THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER77872 chr1 34061370 34061452 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER113954 chr1 49841677 49841819 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER114689 chr1 50237587 50237834 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER162230 chr1 72687825 72688140 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER214254 chr1 102550420 102551018 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER214255 chr1 102551017 102551298 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER214258 chr1 102552706 102553188 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER233715 chr1 113720599 113720929 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER248759 chr1 143489155 143489371 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER250320 chr1 144314804 144315020 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER250953 chr1 144651362 144651578 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER333109 chr1 188498381 188499270 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER333111 chr1 188499642 188500000 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER333354 chr1 188665007 188665299 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER342931 chr1 194642412 194643239 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER342932 chr1 194643227 194643295 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER344893 chr1 195877811 195879379 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER438855 chr1 245904065 245904093 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER441134 chr1 247046857 247047395 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER441135 chr1 247047396 247047560 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER474663 chr10 17266286 17266497 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER474665 chr10 17266727 17266776 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER538070 chr10 55291110 55291202 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER542429 chr10 58059591 58059644 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER564094 chr10 69541248 69541356 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER567418 chr10 71105047 71105214 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER567419 chr10 71105219 71105254 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER749909 chr11 35771014 35771449 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER749911 chr11 35771746 35772919 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER763410 chr11 43475254 43475367 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER870162 chr11 102432082 102433664 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER883646 chr11 109949717 109950240 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER912431 chr11 124684559 124686080 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER952567 chr12 9644004 9644195 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1029313 chr12 55517932 55518325 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1032538 chr12 56942679 56943739 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1036471 chr12 59174280 59174403 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1036473 chr12 59174700 59174711 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1037912 chr12 60116721 60117155 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1065246 chr12 75433084 75433388 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1078317 chr12 83000001 83000141 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1078319 chr12 83000434 83001355 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1078321 chr12 83001666 83001863 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1090194 chr12 90281072 90282614 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1191555 chr13 18322041 18322257 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1227590 chr13 38151843 38151960 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1267399 chr13 60740155 60740743 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1267402 chr13 60744134 60744395 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1303608 chr13 83337717 83337905 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1305106 chr13 84310874 84311065 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1311968 chr13 88724417 88724515 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1361407 chr14 22197842 22199398 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1364065 chr14 23609825 23609922 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1370604 chr14 27805913 27805996 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1468945 chr14 81211567 81211659 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1477449 chr14 86272201 86272841 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1484346 chr14 90012290 90012590 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1507230 chr14 100916390 100916443 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1509302 chr14 102111491 102111566 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1516884 chr14 106167662 106168301 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1521162 chr14_KI270846v1_alt 635431 636070 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1545531 chr15 31425893 31426255 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1549229 chr15 33626180 33627106 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1665946 chr15 92529904 92530284 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1693769 chr15_KI270905v1_alt 3711738 3712100 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1715162 chr16 9033053 9033535 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1774831 chr16 31958508 31959124 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1776174 chr16 32900054 32900670 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1777846 chr16 33959021 33959637 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1872093 chr16_KI270728v1_random 1164083 1164699 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1901853 chr17 8922304 8922334 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1937401 chr17 29886766 29886880 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER1989593 chr17 52918576 52918776 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2034776 chr17 74490266 74490494 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2218933 chr19 6581769 6582033 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2218935 chr19 6582336 6582355 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2218937 chr19 6582810 6583003 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2370069 chr1_KI270765v1_alt 161874 162090 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2401570 chr2 17991326 17991524 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2401792 chr2 18118475 18118634 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2466660 chr2 52470050 52471572 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2508924 chr2 75153492 75153535 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2534162 chr2 89650236 89650452 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2535684 chr2 91724408 91724624 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2586081 chr2 122436865 122437035 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2586501 chr2 122684786 122686336 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2592291 chr2 126150531 126152054 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2600280 chr2 130446713 130446946 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2600658 chr2 130674579 130674812 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2601870 chr2 131281228 131281461 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2610577 chr2 136269674 136269881 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2649950 chr2 160807871 160807915 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2659068 chr2 166618011 166618747 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2683901 chr2 180964773 180965523 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2691615 chr2 185991319 185991503 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2694033 chr2 187492537 187492944 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2696826 chr2 189332783 189332879 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2731466 chr2 208472280 208472410 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2766822 chr2 228395016 228395156 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2812889 chr20 10126214 10126353 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2827357 chr20 18178130 18178356 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2834247 chr20 22137950 22138095 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2928458 chr21 13893287 13893434 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2928460 chr21 13893742 13893985 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER2944800 chr21 23987190 23987465 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3097909 chr3 12110221 12110761 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3203374 chr3 67785424 67785979 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3226068 chr3 80558703 80558921 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3230436 chr3 83357633 83358118 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3238177 chr3 88474289 88474485 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3238283 