2 54085896 54085943 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2469586 chr2 54086244 54086743 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2470796 chr2 54750009 54750074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2470799 chr2 54751061 54751246 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2472837 chr2 55744896 55744952 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2473868 chr2 56427797 56427891 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2491802 chr2 66051976 66052380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2491823 chr2 66059511 66059691 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2495149 chr2 68207455 68207874 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2495151 chr2 68208161 68208235 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2508264 chr2 74821608 74822207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2508268 chr2 74823047 74823204 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2515659 chr2 79277031 79277198 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2516477 chr2 79778991 79779088 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2518247 chr2 80858743 80859445 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519227 chr2 81504413 81504627 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519686 chr2 81824285 81824459 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2519687 chr2 81824541 81824712 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2523694 chr2 84300653 84301170 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2523696 chr2 84301557 84301712 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2570427 chr2 113821994 113822254 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2571476 chr2 114384926 114385056 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2571477 chr2 114385198 114385399 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2586811 chr2 122868578 122869215 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2587253 chr2 123145913 123146096 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2587254 chr2 123146146 123146322 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588906 chr2 124171008 124171152 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2588907 chr2 124171605 124171726 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2591373 chr2 125576314 125576395 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2592600 chr2 126346176 126346378 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2592601 chr2 126346528 126346615 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2598601 chr2 129480670 129480874 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2603724 chr2 132482171 132482243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2604402 chr2 132911700 132911932 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612682 chr2 137504423 137504629 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2612683 chr2 137504756 137504807 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2614413 chr2 138559829 138559944 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2616209 chr2 139657179 139657549 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2616212 chr2 139658273 139658509 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2633380 chr2 150713130 150713649 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2633381 chr2 150713699 150714047 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643393 chr2 156904150 156904610 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643395 chr2 156904659 156905130 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643799 chr2 157179460 157179829 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643801 chr2 157180146 157180402 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2643806 chr2 157181424 157181615 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2671342 chr2 173310835 173310896 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2671344 chr2 173310922 173310973 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2678534 chr2 177409033 177409154 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2678541 chr2 177413257 177413799 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2687683 chr2 183372620 183373154 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2688372 chr2 183876043 183876123 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2692332 chr2 186443742 186444207 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2694342 chr2 187713053 187713193 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2694343 chr2 187713227 187713647 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2704110 chr2 193693665 193694135 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2704112 chr2 193694513 193694708 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2708578 chr2 196489595 196489799 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2711261 chr2 197902053 197902714 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2729942 chr2 207742916 207743152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2730846 chr2 208133656 208133789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2730849 chr2 208134375 208134596 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2733879 chr2 210083449 210083572 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2737154 chr2 212220987 212221210 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2751998 chr2 220275023 220275110 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2751999 chr2 220275130 220275260 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752001 chr2 220275367 220275480 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752002 chr2 220275537 220275736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2752188 chr2 220374161 220374673 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2754655 chr2 221785989 221786766 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2754914 chr2 221922521 221923002 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2757956 chr2 223563336 223563476 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2766146 chr2 227973176 227973480 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2777774 chr2 233789106 233789255 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778285 chr2 234110643 234111116 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2778781 chr2 234347550 234347671 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2782224 chr2 236266280 236266573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2788380 chr2 240231689 240231836 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797203 chr20 2439607 2439788 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797205 chr20 2440326 2440475 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2797207 chr20 2440652 2440699 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2799886 chr20 3541999 3542179 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2801111 chr20 4091111 4091394 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2805901 chr20 6193157 6193301 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2816120 chr20 11968523 11968620 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2816126 chr20 11969670 11970129 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2817606 chr20 12871940 12872054 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2822883 chr20 15850502 15851093 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2824515 chr20 16758503 16758859 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2824516 chr20 16758966 16759068 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837204 chr20 24122948 24123178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837205 chr20 24123272 24123415 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2837683 chr20 24430342 24430438 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2838602 chr20 25088074 25088260 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864785 chr20 39193072 39193304 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864791 chr20 39194976 39195051 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2864792 chr20 39195275 39195442 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2865565 chr20 39564209 39564549 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2867206 chr20 40426134 40426608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868453 chr20 40985960 40986340 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868456 chr20 40986869 40987090 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2868458 chr20 40987386 40987676 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870846 chr20 42172832 42172979 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870848 chr20 42173099 42173279 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2870874 chr20 42185359 42185494 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2871070 chr20 42279751 42280000 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2897360 chr20 52351239 52351393 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2897376 chr20 52356778 52357250 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2901803 chr20 54185484 54185770 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2906504 chr20 56541672 56541782 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2931317 chr21 15708240 15708322 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2931322 chr21 15710004 15710112 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2937291 chr21 19481906 19482104 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2939253 chr21 20668791 20668845 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2939256 chr21 20669367 20669467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2950738 chr21 27426726 27426803 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956816 chr21 30957929 30958081 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2956818 chr21 30958314 30958507 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2966373 chr21 35817842 35818648 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER2973669 chr21 39553239 39553613 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3003707 chr22 23356705 23356854 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3003708 chr22 23357045 23357282 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3010101 chr22 26105449 26105626 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3027727 chr22 33290192 33290293 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029876 chr22 34166164 34166372 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029882 chr22 34168363 34168890 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3029941 chr22 34189586 34189838 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3031497 chr22 34920955 34921021 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3041486 chr22 38886938 38887038 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3064419 chr22 49709677 49709732 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3066788 chr22_GL383583v2_alt 2645 2745 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3069727 chr22_KI270878v1_alt 2663 2812 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3069728 chr22_KI270878v1_alt 3003 3240 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3074806 chr3 374389 374776 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3076058 chr3 1141901 1142471 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3078749 chr3 2731684 2731819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3078751 chr3 2732412 2732571 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3086644 chr3 6976694 6977309 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3088704 chr3 8133282 8133442 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3106629 chr3 16166602 16166697 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3114503 chr3 20856844 20857011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3114992 chr3 21162642 21162877 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3122999 chr3 25819635 25819864 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3123001 chr3 25820203 25820506 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3138960 chr3 34247876 34248143 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3153226 chr3 42231354 42231753 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3157751 chr3 44678951 44679429 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3157755 chr3 44682813 44683070 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3158697 chr3 45133937 45134039 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3160985 chr3 46294914 46295126 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3186759 chr3 58966149 58966261 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3193781 chr3 62867385 62867542 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3193783 chr3 62868045 62868203 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194272 chr3 63101410 63101540 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194441 chr3 63179431 63179573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3194443 chr3 63180114 63180573 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3202668 chr3 67410081 67410570 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3216098 chr3 74190711 74191080 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3216627 chr3 74513264 74513917 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217373 chr3 74944641 74944662 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217375 chr3 74945014 74945127 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3217376 chr3 74945331 74945705 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3220071 chr3 76586705 76587086 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3220859 chr3 77106681 77106774 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3222718 chr3 78372232 78372426 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3222720 chr3 78372533 78372684 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3235650 chr3 86855417 86855499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3235651 chr3 86855640 86855855 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3239742 chr3 89596080 89596557 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245612 chr3 96726487 96726583 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245613 chr3 96726614 96726974 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3245731 chr3 96828525 96828996 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3250872 chr3 100218667 100218731 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3250874 chr3 100219012 100219307 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3256114 chr3 103314269 103314703 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3258955 chr3 105146795 105147320 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261475 chr3 106781580 106781724 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261477 chr3 106782321 106782343 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261479 chr3 106782420 106782526 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3261482 chr3 106782866 106783011 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3264787 chr3 108740258 108740907 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3271625 chr3 112818325 112818887 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298566 chr3 127975427 127975682 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298567 chr3 127975738 127975886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3298571 chr3 127978182 127978261 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3316667 chr3 137321298 137321516 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344202 chr3 152939152 152939479 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344206 chr3 152940354 152940469 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3344208 chr3 152940928 152941131 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3347375 chr3 154712131 154712196 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357177 chr3 160456272 160456582 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357191 chr3 160462794 160462889 