chr3 88542690 88542733 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3254220 chr3 102125560 102125731 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3255635 chr3 102992922 102993018 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3333997 chr3 146993036 146993248 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3366519 chr3 166327319 166328568 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3409016 chr3 189242819 189242864 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3428298 chr3_KI270778v1_alt 26536 27785 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3467113 chr4 18230111 18230280 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3500118 chr4 36827028 36827228 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3544404 chr4 63629202 63629267 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3551681 chr4 68291655 68292159 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3552524 chr4 68844480 68845694 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3552983 chr4 69155855 69156130 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3554016 chr4 69883081 69883112 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3556968 chr4 71623069 71623376 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3556970 chr4 71623673 71624946 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3558573 chr4 72642066 72642176 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3570965 chr4 79787978 79788183 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3572774 chr4 81011589 81013163 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3574774 chr4 82216912 82217343 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3607445 chr4 101481597 101481770 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3615850 chr4 106821227 106821600 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3615852 chr4 106822896 106824150 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3723970 chr4 172734420 172734758 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3727563 chr4 175002468 175003047 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3753855 chr4_GL000257v2_alt 420499 421713 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3785699 chr5 18366492 18366693 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3794509 chr5 23750383 23751378 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3797819 chr5 25803561 25804114 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3798992 chr5 26541961 26542103 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3813331 chr5 34767880 34768186 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3813332 chr5 34768185 34768264 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3817870 chr5 37283581 37283830 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3829411 chr5 43983851 43984357 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3831146 chr5 45107935 45108004 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3913392 chr5 97569543 97571027 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3924478 chr5 104870739 104870780 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3930046 chr5 108532125 108533344 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3940294 chr5 114954386 114955978 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3941908 chr5 115891593 115891969 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER3954456 chr5 123731802 123733375 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4173379 chr6 49808377 49808563 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4199717 chr6 68590012 68591587 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4225160 chr6 84488943 84490422 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4242209 chr6 94991295 94991451 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4245020 chr6 96861011 96861139 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4277511 chr6 115585938 115586201 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4297017 chr6 127911691 127912358 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4320593 chr6 141432632 141432726 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4323606 chr6 143301411 143301445 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4360408 chr6 164278722 164280269 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4424353 chr6_KI270801v1_alt 256889 257556 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4447943 chr7 11887495 11887908 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4453221 chr7 15340456 15341116 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4459348 chr7 19273173 19273973 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4478387 chr7 29999836 30000000 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4480489 chr7 31154291 31154399 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4502910 chr7 43716136 43717703 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4567546 chr7 79180623 79182191 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4568186 chr7 79574916 79575080 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4635886 chr7 118341366 118341392 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4643945 chr7 123417387 123417451 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4741825 chr8 18109298 18109792 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4828698 chr8 68477404 68477646 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4930843 chr8 125815375 125815515 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4937865 chr8 129075583 129075932 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4954438 chr8 137153986 137155030 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4973580 chr8_KI270822v1_alt 146552 148077 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4981890 chr9 3870798 3872378 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER4986359 chr9 6370708 6371401 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5015567 chr9 24008172 24008437 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5026027 chr9 30558319 30558595 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5026029 chr9 30559484 30559972 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5026652 chr9 30962944 30963601 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5042318 chr9 38546724 38546965 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5045456 chr9 40318053 40318296 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5049651 chr9 42943098 42943341 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5055201 chr9 64458081 64458324 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5096732 chr9 87926535 87926764 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5096738 chr9 87929145 87929281 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5096740 chr9 87929585 87929806 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5097182 chr9 88123159 88123380 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5151938 chr9 115566240 115566747 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5151940 chr9 115567049 115568260 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5274299 chrX 35284978 35286527 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5274797 chrX 35583010 35583219 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5274799 chrX 35583249 35583783 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5317470 chrX 57447112 57448008 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5324619 chrX 67000001 67000680 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5324901 chrX 67181604 67182001 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5347205 chrX 80411821 80412770 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5353360 chrX 84844557 84845629 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5353410 chrX 84883351 84884395 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5357768 chrX 87977862 87977904 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5363563 chrX 91857373 91858989 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5375091 chrX 99174822 99175054 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5415364 chrX 122153015 122154618 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5421774 chrX 125721682 125721729 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5424798 chrX 127837665 127839236 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5444213 chrX 137941675 137942948 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5451775 chrX 142081901 142083433 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5468156 chrX 151442795 151443890 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5475419 chrX 155441336 155441477 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5485595 chrY 3665866 3666205 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5485597 chrY 3666501 3666602 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5487570 chrY 5078790 5080396 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5491400 chrY 7606971 7607319 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5499879 chrY 13530742 13530805 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5512689 chrY 22232247 22232597 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5528703 chr13_KN538372v1_fix 320701 320917 0 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5529037 chr13_KQ090024v1_alt 16434 16625 1 LTR THE1-int|LTR|ERVL-MaLR-HOMER5538038 chr15_KN538374v1_fix 3599286 3599648 1 LTR