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3357195 chr3 160464406 160464548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3359477 chr3 161706504 161706571 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360265 chr3 162243263 162243310 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360272 chr3 162248605 162248636 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3360274 chr3 162248927 162249245 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3382012 chr3 175515033 175515428 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3382014 chr3 175516042 175516443 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3386705 chr3 178216524 178217028 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3409301 chr3 189387756 189387868 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3410921 chr3 190279728 190279981 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413895 chr3 191986294 191986431 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413896 chr3 191986637 191986686 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3413897 chr3 191986741 191987111 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3421208 chr3 195698949 195699070 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3428785 chr3_KI270779v1_alt 69446 69567 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3430738 chr3_KI270895v1_alt 93330 93451 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431033 chr3_KI270924v1_alt 96974 97095 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431329 chr3_KI270934v1_alt 93892 94013 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431605 chr3_KI270935v1_alt 69446 69567 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3431998 chr3_KI270936v1_alt 94604 94725 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3432295 chr3_KI270937v1_alt 96041 96162 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441600 chr4 5026746 5026854 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441601 chr4 5027097 5027327 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441777 chr4 5097493 5097785 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3441779 chr4 5098364 5098516 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3442771 chr4 5605684 5605758 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3442772 chr4 5605998 5606095 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3445026 chr4 6644646 6644822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3450756 chr4 9817730 9818150 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3451833 chr4 10530409 10530688 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3451834 chr4 10530988 10531200 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3456146 chr4 12788083 12788537 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3459001 chr4 14262037 14262491 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3464253 chr4 16926389 16926532 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3464259 chr4 16927041 16927470 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3468876 chr4 19161831 19161940 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3470260 chr4 19954166 19954827 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3474408 chr4 22317258 22317376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3474410 chr4 22317864 22317925 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3475062 chr4 22668619 22669232 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3475065 chr4 22669479 22669758 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3483034 chr4 26465927 26466298 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3483037 chr4 26466870 26467021 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3485072 chr4 27567598 27567738 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3488917 chr4 29902926 29903214 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3494454 chr4 33302127 33302274 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3494455 chr4 33302395 33302739 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512280 chr4 42384575 42384702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512281 chr4 42384770 42385134 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3512285 chr4 42385823 42385987 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3515441 chr4 44346274 44346608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3515442 chr4 44346636 44346905 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516630 chr4 45096625 45096950 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516631 chr4 45097171 45097374 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516819 chr4 45212952 45213393 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3516820 chr4 45213515 45213722 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545697 chr4 64518288 64518439 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545699 chr4 64518572 64518861 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3545700 chr4 64518888 64518989 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3546118 chr4 64785755 64785995 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3546120 chr4 64786368 64786664 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3547700 chr4 65869113 65869323 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3547837 chr4 65948766 65948967 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558886 chr4 72861058 72861132 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558887 chr4 72861183 72861357 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3558888 chr4 72861419 72861585 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560101 chr4 73525487 73525637 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560103 chr4 73526020 73526632 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560634 chr4 73875049 73875492 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560899 chr4 74062241 74062472 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560900 chr4 74062529 74062678 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3560922 chr4 74079797 74080236 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3570575 chr4 79523360 79523492 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3582969 chr4 86624327 86624670 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588386 chr4 89431283 89431499 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588514 chr4 89506518 89506620 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3588517 chr4 89506925 89507034 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600332 chr4 97187801 97188248 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3600334 chr4 97188546 97188653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3613173 chr4 105107050 105107629 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3613174 chr4 105107717 105107873 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3623710 chr4 111481268 111481605 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3623713 chr4 111482095 111482154 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3637166 chr4 119842884 119843141 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3645521 chr4 125024509 125024763 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3645538 chr4 125032525 125032977 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3646270 chr4 125517080 125517357 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3648343 chr4 126881346 126881978 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3648344 chr4 126882001 126882247 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653376 chr4 129748365 129748955 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653911 chr4 130114925 130115029 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3653912 chr4 130115126 130115665 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3662849 chr4 136149150 136149234 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670513 chr4 140613297 140613383 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670516 chr4 140613843 140614024 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3670517 chr4 140614082 140614212 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3675354 chr4 143560926 143561351 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3675356 chr4 143562003 143562150 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3676333 chr4 144145371 144145501 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3676367 chr4 144170154 144170269 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3699961 chr4 158144464 158145030 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3699962 chr4 158145046 158145289 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3704910 chr4 161153018 161153221 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3704911 chr4 161154099 161154181 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3705522 chr4 161549542 161549927 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3710377 chr4 164504390 164504526 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3715321 chr4 167452726 167453253 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3724334 chr4 172980131 172980239 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731383 chr4 177320414 177320466 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3731385 chr4 177320767 177320932 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3743630 chr4 184702488 184702550 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3743632 chr4 184703051 184703388 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3749997 chr4 188298795 188298945 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3762334 chr5 3520984 3521055 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3770787 chr5 9461855 9461945 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3778636 chr5 14295599 14295685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3778637 chr5 14295857 14295957 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3785638 chr5 18324105 18324292 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3785967 chr5 18527093 18527240 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3787073 chr5 19227724 19227902 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3789113 chr5 20518213 20518347 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3797331 chr5 25516757 25517294 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3802898 chr5 29018243 29018474 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3804951 chr5 30276749 30276934 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811675 chr5 33900146 33900380 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811690 chr5 33908308 33908528 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3811695 chr5 33909762 33909966 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3814500 chr5 35429467 35429789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3822844 chr5 40011267 40011459 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829205 chr5 43819652 43819819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829208 chr5 43820146 43820232 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829211 chr5 43820716 43820876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3829537 chr5 44073227 44074002 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3845280 chr5 57695239 57695392 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3845281 chr5 57695434 57696001 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847282 chr5 58964545 58964660 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847283 chr5 58964723 58964796 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3847285 chr5 58965020 58965081 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3852577 chr5 62195092 62195577 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3852589 chr5 62198618 62198789 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3862726 chr5 68098555 68098668 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3862727 chr5 68098686 68099010 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3873300 chr5 73463029 73463213 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890928 chr5 82929898 82929984 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890931 chr5 82930561 82930694 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3890932 chr5 82930895 82931089 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3893302 chr5 84481489 84481606 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3893304 chr5 84481648 84481795 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3894361 chr5 85148784 85149548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3910642 chr5 95850453 95850982 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3910644 chr5 95852650 95852762 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3920718 chr5 102399916 102399964 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3927846 chr5 107058472 107058797 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3928124 chr5 107243974 107244616 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941328 chr5 115569999 115570105 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941332 chr5 115571316 115571805 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941333 chr5 115571871 115572015 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3941468 chr5 115638630 115639453 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3942646 chr5 116368779 116368906 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3942647 chr5 116368903 116369290 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3951022 chr5 121598423 121598566 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3971117 chr5 133713296 133713365 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977363 chr5 137133721 137133946 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977659 chr5 137327815 137328244 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3977660 chr5 137328393 137328490 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993281 chr5 144972627 144972680 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993283 chr5 144973250 144973313 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993287 chr5 144976851 144977016 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993757 chr5 145228239 145228496 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993758 chr5 145228597 145228684 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3993767 chr5 145234908 145235725 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3999067 chr5 147850155 147850578 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER3999877 chr5 148287519 148287632 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4005760 chr5 150831588 150831788 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4005786 chr5 150850982 150851158 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4015964 chr5 155598976 155599318 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4015965 chr5 155599396 155599716 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4016958 chr5 156117816 156118163 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4016959 chr5 156118339 156118447 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4017515 chr5 156419174 156419810 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4017897 chr5 156626809 156626953 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4021177 chr5 158046023 158046184 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4026734 chr5 160750223 160750366 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4028702 chr5 161914543 161914776 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4028922 chr5 162040096 162040537 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4030168 chr5 162792618 162792795 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031192 chr5 163385920 163386069 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031193 chr5 163386232 163386759 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031517 chr5 163548414 163548555 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031519 chr5 163548711 163548824 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031899 chr5 163737885 163738055 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4031900 chr5 163738446 163738498 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4034167 chr5 165173646 165174445 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4034169 chr5 165174475 165174504 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4035974 chr5 166246019 166246636 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4042513 chr5 169673913 169673968 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4042514 chr5 169673978 169674185 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4056040 chr5 175579902 175580041 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4057012 chr5 175957841 175958034 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4057013 chr5 175958113 175958358 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4061464 chr5 177885440 177885685 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4061465 chr5 177885765 177885958 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074088 chr5_KI270794v1_alt 101468 101702 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074102 chr5_KI270794v1_alt 109630 109850 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074107 chr5_KI270794v1_alt 111084 111288 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074259 chr5_KI270795v1_alt 19976 20221 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4074260 chr5_KI270795v1_alt 20301 20494 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4077213 chr5_KI270898v1_alt 19976 20221 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4077214 chr5_KI270898v1_alt 20301 20494 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087818 chr6 6088810 6088881 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087824 chr6 6089935 6090242 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4087825 chr6 6090308 6090482 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4093646 chr6 9331091 9331685 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124824 chr6 25870188 25870316 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4124825 chr6 25870580 25870999 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4135307 chr6 31114273 31114350 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4140026 chr6 33545638 33545815 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4171406 chr6 48574233 48574337 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4185091 chr6 56998288 56998438 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4196464 chr6 66421558 66421719 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4196465 chr6 66421786 66421867 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4212874 chr6 76653710 76653757 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4213913 chr6 77369899 77370093 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4213914 chr6 77370325 77370443 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217790 chr6 79864177 79864387 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217793 chr6 79865551 79865762 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217794 chr6 79865841 79866067 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217820 chr6 79877560 79877781 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4217839 chr6 79888284 79888521 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218269 chr6 80145103 80145201 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218270 chr6 80145209 80145367 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218272 chr6 80145570 80145807 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4218273 chr6 80145846 80146027 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4220050 chr6 81367410 81367494 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4220053 chr6 81368134 81368324 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4221142 chr6 82054658 82055008 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4221143 chr6 82055040 82055258 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4227272 chr6 85801403 85801667 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4231579 chr6 88456915 88457074 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4231580 chr6 88457101 88457391 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4239383 chr6 93069928 93070781 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4241186 chr6 94285979 94286034 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4241189 chr6 94287515 94287717 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4242389 chr6 95152390 95152459 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4254460 chr6 102927137 102927578 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4270752 chr6 111499247 111499435 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4295588 chr6 127013812 127013971 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4299708 chr6 129675614 129676069 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4299709 chr6 129676233 129676368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4300822 chr6 130282211 130282307 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310158 chr6 135557671 135557739 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310159 chr6 135557886 135558447 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310620 chr6 135840241 135840371 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4310621 chr6 135840427 135840648 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4311485 chr6 136348035 136348835 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4312970 chr6 137127404 137127548 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319013 chr6 140459953 140460005 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319014 chr6 140460147 140460339 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4319016 chr6 140460787 140461040 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4332532 chr6 148556818 148557292 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4335234 chr6 149882955 149883027 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4402499 chr6_GL000254v2_alt 2458390 2458467 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4442896 chr7 8527254 8527646 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4445616 chr7 10321506 10321736 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4445617 chr7 10321897 10322065 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4448000 chr7 11933332 11933386 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4448004 chr7 11934715 11934912 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456479 chr7 17403160 17403349 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456482 chr7 17404121 17404370 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4456487 chr7 17405801 17405886 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4461861 chr7 20893996 20894103 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4461863 chr7 20894596 20894725 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4482981 chr7 32512042 32512161 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4486775 chr7 34643584 34644278 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494224 chr7 38920964 38921126 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494226 chr7 38921443 38921728 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4494227 chr7 38921884 38921960 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4502406 chr7 43433494 43434122 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4502407 chr7 43434156 43434199 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4507499 chr7 46027725 46027907 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4513504 chr7 49752922 49753047 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4513505 chr7 49753265 49753325 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4525338 chr7 56748864 56748987 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4530469 chr7 63826753 63826876 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4535701 chr7 66224061 66224641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539653 chr7 67695636 67695752 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539656 chr7 67696232 67696358 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4539657 chr7 67696392 67696514 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4540358 chr7 67955105 67955299 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4567146 chr7 78905645 78905849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4569356 chr7 80270371 80270550 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4578070 chr7 85981239 85981409 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4578071 chr7 85981600 85981685 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4591880 chr7 94579575 94579665 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609825 chr7 102965573 102965970 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609826 chr7 102966150 102966205 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4609828 chr7 102966393 102966565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4610755 chr7 103466053 103466239 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4626566 chr7 112553763 112553980 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4650478 chr7 127443606 127443827 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4679756 chr7 142108448 142109369 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4679758 chr7 142109434 142109484 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4683387 chr7 144450806 144451108 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4683389 chr7 144451755 144451850 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4687662 chr7 147081248 147081414 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4687666 chr7 147081753 147082401 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4688354 chr7 147524918 147525063 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4692741 chr7 149667213 149667368 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693191 chr7 149942645 149943078 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693193 chr7 149943280 149943444 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4693195 chr7 149943726 149943849 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4699755 chr7 153301101 153301280 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700847 chr7 153922852 153923107 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4700848 chr7 153923213 153923391 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701167 chr7 154153065 154153188 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701169 chr7 154153487 154153580 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4701171 chr7 154153986 154154289 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4709154 chr7_KI270803v1_alt 70328 71249 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4709156 chr7_KI270803v1_alt 71314 71364 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4716581 chr8 3126582 3126703 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4719376 chr8 5133016 5133093 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4719381 chr8 5133942 5134019 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4720174 chr8 5606048 5606243 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4722316 chr8 6844563 6844684 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4739331 chr8 16685622 16685819 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4739333 chr8 16686434 16686910 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4741947 chr8 18178633 18178814 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4745964 chr8 20318928 20319435 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4753969 chr8 24329476 24329538 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4771630 chr8 33240971 33241141 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4771633 chr8 33241696 33241831 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4817222 chr8 61960498 61960705 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4817225 chr8 61961119 61961338 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4818072 chr8 62547335 62547376 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4818073 chr8 62547501 62547810 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4820369 chr8 63952236 63952757 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4822241 chr8 65183321 65183567 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4822242 chr8 65183641 65183729 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4841512 chr8 75774662 75774833 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4847161 chr8 79525885 79526185 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4847162 chr8 79526444 79526633 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4855602 chr8 84425686 84425783 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4855604 chr8 84425825 84426051 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4864638 chr8 89967661 89967935 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4864642 chr8 89968980 89969057 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4870182 chr8 93429628 93430294 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4874648 chr8 95583537 95583895 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4886772 chr8 101731554 101731679 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4886773 chr8 101731739 101732385 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4890202 chr8 103340280 103340672 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4890205 chr8 103341241 103341449 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4897325 chr8 107562724 107563217 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4897326 chr8 107563311 107563530 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4901706 chr8 110192571 110192868 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4902987 chr8 110942583 110942750 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4905632 chr8 112605890 112605959 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4905637 chr8 112610353 112610810 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4906160 chr8 112924451 112924565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909376 chr8 114962407 114962553 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909378 chr8 114962768 114962998 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4909379 chr8 114963061 114963105 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4911623 chr8 116368361 116368780 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4917229 chr8 119386412 119386850 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4917463 chr8 119513869 119514530 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4918543 chr8 120005205 120005848 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4920341 chr8 120940493 120940624 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4920342 chr8 120940880 120941265 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4926399 chr8 123825623 123826184 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930475 chr8 125654578 125654920 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930599 chr8 125704269 125704329 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930601 chr8 125704744 125704928 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930608 chr8 125706725 125707142 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930773 chr8 125775231 125775612 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4930775 chr8 125775762 125776256 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4937597 chr8 128942990 128943847 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941617 chr8 130767460 130768168 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941962 chr8 130926099 130926152 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941964 chr8 130926224 130926385 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4941973 chr8 130932856 130933056 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4942995 chr8 131463727 131463874 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943446 chr8 131699442 131700097 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943724 chr8 131840472 131840690 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943725 chr8 131840709 131840957 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943729 chr8 131843385 131843508 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4943731 chr8 131844058 131844178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4944244 chr8 132133993 132134105 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4945305 chr8 132596963 132597167 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4952382 chr8 136071227 136071608 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954220 chr8 137028520 137028724 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954221 chr8 137028758 137028923 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4954223 chr8 137029338 137029383 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4963369 chr8 142021005 142021176 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4993112 chr9 10405038 10405174 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4993113 chr9 10405291 10405468 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER4995370 chr9 11883008 11883178 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004127 chr9 17129789 17130072 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004778 chr9 17538184 17538349 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004780 chr9 17538684 17538768 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004784 chr9 17539462 17539504 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5004786 chr9 17545587 17545822 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5013966 chr9 22948374 22948641 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5013967 chr9 22948707 22948855 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5014223 chr9 23127128 23127331 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5015859 chr9 24182571 24182723 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5015860 chr9 24182855 24183048 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5026987 chr9 31210570 31210982 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5029945 chr9 32969306 32969398 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5029946 chr9 32969546 32969650 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5042947 chr9 38876342 38876514 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5042948 chr9 38876609 38876747 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5052262 chr9 62100772 62100944 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5052263 chr9 62101039 62101262 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5059474 chr9 67487210 67487348 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5059475 chr9 67487443 67487615 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064180 chr9 70253359 70253453 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064181 chr9 70253533 70253570 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5064183 chr9 70253929 70254101 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5069119 chr9 72675480 72676426 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5070859 chr9 73770932 73771153 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5070860 chr9 73771359 73771414 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5087650 chr9 83242641 83242913 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5087651 chr9 83243518 83243694 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5091849 chr9 85365638 85365791 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5091850 chr9 85365824 85365939 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5095018 chr9 86953975 86954108 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5111383 chr9 95856392 95856739 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5119719 chr9 99630461 99631311 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5121417 chr9 100457542 100457684 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5123759 chr9 101751047 101751431 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5133635 chr9 107230951 107231709 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5141166 chr9 110756660 110756859 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5160579 chr9 119586733 119586786 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5160582 chr9 119588047 119588306 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5162155 chr9 120262162 120262377 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5162160 chr9 120263148 120263470 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5167142 chr9 122403735 122403835 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5177398 chr9 127056098 127056362 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5178133 chr9 127419475 127419933 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5192842 chr9 133561585 133561755 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5222397 chrX 7020531 7021036 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5222398 chrX 7021050 7021386 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5251697 chrX 22523964 22524070 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5253871 chrX 23754273 23754641 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5253874 chrX 23754854 23755255 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5257132 chrX 25138103 25138297 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5257133 chrX 25138469 25138553 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5261042 chrX 27435913 27435968 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5275629 chrX 36084509 36084653 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5278113 chrX 37827808 37828012 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289566 chrX 43386134 43386321 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289568 chrX 43386895 43386983 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5289661 chrX 43438701 43439328 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5291239 chrX 44325175 44325583 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5291248 chrX 44327152 44327351 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5293412 chrX 45127615 45128059 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5337323 chrX 73436161 73436205 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5358471 chrX 88431580 88431631 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5399553 chrX 113288463 113288506 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5502700 chrY 15322727 15323124 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5502701 chrY 15323233 15323445 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5544326 chr16_KV880768v1_fix 493494 494025 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5546386 chr16_KV880768v1_fix 1309686 1310216 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5547595 chr16_KV880768v1_fix 1777222 1777753 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5564749 chr1_KV880763v1_alt 543108 543709 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5564750 chr1_KV880763v1_alt 543779 543944 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571169 chr2_KZ208907v1_alt 166051 166253 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571170 chr2_KZ208907v1_alt 166403 166490 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571557 chr2_KZ208908v1_alt 131950 132083 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571560 chr2_KZ208908v1_alt 132669 132890 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5571999 chr3_KN196475v1_fix 204305 204783 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5572003 chr3_KN196475v1_fix 208167 208424 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5576030 chr4_KQ090014v1_alt 72238 72439 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5585988 chr7_KZ208913v1_alt 500263 500565 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5585990 chr7_KZ208913v1_alt 501212 501307 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5587791 chr8_KZ208915v1_fix 239859 239939 0 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5606351 chr3_KZ559102v1_alt 188545 188940 1 LTR MamRep1527|LTR|LTR-HOMER5606353 chr3_KZ559102v1_alt 189554 189955 1 LTR